RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462494.5

ACTB-207, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 2,245 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-207ENST00000462494 ABCC5O15440 1437 aa23.75■■□□□ 1.39
ACTB-207ENST00000462494 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-207ENST00000462494 ROCK1Q13464 1354 aa23.74■■□□□ 1.39
ACTB-207ENST00000462494 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
ACTB-207ENST00000462494 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
ACTB-207ENST00000462494 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP23.71■■□□□ 1.39
ACTB-207ENST00000462494 BCANQ96GW7 911 aa23.7■■□□□ 1.38
ACTB-207ENST00000462494 FKBP8Q14318 412 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-207ENST00000462494 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.69■■□□□ 1.38
ACTB-207ENST00000462494 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
ACTB-207ENST00000462494 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
ACTB-207ENST00000462494 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
ACTB-207ENST00000462494 PLB1Q6P1J6 1458 aa23.68■■□□□ 1.38
ACTB-207ENST00000462494 CEP170Q5SW79 1584 aa23.67■■□□□ 1.38
ACTB-207ENST00000462494 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
ACTB-207ENST00000462494 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
ACTB-207ENST00000462494 SYNJ2O15056 1496 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.66■■□□□ 1.38
ACTB-207ENST00000462494 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.62■■□□□ 1.37
ACTB-207ENST00000462494 JPH4Q96JJ6 628 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-207ENST00000462494 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
ACTB-207ENST00000462494 NEFLP07196 543 aa23.61■■□□□ 1.37
ACTB-207ENST00000462494 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-207ENST00000462494 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-207ENST00000462494 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ACTB-207ENST00000462494 KIF14Q15058 1648 aa23.58■■□□□ 1.36
ACTB-207ENST00000462494 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-207ENST00000462494 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ACTB-207ENST00000462494 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
ACTB-207ENST00000462494 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-207ENST00000462494 NCOA1Q15788 1441 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-207ENST00000462494 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-207ENST00000462494 NUP160Q12769 1436 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-207ENST00000462494 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.52■■□□□ 1.36
ACTB-207ENST00000462494 PZPP20742 1482 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-207ENST00000462494 CCDC7Q96M83 1385 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-207ENST00000462494 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-207ENST00000462494 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-207ENST00000462494 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-207ENST00000462494 PKD2Q13563 968 aa23.45■■□□□ 1.35
ACTB-207ENST00000462494 ADGRL2O95490 1459 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-207ENST00000462494 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.45■■□□□ 1.34
ACTB-207ENST00000462494 CCDC184Q52MB2 194 aa23.44■■□□□ 1.34
ACTB-207ENST00000462494 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
ACTB-207ENST00000462494 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.43■■□□□ 1.34
ACTB-207ENST00000462494 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
ACTB-207ENST00000462494 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.42■■□□□ 1.34
ACTB-207ENST00000462494 ATP10BO94823 1461 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-207ENST00000462494 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-207ENST00000462494 ABCA8O94911 1581 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-207ENST00000462494 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.41■■□□□ 1.34
ACTB-207ENST00000462494 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.39■■□□□ 1.33
ACTB-207ENST00000462494 FAM9BQ8IZU0 186 aa23.37■■□□□ 1.33
ACTB-207ENST00000462494 ABCC10Q5T3U5 1492 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-207ENST00000462494 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-207ENST00000462494 TSPY4P0CV99 314 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-207ENST00000462494 TSPY10P0CW01 314 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-207ENST00000462494 NUP155O75694 1391 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-207ENST00000462494 MRS2Q9HD23 443 aa23.36■■□□□ 1.33
ACTB-207ENST00000462494 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.333e-29■□□□□ 9.6
ACTB-207ENST00000462494 POLR3GLQ9BT43 218 aa23.34■■□□□ 1.33
ACTB-207ENST00000462494 MYT1Q01538 1121 aa23.33■■□□□ 1.33
ACTB-207ENST00000462494 MBD5Q9P267 1494 aa23.33■■□□□ 1.32
ACTB-207ENST00000462494 USP47Q96K76 1375 aa23.31■■□□□ 1.32
ACTB-207ENST00000462494 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
ACTB-207ENST00000462494 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
ACTB-207ENST00000462494 PTPRGP23470 1445 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-207ENST00000462494 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.3■■□□□ 1.32
ACTB-207ENST00000462494 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
ACTB-207ENST00000462494 KIF15Q9NS87 1388 aa23.27■■□□□ 1.32
ACTB-207ENST00000462494 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.24■■□□□ 1.31
ACTB-207ENST00000462494 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.22■■□□□ 1.31
ACTB-207ENST00000462494 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.21■■□□□ 1.31
ACTB-207ENST00000462494 KDM5CP41229 1560 aa23.19■■□□□ 1.3
ACTB-207ENST00000462494 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-207ENST00000462494 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-207ENST00000462494 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.18■■□□□ 1.3
ACTB-207ENST00000462494 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-207ENST00000462494 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-207ENST00000462494 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.17■■□□□ 1.3
ACTB-207ENST00000462494 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.17■■□□□ 1.3
ACTB-207ENST00000462494 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-207ENST00000462494 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.16■■□□□ 1.3
ACTB-207ENST00000462494 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.15■■□□□ 1.3
ACTB-207ENST00000462494 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
ACTB-207ENST00000462494 PREX2Q70Z35 1606 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-207ENST00000462494 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
ACTB-207ENST00000462494 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.13■■□□□ 1.29
ACTB-207ENST00000462494 CHD1O14646 1710 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-207ENST00000462494 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.12■■□□□ 1.29
ACTB-207ENST00000462494 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-207ENST00000462494 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.1■■□□□ 1.29
ACTB-207ENST00000462494 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.09■■□□□ 1.292e-37■□□□□ 8.4
ACTB-207ENST00000462494 ARHGAP5Q13017 1502 aa23.09■■□□□ 1.29
ACTB-207ENST00000462494 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.08■■□□□ 1.29
ACTB-207ENST00000462494 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
ACTB-207ENST00000462494 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.06■■□□□ 1.28
ACTB-207ENST00000462494 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.05■■□□□ 1.28
ACTB-207ENST00000462494 RGL3Q3MIN7 710 aa23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms