RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470658.1

WDR4-204, Transcript of WD repeat domain 4, humanhuman

TSL 5

Gene WDR4, Length 901 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4-204ENST00000470658 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.01■■■□□ 2.87
WDR4-204ENST00000470658 TIAM1Q13009 1591 aa33■■■□□ 2.87
WDR4-204ENST00000470658 ADGRL1O94910 1474 aa33■■■□□ 2.87
WDR4-204ENST00000470658 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.98■■■□□ 2.87
WDR4-204ENST00000470658 SCAPERQ9BY12 1400 aa32.94■■■□□ 2.86
WDR4-204ENST00000470658 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa32.92■■■□□ 2.86
WDR4-204ENST00000470658 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP32.92■■■□□ 2.86
WDR4-204ENST00000470658 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.91■■■□□ 2.86
WDR4-204ENST00000470658 ABCC1P33527 1531 aa32.87■■■□□ 2.85
WDR4-204ENST00000470658 MAP3K1Q13233 1512 aa32.86■■■□□ 2.85
WDR4-204ENST00000470658 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa32.86■■■□□ 2.85
WDR4-204ENST00000470658 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa32.85■■■□□ 2.85
WDR4-204ENST00000470658 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP32.85■■■□□ 2.85
WDR4-204ENST00000470658 ITSN2Q9NZM3 1697 aa32.84■■■□□ 2.85
WDR4-204ENST00000470658 CCNB3Q8WWL7 1395 aa32.83■■■□□ 2.85
WDR4-204ENST00000470658 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa32.83■■■□□ 2.85
WDR4-204ENST00000470658 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa32.83■■■□□ 2.85
WDR4-204ENST00000470658 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa32.82■■■□□ 2.84
WDR4-204ENST00000470658 NCOA2Q15596 1464 aa32.8■■■□□ 2.84
WDR4-204ENST00000470658 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa32.8■■■□□ 2.84
WDR4-204ENST00000470658 KDM5CP41229 1560 aa32.79■■■□□ 2.84
WDR4-204ENST00000470658 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa32.78■■■□□ 2.84
WDR4-204ENST00000470658 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.77■■■□□ 2.84
WDR4-204ENST00000470658 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.77■■■□□ 2.84
WDR4-204ENST00000470658 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP32.75■■■□□ 2.83
WDR4-204ENST00000470658 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
WDR4-204ENST00000470658 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP32.74■■■□□ 2.83
WDR4-204ENST00000470658 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa32.74■■■□□ 2.83
WDR4-204ENST00000470658 SYCP2Q9BX26 1530 aa32.73■■■□□ 2.83
WDR4-204ENST00000470658 AFAP1Q8N556 730 aa32.73■■■□□ 2.83
WDR4-204ENST00000470658 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP32.73■■■□□ 2.83
WDR4-204ENST00000470658 HECW2Q9P2P5 1572 aa32.7■■■□□ 2.83
WDR4-204ENST00000470658 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.7■■■□□ 2.83
WDR4-204ENST00000470658 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa32.65■■■□□ 2.82
WDR4-204ENST00000470658 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa32.65■■■□□ 2.82
WDR4-204ENST00000470658 MLH3Q9UHC1 1453 aa32.63■■■□□ 2.81
WDR4-204ENST00000470658 BCORL1Q5H9F3 1711 aa32.63■■■□□ 2.81
WDR4-204ENST00000470658 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP32.62■■■□□ 2.81
WDR4-204ENST00000470658 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa32.61■■■□□ 2.81
WDR4-204ENST00000470658 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP32.61■■■□□ 2.812e-7■■■■■ 29.2
WDR4-204ENST00000470658 APLP2Q06481 763 aa32.61■■■□□ 2.81
WDR4-204ENST00000470658 ABCA6Q8N139 1617 aa32.61■■■□□ 2.81
WDR4-204ENST00000470658 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa32.61■■■□□ 2.81
WDR4-204ENST00000470658 ATP10AO60312 1499 aa32.6■■■□□ 2.81
WDR4-204ENST00000470658 ADAMTSL3P82987 1691 aa32.59■■■□□ 2.81
WDR4-204ENST00000470658 C9orf84Q5VXU9 1444 aa32.57■■■□□ 2.8
WDR4-204ENST00000470658 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
WDR4-204ENST00000470658 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa32.56■■■□□ 2.8
WDR4-204ENST00000470658 MBD5Q9P267 1494 aa32.54■■■□□ 2.8
WDR4-204ENST00000470658 MYT1LQ9UL68 1186 aa32.53■■■□□ 2.8
WDR4-204ENST00000470658 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP32.53■■■□□ 2.8
WDR4-204ENST00000470658 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.51■■■□□ 2.8
WDR4-204ENST00000470658 REREQ9P2R6 1566 aa32.51■■■□□ 2.79
WDR4-204ENST00000470658 MADDQ8WXG6 1647 aa32.5■■■□□ 2.79
WDR4-204ENST00000470658 ATP7AQ04656 1500 aa32.49■■■□□ 2.79
WDR4-204ENST00000470658 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP32.48■■■□□ 2.79
WDR4-204ENST00000470658 MIA2Q96PC5 1412 aa32.43■■■□□ 2.78
WDR4-204ENST00000470658 ARHGEF5Q12774 1597 aa32.43■■■□□ 2.78
WDR4-204ENST00000470658 CCDC141Q6ZP82 1450 aa32.42■■■□□ 2.78
WDR4-204ENST00000470658 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.4■■■□□ 2.78
WDR4-204ENST00000470658 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa32.38■■■□□ 2.77
WDR4-204ENST00000470658 AGLP35573 1532 aa32.38■■■□□ 2.77
WDR4-204ENST00000470658 PTPRMP28827 1452 aa32.37■■■□□ 2.77
WDR4-204ENST00000470658 MLECQ14165 292 aa32.37■■■□□ 2.77
WDR4-204ENST00000470658 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.35■■■□□ 2.77
WDR4-204ENST00000470658 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa32.34■■■□□ 2.77
WDR4-204ENST00000470658 ADGBQ8N7X0 1667 aa32.34■■■□□ 2.77
WDR4-204ENST00000470658 PLXNC1O60486 1568 aa32.34■■■□□ 2.77
WDR4-204ENST00000470658 RSPH4AQ5TD94 716 aa32.32■■■□□ 2.76
WDR4-204ENST00000470658 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.32■■■□□ 2.76
WDR4-204ENST00000470658 A2MP01023 1474 aa32.29■■■□□ 2.76
WDR4-204ENST00000470658 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.27■■■□□ 2.76
WDR4-204ENST00000470658 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.26■■■□□ 2.75
WDR4-204ENST00000470658 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.24■■■□□ 2.75
WDR4-204ENST00000470658 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.19■■■□□ 2.74
WDR4-204ENST00000470658 TSPY4P0CV99 314 aa32.19■■■□□ 2.74
WDR4-204ENST00000470658 TSPY10P0CW01 314 aa32.19■■■□□ 2.74
WDR4-204ENST00000470658 ABCC5O15440 1437 aa32.17■■■□□ 2.74
WDR4-204ENST00000470658 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.16■■■□□ 2.74
WDR4-204ENST00000470658 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.15■■■□□ 2.74
WDR4-204ENST00000470658 DAPK1P53355 1430 aa32.14■■■□□ 2.74
WDR4-204ENST00000470658 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.14■■■□□ 2.74
WDR4-204ENST00000470658 PLPPR3Q6T4P5 718 aa32.11■■■□□ 2.73
WDR4-204ENST00000470658 C3P01024 1663 aa32.09■■■□□ 2.73
WDR4-204ENST00000470658 MROH2AA6NES4 1674 aa32.05■■■□□ 2.72
WDR4-204ENST00000470658 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
WDR4-204ENST00000470658 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.05■■■□□ 2.72
WDR4-204ENST00000470658 CNTLNQ9NXG0 1405 aa32.04■■■□□ 2.72
WDR4-204ENST00000470658 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
WDR4-204ENST00000470658 GGT6Q6P531 493 aa32.03■■■□□ 2.72
WDR4-204ENST00000470658 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP32.02■■■□□ 2.72
WDR4-204ENST00000470658 KIF3BO15066 747 aa32.01■■■□□ 2.71
WDR4-204ENST00000470658 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
WDR4-204ENST00000470658 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32■■■□□ 2.71
WDR4-204ENST00000470658 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.98■■■□□ 2.71
WDR4-204ENST00000470658 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP31.98■■■□□ 2.71
WDR4-204ENST00000470658 KIF15Q9NS87 1388 aa31.97■■■□□ 2.71
WDR4-204ENST00000470658 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.95■■■□□ 2.7
WDR4-204ENST00000470658 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.94■■■□□ 2.7
WDR4-204ENST00000470658 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.93■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms