RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470658.1

WDR4-204, Transcript of WD repeat domain 4, humanhuman

TSL 5

Gene WDR4, Length 901 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR4-204ENST00000470658 NISCHQ9Y2I1 1504 aa50.71■■■■■ 5.71
WDR4-204ENST00000470658 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa45.15■■■■■ 4.82
WDR4-204ENST00000470658 ABCC9O60706 1549 aa44.21■■■■■ 4.67
WDR4-204ENST00000470658 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa42.48■■■■■ 4.39
WDR4-204ENST00000470658 NACADO15069 1562 aa42.42■■■■■ 4.38
WDR4-204ENST00000470658 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.29■■■■■ 4.36
WDR4-204ENST00000470658 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
WDR4-204ENST00000470658 MYO15BQ96JP2 1530 aa42.13■■■■■ 4.33
WDR4-204ENST00000470658 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.94■■■■■ 4.3
WDR4-204ENST00000470658 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.66■■■■■ 4.26
WDR4-204ENST00000470658 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.28■■■■■ 4.2
WDR4-204ENST00000470658 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP41.26■■■■■ 4.2
WDR4-204ENST00000470658 SCRIBQ14160 1630 aa41.2■■■■■ 4.19
WDR4-204ENST00000470658 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa40.74■■■■■ 4.11
WDR4-204ENST00000470658 DNAJC5BQ9UF47 199 aa40.64■■■■■ 4.1
WDR4-204ENST00000470658 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
WDR4-204ENST00000470658 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.02■■■■■ 4
WDR4-204ENST00000470658 CECR2Q9BXF3 1484 aa39.71■■■■□ 3.95
WDR4-204ENST00000470658 SMARCA4P51532 1647 aa39.4■■■■□ 3.9
WDR4-204ENST00000470658 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP39.29■■■■□ 3.88
WDR4-204ENST00000470658 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.16■■■■□ 3.86
WDR4-204ENST00000470658 NCAPD3P42695 1498 aa39.12■■■■□ 3.85
WDR4-204ENST00000470658 SMARCA2P51531 1590 aa39.1■■■■□ 3.85
WDR4-204ENST00000470658 MROH2BQ7Z745 1585 aa39.1■■■■□ 3.85
WDR4-204ENST00000470658 PEG3Q9GZU2 1588 aa39■■■■□ 3.83
WDR4-204ENST00000470658 HMGXB3Q12766 1538 aa38.97■■■■□ 3.83
WDR4-204ENST00000470658 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.83■■■■□ 3.81
WDR4-204ENST00000470658 WIZO95785 1651 aa38.71■■■■□ 3.79
WDR4-204ENST00000470658 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP38.6■■■■□ 3.77
WDR4-204ENST00000470658 NESP48681 1621 aa38.27■■■■□ 3.72
WDR4-204ENST00000470658 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
WDR4-204ENST00000470658 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.14■■■■□ 3.7
WDR4-204ENST00000470658 ERCC6Q03468 1493 aa38.07■■■■□ 3.68
WDR4-204ENST00000470658 CADPSQ9ULU8 1353 aa37.96■■■■□ 3.67
WDR4-204ENST00000470658 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa37.87■■■■□ 3.65
WDR4-204ENST00000470658 PDS5BQ9NTI5 1447 aa37.81■■■■□ 3.64
WDR4-204ENST00000470658 CCDC88BA6NC98 1476 aa37.78■■■■□ 3.64
WDR4-204ENST00000470658 CFTRP13569 1480 aa37.76■■■■□ 3.63
WDR4-204ENST00000470658 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
WDR4-204ENST00000470658 CUX2O14529 1486 aa37.71■■■■□ 3.63
WDR4-204ENST00000470658 PRDM2Q13029 1718 aa37.57■■■■□ 3.6
WDR4-204ENST00000470658 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.56■■■■□ 3.6
WDR4-204ENST00000470658 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.52■■■■□ 3.6
WDR4-204ENST00000470658 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
WDR4-204ENST00000470658 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.49■■■■□ 3.59
WDR4-204ENST00000470658 WDR62O43379 1518 aa37.4■■■■□ 3.58
WDR4-204ENST00000470658 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.23■■■■□ 3.55
WDR4-204ENST00000470658 TOPBP1Q92547 1522 aa36.97■■■■□ 3.51
WDR4-204ENST00000470658 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.93■■■■□ 3.5
WDR4-204ENST00000470658 ABCC8Q09428 1581 aa36.9■■■■□ 3.5
WDR4-204ENST00000470658 IFT140Q96RY7 1462 aa36.72■■■■□ 3.47
WDR4-204ENST00000470658 CUX1P39880 1505 aa36.69■■■■□ 3.46
WDR4-204ENST00000470658 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.65■■■■□ 3.46
WDR4-204ENST00000470658 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.61■■■■□ 3.45
WDR4-204ENST00000470658 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.61■■■■□ 3.45
WDR4-204ENST00000470658 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.59■■■■□ 3.45
WDR4-204ENST00000470658 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.56■■■■□ 3.44
WDR4-204ENST00000470658 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.5■■■■□ 3.43
WDR4-204ENST00000470658 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
WDR4-204ENST00000470658 SOGA1O94964 1423 aa36.45■■■■□ 3.43
WDR4-204ENST00000470658 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP36.38■■■■□ 3.41
WDR4-204ENST00000470658 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa36.37■■■■□ 3.41
WDR4-204ENST00000470658 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.37■■■■□ 3.412e-7■■■■□ 24.7
WDR4-204ENST00000470658 SYNJ1O43426 1573 aa36.36■■■■□ 3.41
WDR4-204ENST00000470658 TOP2BQ02880 1626 aa36.35■■■■□ 3.41
WDR4-204ENST00000470658 WDR97A6NE52 1622 aa36.34■■■■□ 3.41
WDR4-204ENST00000470658 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
WDR4-204ENST00000470658 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa36.18■■■■□ 3.38
WDR4-204ENST00000470658 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa36.1■■■■□ 3.37
WDR4-204ENST00000470658 CHD1O14646 1710 aa36.08■■■■□ 3.37
WDR4-204ENST00000470658 PBRM1Q86U86 1689 aa36.07■■■■□ 3.37
WDR4-204ENST00000470658 OSCARQ8IYS5 282 aa36.07■■■■□ 3.36
WDR4-204ENST00000470658 GAPVD1Q14C86 1478 aa36.05■■■■□ 3.36
WDR4-204ENST00000470658 GRIN2BQ13224 1484 aa36.05■■■■□ 3.36
WDR4-204ENST00000470658 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.05■■■■□ 3.36
WDR4-204ENST00000470658 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP35.97■■■■□ 3.35
WDR4-204ENST00000470658 FBLN2P98095 1184 aa35.87■■■■□ 3.33
WDR4-204ENST00000470658 SYNJ2O15056 1496 aa35.84■■■■□ 3.33
WDR4-204ENST00000470658 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP35.76■■■■□ 3.32
WDR4-204ENST00000470658 ADAMTS12P58397 1594 aa35.76■■■■□ 3.31
WDR4-204ENST00000470658 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.75■■■■□ 3.31
WDR4-204ENST00000470658 CLASP1Q7Z460 1538 aa35.64■■■■□ 3.3
WDR4-204ENST00000470658 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.63■■■■□ 3.29
WDR4-204ENST00000470658 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.63■■■■□ 3.29
WDR4-204ENST00000470658 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.63■■■■□ 3.29
WDR4-204ENST00000470658 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.62■■■■□ 3.29
WDR4-204ENST00000470658 GRIN2AQ12879 1464 aa35.61■■■■□ 3.29
WDR4-204ENST00000470658 KIF27Q86VH2 1401 aa35.59■■■■□ 3.29
WDR4-204ENST00000470658 ARHGEF11O15085 1522 aa35.58■■■■□ 3.29
WDR4-204ENST00000470658 CEP170Q5SW79 1584 aa35.48■■■■□ 3.27
WDR4-204ENST00000470658 IGF1RP08069 1367 aa35.47■■■■□ 3.27
WDR4-204ENST00000470658 NUP160Q12769 1436 aa35.46■■■■□ 3.27
WDR4-204ENST00000470658 CUL7Q14999 1698 aa35.43■■■■□ 3.26
WDR4-204ENST00000470658 TRIM41Q8WV44 630 aa35.4■■■■□ 3.26
WDR4-204ENST00000470658 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa35.33■■■■□ 3.25
WDR4-204ENST00000470658 ARAP1Q96P48 1450 aa35.31■■■■□ 3.24
WDR4-204ENST00000470658 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa35.25■■■■□ 3.23
WDR4-204ENST00000470658 SHROOM2Q13796 1616 aa35.24■■■■□ 3.23
WDR4-204ENST00000470658 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.18■■■■□ 3.22
WDR4-204ENST00000470658 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.17■■■■□ 3.22
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