RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461691.6

ZBED1-204, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 947 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-204ENST00000461691 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.75■■□□□ 1.23
ZBED1-204ENST00000461691 CCDC18Q5T9S5 1454 aa22.75■■□□□ 1.23
ZBED1-204ENST00000461691 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.73■■□□□ 1.23
ZBED1-204ENST00000461691 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.73■■□□□ 1.23
ZBED1-204ENST00000461691 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.73■■□□□ 1.23
ZBED1-204ENST00000461691 PTPRMP28827 1452 aa22.71■■□□□ 1.23
ZBED1-204ENST00000461691 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.7■■□□□ 1.22
ZBED1-204ENST00000461691 FYCO1Q9BQS8 1478 aa22.7■■□□□ 1.22
ZBED1-204ENST00000461691 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.7■■□□□ 1.22
ZBED1-204ENST00000461691 MADDQ8WXG6 1647 aa22.7■■□□□ 1.22
ZBED1-204ENST00000461691 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.65■■□□□ 1.22
ZBED1-204ENST00000461691 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ZBED1-204ENST00000461691 PREX2Q70Z35 1606 aa22.64■■□□□ 1.21
ZBED1-204ENST00000461691 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.63■■□□□ 1.21
ZBED1-204ENST00000461691 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.63■■□□□ 1.21
ZBED1-204ENST00000461691 ATP10AO60312 1499 aa22.6■■□□□ 1.21
ZBED1-204ENST00000461691 KDM5CP41229 1560 aa22.59■■□□□ 1.21
ZBED1-204ENST00000461691 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.58■■□□□ 1.21
ZBED1-204ENST00000461691 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.57■■□□□ 1.2
ZBED1-204ENST00000461691 AFAP1Q8N556 730 aa22.57■■□□□ 1.2
ZBED1-204ENST00000461691 MLECQ14165 292 aa22.56■■□□□ 1.2
ZBED1-204ENST00000461691 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.55■■□□□ 1.2
ZBED1-204ENST00000461691 ABCC1P33527 1531 aa22.55■■□□□ 1.2
ZBED1-204ENST00000461691 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.55■■□□□ 1.2
ZBED1-204ENST00000461691 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.54■■□□□ 1.2
ZBED1-204ENST00000461691 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.51■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.5■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.5■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.5■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 CEP162Q5TB80 1403 aa22.49■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.49■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.48■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 ABCA6Q8N139 1617 aa22.47■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.47■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 REREQ9P2R6 1566 aa22.46■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.46■■□□□ 1.19
ZBED1-204ENST00000461691 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.43■■□□□ 1.18
ZBED1-204ENST00000461691 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.43■■□□□ 1.18
ZBED1-204ENST00000461691 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
ZBED1-204ENST00000461691 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.41■■□□□ 1.18
ZBED1-204ENST00000461691 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
ZBED1-204ENST00000461691 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.4■■□□□ 1.18
ZBED1-204ENST00000461691 AGLP35573 1532 aa22.39■■□□□ 1.17
ZBED1-204ENST00000461691 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.39■■□□□ 1.17
ZBED1-204ENST00000461691 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
ZBED1-204ENST00000461691 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.37■■□□□ 1.17
ZBED1-204ENST00000461691 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
ZBED1-204ENST00000461691 TIAM1Q13009 1591 aa22.36■■□□□ 1.17
ZBED1-204ENST00000461691 HSPA2P54652 639 aa22.35■■□□□ 1.17
ZBED1-204ENST00000461691 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
ZBED1-204ENST00000461691 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.33■■□□□ 1.17
ZBED1-204ENST00000461691 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.32■■□□□ 1.16
ZBED1-204ENST00000461691 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
ZBED1-204ENST00000461691 ATP7AQ04656 1500 aa22.31■■□□□ 1.16
ZBED1-204ENST00000461691 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
ZBED1-204ENST00000461691 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
ZBED1-204ENST00000461691 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
ZBED1-204ENST00000461691 C3P01024 1663 aa22.29■■□□□ 1.16
ZBED1-204ENST00000461691 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
ZBED1-204ENST00000461691 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.25■■□□□ 1.15
ZBED1-204ENST00000461691 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.25■■□□□ 1.15
ZBED1-204ENST00000461691 NCOA2Q15596 1464 aa22.25■■□□□ 1.15
ZBED1-204ENST00000461691 A2MP01023 1474 aa22.24■■□□□ 1.15
ZBED1-204ENST00000461691 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.23■■□□□ 1.15
ZBED1-204ENST00000461691 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.23■■□□□ 1.15
ZBED1-204ENST00000461691 MBD5Q9P267 1494 aa22.22■■□□□ 1.15
ZBED1-204ENST00000461691 PLXNC1O60486 1568 aa22.22■■□□□ 1.15
ZBED1-204ENST00000461691 MROH2AA6NES4 1674 aa22.21■■□□□ 1.15
ZBED1-204ENST00000461691 FBXO41Q8TF61 875 aa22.18■■□□□ 1.14
ZBED1-204ENST00000461691 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.17■■□□□ 1.14
ZBED1-204ENST00000461691 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.17■■□□□ 1.14
ZBED1-204ENST00000461691 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.17■■□□□ 1.14
ZBED1-204ENST00000461691 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.15■■□□□ 1.14
ZBED1-204ENST00000461691 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
ZBED1-204ENST00000461691 STRCQ7RTU9 1775 aa22.14■■□□□ 1.13
ZBED1-204ENST00000461691 ZMYM3Q14202 1370 aa22.13■■□□□ 1.13
ZBED1-204ENST00000461691 MAP3K1Q13233 1512 aa22.13■■□□□ 1.13
ZBED1-204ENST00000461691 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.13■■□□□ 1.13
ZBED1-204ENST00000461691 GGT6Q6P531 493 aa22.13■■□□□ 1.13
ZBED1-204ENST00000461691 NPATQ14207 1427 aa22.12■■□□□ 1.13
ZBED1-204ENST00000461691 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.1■■□□□ 1.13
ZBED1-204ENST00000461691 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.1■■□□□ 1.13
ZBED1-204ENST00000461691 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
ZBED1-204ENST00000461691 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.09■■□□□ 1.13
ZBED1-204ENST00000461691 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
ZBED1-204ENST00000461691 TSPY4P0CV99 314 aa22.05■■□□□ 1.12
ZBED1-204ENST00000461691 TSPY10P0CW01 314 aa22.05■■□□□ 1.12
ZBED1-204ENST00000461691 CERKQ8TCT0 537 aa22.04■■□□□ 1.12
ZBED1-204ENST00000461691 KIF3BO15066 747 aa22.03■■□□□ 1.12
ZBED1-204ENST00000461691 PTPRKQ15262 1439 aa22.03■■□□□ 1.12
ZBED1-204ENST00000461691 PTPRTO14522 1441 aa22.02■■□□□ 1.12
ZBED1-204ENST00000461691 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.02■■□□□ 1.12
ZBED1-204ENST00000461691 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.02■■□□□ 1.11
ZBED1-204ENST00000461691 MIA2Q96PC5 1412 aa22.01■■□□□ 1.11
ZBED1-204ENST00000461691 APLP2Q06481 763 aa22.01■■□□□ 1.11
ZBED1-204ENST00000461691 NCOA1Q15788 1441 aa22■■□□□ 1.11
ZBED1-204ENST00000461691 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
ZBED1-204ENST00000461691 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.1 ms