RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473263.1

FADS1-208, Transcript of fatty acid desaturase 1, human

TSL 4

Gene FADS1, Length 574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FADS1-208	ENST00000473263	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.41	■■■□□ 2.94
FADS1-208	ENST00000473263	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.4	■■■□□ 2.94
FADS1-208	ENST00000473263	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.39	■■■□□ 2.94
FADS1-208	ENST00000473263	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.37	■■■□□ 2.93
FADS1-208	ENST00000473263	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.36	■■■□□ 2.93
FADS1-208	ENST00000473263	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.36	■■■□□ 2.93
FADS1-208	ENST00000473263	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FADS1-208	ENST00000473263	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.33	■■■□□ 2.93
FADS1-208	ENST00000473263	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
FADS1-208	ENST00000473263	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FADS1-208	ENST00000473263	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.32	■■■□□ 2.92
FADS1-208	ENST00000473263	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.31	■■■□□ 2.92
FADS1-208	ENST00000473263	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.28	■■■□□ 2.92
FADS1-208	ENST00000473263	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.27	■■■□□ 2.92
FADS1-208	ENST00000473263	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
FADS1-208	ENST00000473263	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.26	■■■□□ 2.91
FADS1-208	ENST00000473263	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.25	■■■□□ 2.91
FADS1-208	ENST00000473263	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.24	■■■□□ 2.91
FADS1-208	ENST00000473263	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.23	■■■□□ 2.91
FADS1-208	ENST00000473263	ABCC1	P33527	1531 aa		33.23	■■■□□ 2.91
FADS1-208	ENST00000473263	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.22	■■■□□ 2.91
FADS1-208	ENST00000473263	KDM5C	P41229	1560 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FADS1-208	ENST00000473263	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.21	■■■□□ 2.91
FADS1-208	ENST00000473263	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.19	■■■□□ 2.9
FADS1-208	ENST00000473263	ATP10A	O60312	1499 aa		33.18	■■■□□ 2.9
FADS1-208	ENST00000473263	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.17	■■■□□ 2.9
FADS1-208	ENST00000473263	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FADS1-208	ENST00000473263	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.16	■■■□□ 2.9
FADS1-208	ENST00000473263	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.15	■■■□□ 2.9
FADS1-208	ENST00000473263	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.14	■■■□□ 2.9
FADS1-208	ENST00000473263	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.14	■■■□□ 2.89
FADS1-208	ENST00000473263	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.13	■■■□□ 2.89
FADS1-208	ENST00000473263	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FADS1-208	ENST00000473263	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FADS1-208	ENST00000473263	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.11	■■■□□ 2.89
FADS1-208	ENST00000473263	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FADS1-208	ENST00000473263	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FADS1-208	ENST00000473263	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.09	■■■□□ 2.89
FADS1-208	ENST00000473263	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FADS1-208	ENST00000473263	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.08	■■■□□ 2.89
FADS1-208	ENST00000473263	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.07	■■■□□ 2.89
FADS1-208	ENST00000473263	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.07	■■■□□ 2.88
FADS1-208	ENST00000473263	PTPRM	P28827	1452 aa		33.06	■■■□□ 2.88
FADS1-208	ENST00000473263	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.06	■■■□□ 2.88
FADS1-208	ENST00000473263	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.05	■■■□□ 2.88
FADS1-208	ENST00000473263	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.04	■■■□□ 2.88
FADS1-208	ENST00000473263	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.04	■■■□□ 2.88
FADS1-208	ENST00000473263	MLEC	Q14165	292 aa		33.02	■■■□□ 2.88
FADS1-208	ENST00000473263	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33	■■■□□ 2.87
FADS1-208	ENST00000473263	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
FADS1-208	ENST00000473263	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.99	■■■□□ 2.87
FADS1-208	ENST00000473263	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.98	■■■□□ 2.87
FADS1-208	ENST00000473263	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.97	■■■□□ 2.87
FADS1-208	ENST00000473263	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.92	■■■□□ 2.86
FADS1-208	ENST00000473263	APLP2	Q06481	763 aa		32.92	■■■□□ 2.86
FADS1-208	ENST00000473263	AGL	P35573	1532 aa		32.89	■■■□□ 2.86
FADS1-208	ENST00000473263	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.87	■■■□□ 2.85
FADS1-208	ENST00000473263	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.86	■■■□□ 2.85
FADS1-208	ENST00000473263	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.85	■■■□□ 2.85
FADS1-208	ENST00000473263	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.85	■■■□□ 2.85
FADS1-208	ENST00000473263	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.83	■■■□□ 2.85
FADS1-208	ENST00000473263	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.81	■■■□□ 2.84
FADS1-208	ENST00000473263	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		32.79	■■■□□ 2.84
FADS1-208	ENST00000473263	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.79	■■■□□ 2.84
FADS1-208	ENST00000473263	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.78	■■■□□ 2.84
FADS1-208	ENST00000473263	MIA2	Q96PC5	1412 aa		32.77	■■■□□ 2.84
FADS1-208	ENST00000473263	A2M	P01023	1474 aa		32.77	■■■□□ 2.84
FADS1-208	ENST00000473263	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.73	■■■□□ 2.83
FADS1-208	ENST00000473263	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.73	■■■□□ 2.83
FADS1-208	ENST00000473263	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.73	■■■□□ 2.83
FADS1-208	ENST00000473263	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.7	■■■□□ 2.83
FADS1-208	ENST00000473263	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.7	■■■□□ 2.83
FADS1-208	ENST00000473263	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
FADS1-208	ENST00000473263	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.68	■■■□□ 2.82
FADS1-208	ENST00000473263	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.68	■■■□□ 2.82
FADS1-208	ENST00000473263	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.67	■■■□□ 2.82
FADS1-208	ENST00000473263	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.62	■■■□□ 2.81
FADS1-208	ENST00000473263	GGT6	Q6P531	493 aa		32.61	■■■□□ 2.81
FADS1-208	ENST00000473263	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.58	■■■□□ 2.81
FADS1-208	ENST00000473263	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.57	■■■□□ 2.8
FADS1-208	ENST00000473263	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.56	■■■□□ 2.8
FADS1-208	ENST00000473263	C3	P01024	1663 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FADS1-208	ENST00000473263	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.55	■■■□□ 2.8
FADS1-208	ENST00000473263	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.54	■■■□□ 2.8
FADS1-208	ENST00000473263	KIF3B	O15066	747 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FADS1-208	ENST00000473263	HSPA2	P54652	639 aa		32.53	■■■□□ 2.8
FADS1-208	ENST00000473263	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.53	■■■□□ 2.8
FADS1-208	ENST00000473263	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.52	■■■□□ 2.8
FADS1-208	ENST00000473263	ABCC5	O15440	1437 aa		32.51	■■■□□ 2.79
FADS1-208	ENST00000473263	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.49	■■■□□ 2.79
FADS1-208	ENST00000473263	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
FADS1-208	ENST00000473263	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.46	■■■□□ 2.79
FADS1-208	ENST00000473263	DAPK1	P53355	1430 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FADS1-208	ENST00000473263	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.43	■■■□□ 2.78
FADS1-208	ENST00000473263	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.42	■■■□□ 2.78
FADS1-208	ENST00000473263	NPAT	Q14207	1427 aa		32.41	■■■□□ 2.78
FADS1-208	ENST00000473263	DNMT1	P26358	1616 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
FADS1-208	ENST00000473263	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		32.37	■■■□□ 2.77
FADS1-208	ENST00000473263	PTPRK	Q15262	1439 aa		32.36	■■■□□ 2.77
FADS1-208	ENST00000473263	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.35	■■■□□ 2.77

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