RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461691.6

ZBED1-204, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 947 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-204ENST00000461691 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.76■■■■□ 3.16
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ZBED1-204ENST00000461691 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa29.56■■■□□ 2.32
ZBED1-204ENST00000461691 NACADO15069 1562 aa29.4■■■□□ 2.3
ZBED1-204ENST00000461691 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.27■■■□□ 2.28
ZBED1-204ENST00000461691 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.04■■■□□ 2.24
ZBED1-204ENST00000461691 UNC13AQ9UPW8 1703 aa28.91■■■□□ 2.22
ZBED1-204ENST00000461691 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
ZBED1-204ENST00000461691 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.84■■■□□ 2.21
ZBED1-204ENST00000461691 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP28.82■■■□□ 2.2
ZBED1-204ENST00000461691 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.74■■■□□ 2.19
ZBED1-204ENST00000461691 BICRAQ9NZM4 1560 aa28.67■■■□□ 2.18
ZBED1-204ENST00000461691 SCRIBQ14160 1630 aa28.38■■■□□ 2.13
ZBED1-204ENST00000461691 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.33■■■□□ 2.13
ZBED1-204ENST00000461691 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa27.98■■■□□ 2.07
ZBED1-204ENST00000461691 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
ZBED1-204ENST00000461691 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.86■■■□□ 2.05
ZBED1-204ENST00000461691 NCAPD3P42695 1498 aa27.12■■□□□ 1.93
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ZBED1-204ENST00000461691 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa27.06■■□□□ 1.92
ZBED1-204ENST00000461691 SMARCA2P51531 1590 aa27.02■■□□□ 1.92
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ZBED1-204ENST00000461691 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.82■■□□□ 1.88
ZBED1-204ENST00000461691 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.79■■□□□ 1.88
ZBED1-204ENST00000461691 ERCC6Q03468 1493 aa26.73■■□□□ 1.87
ZBED1-204ENST00000461691 NESP48681 1621 aa26.63■■□□□ 1.85
ZBED1-204ENST00000461691 CUX2O14529 1486 aa26.62■■□□□ 1.85
ZBED1-204ENST00000461691 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.5■■□□□ 1.83
ZBED1-204ENST00000461691 WIZO95785 1651 aa26.49■■□□□ 1.83
ZBED1-204ENST00000461691 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.38■■□□□ 1.81
ZBED1-204ENST00000461691 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
ZBED1-204ENST00000461691 PDS5BQ9NTI5 1447 aa26.33■■□□□ 1.81
ZBED1-204ENST00000461691 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.33■■□□□ 1.81
ZBED1-204ENST00000461691 CADPSQ9ULU8 1353 aa26.3■■□□□ 1.8
ZBED1-204ENST00000461691 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP26.28■■□□□ 1.8
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ZBED1-204ENST00000461691 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.1■■□□□ 1.77
ZBED1-204ENST00000461691 CFTRP13569 1480 aa26.04■■□□□ 1.76
ZBED1-204ENST00000461691 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.04■■□□□ 1.76
ZBED1-204ENST00000461691 WDR62O43379 1518 aa26.02■■□□□ 1.76
ZBED1-204ENST00000461691 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.01■■□□□ 1.75
ZBED1-204ENST00000461691 PRDM2Q13029 1718 aa25.86■■□□□ 1.73
ZBED1-204ENST00000461691 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.85■■□□□ 1.73
ZBED1-204ENST00000461691 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
ZBED1-204ENST00000461691 TOPBP1Q92547 1522 aa25.54■■□□□ 1.68
ZBED1-204ENST00000461691 ABCC8Q09428 1581 aa25.52■■□□□ 1.68
ZBED1-204ENST00000461691 IFT140Q96RY7 1462 aa25.5■■□□□ 1.67
ZBED1-204ENST00000461691 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.48■■□□□ 1.67
ZBED1-204ENST00000461691 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
ZBED1-204ENST00000461691 OSCARQ8IYS5 282 aa25.42■■□□□ 1.66
ZBED1-204ENST00000461691 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
ZBED1-204ENST00000461691 TRIM41Q8WV44 630 aa25.31■■□□□ 1.64
ZBED1-204ENST00000461691 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
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ZBED1-204ENST00000461691 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP25.21■■□□□ 1.63
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ZBED1-204ENST00000461691 CUX1P39880 1505 aa25.16■■□□□ 1.62
ZBED1-204ENST00000461691 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.15■■□□□ 1.62
ZBED1-204ENST00000461691 CHD1O14646 1710 aa25.12■■□□□ 1.61
ZBED1-204ENST00000461691 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
ZBED1-204ENST00000461691 WDR97A6NE52 1622 aa25.08■■□□□ 1.61
ZBED1-204ENST00000461691 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.08■■□□□ 1.61
ZBED1-204ENST00000461691 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.08■■□□□ 1.61
ZBED1-204ENST00000461691 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.08■■□□□ 1.61
ZBED1-204ENST00000461691 FBLN2P98095 1184 aa25.04■■□□□ 1.6
ZBED1-204ENST00000461691 ARHGEF11O15085 1522 aa25.02■■□□□ 1.6
ZBED1-204ENST00000461691 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa24.98■■□□□ 1.59
ZBED1-204ENST00000461691 GRIN2BQ13224 1484 aa24.95■■□□□ 1.58
ZBED1-204ENST00000461691 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
ZBED1-204ENST00000461691 PBRM1Q86U86 1689 aa24.89■■□□□ 1.58
ZBED1-204ENST00000461691 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.89■■□□□ 1.57
ZBED1-204ENST00000461691 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.88■■□□□ 1.57
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ZBED1-204ENST00000461691 SYNJ2O15056 1496 aa24.84■■□□□ 1.57
ZBED1-204ENST00000461691 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.84■■□□□ 1.57
ZBED1-204ENST00000461691 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.83■■□□□ 1.57
ZBED1-204ENST00000461691 SYNJ1O43426 1573 aa24.83■■□□□ 1.57
ZBED1-204ENST00000461691 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.82■■□□□ 1.56
ZBED1-204ENST00000461691 TOP2BQ02880 1626 aa24.82■■□□□ 1.56
ZBED1-204ENST00000461691 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED1-204ENST00000461691 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.81■■□□□ 1.56
ZBED1-204ENST00000461691 ARAP1Q96P48 1450 aa24.77■■□□□ 1.56
ZBED1-204ENST00000461691 ADAMTS12P58397 1594 aa24.64■■□□□ 1.54
ZBED1-204ENST00000461691 GRIN2AQ12879 1464 aa24.62■■□□□ 1.53
ZBED1-204ENST00000461691 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.58■■□□□ 1.53
ZBED1-204ENST00000461691 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.57■■□□□ 1.52
ZBED1-204ENST00000461691 NUP160Q12769 1436 aa24.52■■□□□ 1.52
ZBED1-204ENST00000461691 CEP170Q5SW79 1584 aa24.52■■□□□ 1.52
ZBED1-204ENST00000461691 TRHP20396 242 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
ZBED1-204ENST00000461691 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.42■■□□□ 1.5
ZBED1-204ENST00000461691 SHROOM2Q13796 1616 aa24.42■■□□□ 1.5
ZBED1-204ENST00000461691 KIF27Q86VH2 1401 aa24.34■■□□□ 1.49
ZBED1-204ENST00000461691 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.29■■□□□ 1.48
ZBED1-204ENST00000461691 IGF1RP08069 1367 aa24.29■■□□□ 1.48
ZBED1-204ENST00000461691 CUL7Q14999 1698 aa24.28■■□□□ 1.48
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