RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470596.5

PRKCZ-210, Transcript of protein kinase C zeta, human

TSL 2

Gene PRKCZ, Length 788 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKCZ-210	ENST00000470596	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		33.72	■■■□□ 2.99
PRKCZ-210	ENST00000470596	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		33.7	■■■□□ 2.99
PRKCZ-210	ENST00000470596	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		33.69	■■■□□ 2.98
PRKCZ-210	ENST00000470596	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PRKCZ-210	ENST00000470596	ADAMTSL3	P82987	1691 aa		33.67	■■■□□ 2.98
PRKCZ-210	ENST00000470596	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		33.65	■■■□□ 2.98
PRKCZ-210	ENST00000470596	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PRKCZ-210	ENST00000470596	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		33.64	■■■□□ 2.98
PRKCZ-210	ENST00000470596	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		33.63	■■■□□ 2.97
PRKCZ-210	ENST00000470596	PREX2	Q70Z35	1606 aa		33.62	■■■□□ 2.97
PRKCZ-210	ENST00000470596	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		33.61	■■■□□ 2.97
PRKCZ-210	ENST00000470596	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		33.6	■■■□□ 2.97
PRKCZ-210	ENST00000470596	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		33.56	■■■□□ 2.96
PRKCZ-210	ENST00000470596	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PRKCZ-210	ENST00000470596	PTPRM	P28827	1452 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PRKCZ-210	ENST00000470596	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		33.55	■■■□□ 2.96
PRKCZ-210	ENST00000470596	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		33.54	■■■□□ 2.96
PRKCZ-210	ENST00000470596	MADD	Q8WXG6	1647 aa		33.53	■■■□□ 2.96
PRKCZ-210	ENST00000470596	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
PRKCZ-210	ENST00000470596	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
PRKCZ-210	ENST00000470596	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		33.51	■■■□□ 2.95
PRKCZ-210	ENST00000470596	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PRKCZ-210	ENST00000470596	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		33.5	■■■□□ 2.95
PRKCZ-210	ENST00000470596	ABCC1	P33527	1531 aa		33.48	■■■□□ 2.95
PRKCZ-210	ENST00000470596	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PRKCZ-210	ENST00000470596	KDM5C	P41229	1560 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PRKCZ-210	ENST00000470596	AFAP1	Q8N556	730 aa		33.47	■■■□□ 2.95
PRKCZ-210	ENST00000470596	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	33.43	■■■□□ 2.94
PRKCZ-210	ENST00000470596	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		33.43	■■■□□ 2.94
PRKCZ-210	ENST00000470596	ATP10A	O60312	1499 aa		33.42	■■■□□ 2.94
PRKCZ-210	ENST00000470596	TIAM1	Q13009	1591 aa		33.41	■■■□□ 2.94
PRKCZ-210	ENST00000470596	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	33.4	■■■□□ 2.94
PRKCZ-210	ENST00000470596	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		33.4	■■■□□ 2.94
PRKCZ-210	ENST00000470596	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	33.4	■■■□□ 2.94
PRKCZ-210	ENST00000470596	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PRKCZ-210	ENST00000470596	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		33.39	■■■□□ 2.94
PRKCZ-210	ENST00000470596	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		33.38	■■■□□ 2.93
PRKCZ-210	ENST00000470596	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PRKCZ-210	ENST00000470596	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		33.37	■■■□□ 2.93
PRKCZ-210	ENST00000470596	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PRKCZ-210	ENST00000470596	MAP3K1	Q13233	1512 aa		33.36	■■■□□ 2.93
PRKCZ-210	ENST00000470596	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		33.34	■■■□□ 2.93
PRKCZ-210	ENST00000470596	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	33.33	■■■□□ 2.93
PRKCZ-210	ENST00000470596	NCOA2	Q15596	1464 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PRKCZ-210	ENST00000470596	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		33.3	■■■□□ 2.92
PRKCZ-210	ENST00000470596	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		33.29	■■■□□ 2.92
PRKCZ-210	ENST00000470596	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	33.29	■■■□□ 2.92	2e-7	■■■■■ 30.7
PRKCZ-210	ENST00000470596	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	33.27	■■■□□ 2.92
PRKCZ-210	ENST00000470596	RERE	Q9P2R6	1566 aa		33.26	■■■□□ 2.92
PRKCZ-210	ENST00000470596	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		33.26	■■■□□ 2.92
PRKCZ-210	ENST00000470596	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		33.25	■■■□□ 2.91
PRKCZ-210	ENST00000470596	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		33.24	■■■□□ 2.91
PRKCZ-210	ENST00000470596	MLEC	Q14165	292 aa		33.23	■■■□□ 2.91
PRKCZ-210	ENST00000470596	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PRKCZ-210	ENST00000470596	ABCA6	Q8N139	1617 aa		33.22	■■■□□ 2.91
PRKCZ-210	ENST00000470596	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	33.22	■■■□□ 2.91
PRKCZ-210	ENST00000470596	APLP2	Q06481	763 aa		33.19	■■■□□ 2.9
PRKCZ-210	ENST00000470596	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	33.19	■■■□□ 2.9
PRKCZ-210	ENST00000470596	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	33.17	■■■□□ 2.9
PRKCZ-210	ENST00000470596	MBD5	Q9P267	1494 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PRKCZ-210	ENST00000470596	AGL	P35573	1532 aa		33.16	■■■□□ 2.9
PRKCZ-210	ENST00000470596	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		33.15	■■■□□ 2.9
PRKCZ-210	ENST00000470596	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		33.13	■■■□□ 2.89
PRKCZ-210	ENST00000470596	ATP7A	Q04656	1500 aa		33.12	■■■□□ 2.89
PRKCZ-210	ENST00000470596	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	33.1	■■■□□ 2.89
PRKCZ-210	ENST00000470596	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PRKCZ-210	ENST00000470596	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		33.07	■■■□□ 2.88
PRKCZ-210	ENST00000470596	MIA2	Q96PC5	1412 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PRKCZ-210	ENST00000470596	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		33.03	■■■□□ 2.88
PRKCZ-210	ENST00000470596	HSPA2	P54652	639 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PRKCZ-210	ENST00000470596	MYOM3	Q5VTT5	1437 aa		33.02	■■■□□ 2.88
PRKCZ-210	ENST00000470596	A2M	P01023	1474 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PRKCZ-210	ENST00000470596	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		32.99	■■■□□ 2.87
PRKCZ-210	ENST00000470596	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.97	■■■□□ 2.87
PRKCZ-210	ENST00000470596	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.97	■■■□□ 2.87
PRKCZ-210	ENST00000470596	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.96	■■■□□ 2.87
PRKCZ-210	ENST00000470596	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.96	■■■□□ 2.87
PRKCZ-210	ENST00000470596	TSPY4	P0CV99	314 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PRKCZ-210	ENST00000470596	TSPY10	P0CW01	314 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PRKCZ-210	ENST00000470596	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.94	■■■□□ 2.86
PRKCZ-210	ENST00000470596	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.92	■■■□□ 2.86
PRKCZ-210	ENST00000470596	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.89	■■■□□ 2.86
PRKCZ-210	ENST00000470596	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PRKCZ-210	ENST00000470596	C3	P01024	1663 aa		32.87	■■■□□ 2.85
PRKCZ-210	ENST00000470596	MAST1	Q9Y2H9	1570 aa		32.82	■■■□□ 2.84
PRKCZ-210	ENST00000470596	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.81	■■■□□ 2.84
PRKCZ-210	ENST00000470596	GGT6	Q6P531	493 aa		32.8	■■■□□ 2.84
PRKCZ-210	ENST00000470596	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.79	■■■□□ 2.84
PRKCZ-210	ENST00000470596	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PRKCZ-210	ENST00000470596	PTPN23	Q9H3S7	1636 aa		32.78	■■■□□ 2.84
PRKCZ-210	ENST00000470596	FGD6	Q6ZV73	1430 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PRKCZ-210	ENST00000470596	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.77	■■■□□ 2.84
PRKCZ-210	ENST00000470596	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.75	■■■□□ 2.83
PRKCZ-210	ENST00000470596	TCOF1	Q13428	1488 aa	Known RBP	32.74	■■■□□ 2.83
PRKCZ-210	ENST00000470596	KIF3B	O15066	747 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PRKCZ-210	ENST00000470596	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.73	■■■□□ 2.83
PRKCZ-210	ENST00000470596	NPAT	Q14207	1427 aa		32.69	■■■□□ 2.82
PRKCZ-210	ENST00000470596	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.69	■■■□□ 2.82
PRKCZ-210	ENST00000470596	ABCC5	O15440	1437 aa		32.68	■■■□□ 2.82
PRKCZ-210	ENST00000470596	SHANK2	Q9UPX8	1470 aa		32.68	■■■□□ 2.82

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.3 ms