RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468468.5

TSPAN4-211, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 2

Gene TSPAN4, Length 2,777 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-211ENST00000468468 BCANQ96GW7 911 aa22.19■■□□□ 1.14
TSPAN4-211ENST00000468468 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
TSPAN4-211ENST00000468468 TRIM52Q96A61 297 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-211ENST00000468468 ANP32EQ9BTT0 268 aa22.17■■□□□ 1.14
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
TSPAN4-211ENST00000468468 KDM5BQ9UGL1 1544 aa22.14■■□□□ 1.13
TSPAN4-211ENST00000468468 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
TSPAN4-211ENST00000468468 NEFLP07196 543 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-211ENST00000468468 CHD1O14646 1710 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-211ENST00000468468 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.1■■□□□ 1.13
TSPAN4-211ENST00000468468 ABCA8O94911 1581 aa22.08■■□□□ 1.13
TSPAN4-211ENST00000468468 KIF14Q15058 1648 aa22.07■■□□□ 1.12
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TSPAN4-211ENST00000468468 KDM6BO15054 1643 aa22.07■■□□□ 1.12
TSPAN4-211ENST00000468468 AKNAQ7Z591 1439 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-211ENST00000468468 DAPK1P53355 1430 aa22.06■■□□□ 1.12
TSPAN4-211ENST00000468468 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-211ENST00000468468 ABCC5O15440 1437 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-211ENST00000468468 ATP10BO94823 1461 aa22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-211ENST00000468468 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
TSPAN4-211ENST00000468468 MPHOSPH9Q99550 1183 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4-211ENST00000468468 PTPRGP23470 1445 aa22.03■■□□□ 1.12
TSPAN4-211ENST00000468468 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
TSPAN4-211ENST00000468468 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.01■■□□□ 1.11
TSPAN4-211ENST00000468468 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
TSPAN4-211ENST00000468468 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
TSPAN4-211ENST00000468468 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22■■□□□ 1.11
TSPAN4-211ENST00000468468 ADCY10Q96PN6 1610 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN4-211ENST00000468468 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.99■■□□□ 1.11
TSPAN4-211ENST00000468468 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
TSPAN4-211ENST00000468468 FOXD1Q16676 465 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN4-211ENST00000468468 ITSN2Q9NZM3 1697 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN4-211ENST00000468468 ROCK1Q13464 1354 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN4-211ENST00000468468 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.96■■□□□ 1.11
TSPAN4-211ENST00000468468 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP21.94■■□□□ 1.1
TSPAN4-211ENST00000468468 ERCC6L2Q5T890 1561 aa21.93■■□□□ 1.1
TSPAN4-211ENST00000468468 SHROOM2Q13796 1616 aa21.91■■□□□ 1.1
TSPAN4-211ENST00000468468 ABCC10Q5T3U5 1492 aa21.91■■□□□ 1.1
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TSPAN4-211ENST00000468468 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa21.88■■□□□ 1.09
TSPAN4-211ENST00000468468 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-211ENST00000468468 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.87■■□□□ 1.09
TSPAN4-211ENST00000468468 NCOA1Q15788 1441 aa21.85■■□□□ 1.09
TSPAN4-211ENST00000468468 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP21.85■■□□□ 1.09
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TSPAN4-211ENST00000468468 CCDC7Q96M83 1385 aa21.83■■□□□ 1.09
TSPAN4-211ENST00000468468 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
TSPAN4-211ENST00000468468 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.8■■□□□ 1.08
TSPAN4-211ENST00000468468 CCDC184Q52MB2 194 aa21.8■■□□□ 1.08
TSPAN4-211ENST00000468468 TEX14Q8IWB6 1497 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN4-211ENST00000468468 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.79■■□□□ 1.08
TSPAN4-211ENST00000468468 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
TSPAN4-211ENST00000468468 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.78■■□□□ 1.08
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TSPAN4-211ENST00000468468 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
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TSPAN4-211ENST00000468468 ABCC2Q92887 1545 aa21.76■■□□□ 1.07
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TSPAN4-211ENST00000468468 C9orf84Q5VXU9 1444 aa21.74■■□□□ 1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 PZPP20742 1482 aa21.73■■□□□ 1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 FAM9BQ8IZU0 186 aa21.72■■□□□ 1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 MRS2Q9HD23 443 aa21.72■■□□□ 1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.72■■□□□ 1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 KIF7Q2M1P5 1343 aa21.72■■□□□ 1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TSPY4P0CV99 314 aa21.71■■□□□ 1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TSPY10P0CW01 314 aa21.71■■□□□ 1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.71■■□□□ 1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa21.71■■□□□ 1.07
TSPAN4-211ENST00000468468 TTC37Q6PGP7 1564 aa21.7■■□□□ 1.06
TSPAN4-211ENST00000468468 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa21.7■■□□□ 1.06
TSPAN4-211ENST00000468468 MBD5Q9P267 1494 aa21.7■■□□□ 1.06
TSPAN4-211ENST00000468468 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.7■■□□□ 1.06
TSPAN4-211ENST00000468468 PREX2Q70Z35 1606 aa21.69■■□□□ 1.06
TSPAN4-211ENST00000468468 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
TSPAN4-211ENST00000468468 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.65■■□□□ 1.06
TSPAN4-211ENST00000468468 ARHGAP5Q13017 1502 aa21.65■■□□□ 1.06
TSPAN4-211ENST00000468468 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 KIF15Q9NS87 1388 aa21.64■■□□□ 1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 PKD2Q13563 968 aa21.64■■□□□ 1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.63■■□□□ 1.05
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TSPAN4-211ENST00000468468 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.63■■□□□ 1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 SYCP2Q9BX26 1530 aa21.62■■□□□ 1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 NUP155O75694 1391 aa21.61■■□□□ 1.05
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TSPAN4-211ENST00000468468 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.59■■□□□ 1.05
TSPAN4-211ENST00000468468 USP47Q96K76 1375 aa21.57■■□□□ 1.04
TSPAN4-211ENST00000468468 MYO5CQ9NQX4 1742 aa21.56■■□□□ 1.04
TSPAN4-211ENST00000468468 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.56■■□□□ 1.04
TSPAN4-211ENST00000468468 POLR3GLQ9BT43 218 aa21.56■■□□□ 1.04
TSPAN4-211ENST00000468468 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
TSPAN4-211ENST00000468468 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
TSPAN4-211ENST00000468468 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.52■■□□□ 1.04
TSPAN4-211ENST00000468468 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa21.52■■□□□ 1.03
TSPAN4-211ENST00000468468 PLCH2O75038 1416 aa21.51■■□□□ 1.03
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