RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000457023.1

CAPN7-205, Transcript of calpain 7, humanhuman

TSL 3

Gene CAPN7, Length 854 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN7-205ENST00000457023 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.27■■■■■ 4.2
CAPN7-205ENST00000457023 MADDQ8WXG6 1647 aa41.26■■■■■ 4.2
CAPN7-205ENST00000457023 KIF14Q15058 1648 aa41.23■■■■■ 4.19
CAPN7-205ENST00000457023 CLIP1P30622 1438 aa41.21■■■■■ 4.19
CAPN7-205ENST00000457023 MYO5CQ9NQX4 1742 aa41.21■■■■■ 4.19
CAPN7-205ENST00000457023 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa41.19■■■■■ 4.18
CAPN7-205ENST00000457023 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa41.18■■■■■ 4.18
CAPN7-205ENST00000457023 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.14■■■■■ 4.18
CAPN7-205ENST00000457023 ATP10AO60312 1499 aa41.1■■■■■ 4.17
CAPN7-205ENST00000457023 CCDC18Q5T9S5 1454 aa41.1■■■■■ 4.17
CAPN7-205ENST00000457023 ARHGAP5Q13017 1502 aa41.09■■■■■ 4.17
CAPN7-205ENST00000457023 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
CAPN7-205ENST00000457023 AFAP1Q8N556 730 aa41.07■■■■■ 4.17
CAPN7-205ENST00000457023 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP41.07■■■■■ 4.16
CAPN7-205ENST00000457023 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa41.06■■■■■ 4.16
CAPN7-205ENST00000457023 MLECQ14165 292 aa41.04■■■■■ 4.16
CAPN7-205ENST00000457023 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.03■■■■■ 4.16
CAPN7-205ENST00000457023 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.02■■■■■ 4.16
CAPN7-205ENST00000457023 KDM5CP41229 1560 aa40.99■■■■■ 4.15
CAPN7-205ENST00000457023 FYCO1Q9BQS8 1478 aa40.97■■■■■ 4.15
CAPN7-205ENST00000457023 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.97■■■■■ 4.15
CAPN7-205ENST00000457023 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.93■■■■■ 4.14
CAPN7-205ENST00000457023 PLPPR3Q6T4P5 718 aa40.91■■■■■ 4.14
CAPN7-205ENST00000457023 PREX2Q70Z35 1606 aa40.9■■■■■ 4.14
CAPN7-205ENST00000457023 MLH3Q9UHC1 1453 aa40.89■■■■■ 4.14
CAPN7-205ENST00000457023 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.86■■■■■ 4.13
CAPN7-205ENST00000457023 MYT1LQ9UL68 1186 aa40.86■■■■■ 4.13
CAPN7-205ENST00000457023 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.85■■■■■ 4.13
CAPN7-205ENST00000457023 ABCC1P33527 1531 aa40.83■■■■■ 4.13
CAPN7-205ENST00000457023 HSPA2P54652 639 aa40.82■■■■■ 4.13
CAPN7-205ENST00000457023 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa40.81■■■■■ 4.12
CAPN7-205ENST00000457023 REREQ9P2R6 1566 aa40.8■■■■■ 4.12
CAPN7-205ENST00000457023 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa40.77■■■■■ 4.12
CAPN7-205ENST00000457023 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP40.74■■■■■ 4.11
CAPN7-205ENST00000457023 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP40.74■■■■■ 4.11
CAPN7-205ENST00000457023 ITSN2Q9NZM3 1697 aa40.74■■■■■ 4.11
CAPN7-205ENST00000457023 ABCA6Q8N139 1617 aa40.72■■■■■ 4.11
CAPN7-205ENST00000457023 FBXO41Q8TF61 875 aa40.72■■■■■ 4.11
CAPN7-205ENST00000457023 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.7■■■■■ 4.11
CAPN7-205ENST00000457023 AGLP35573 1532 aa40.69■■■■■ 4.1
CAPN7-205ENST00000457023 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.64■■■■■ 4.1
CAPN7-205ENST00000457023 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa40.63■■■■■ 4.1
CAPN7-205ENST00000457023 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.63■■■■■ 4.09
CAPN7-205ENST00000457023 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.61■■■■■ 4.09
CAPN7-205ENST00000457023 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.59■■■■■ 4.09
CAPN7-205ENST00000457023 MTUS2Q5JR59 1369 aa40.59■■■■■ 4.09
CAPN7-205ENST00000457023 CCNB3Q8WWL7 1395 aa40.59■■■■■ 4.09
CAPN7-205ENST00000457023 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP40.56■■■■■ 4.08
CAPN7-205ENST00000457023 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.56■■■■■ 4.08
CAPN7-205ENST00000457023 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.56■■■■■ 4.08
CAPN7-205ENST00000457023 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.53■■■■■ 4.08
CAPN7-205ENST00000457023 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.52■■■■■ 4.08
CAPN7-205ENST00000457023 CEP162Q5TB80 1403 aa40.5■■■■■ 4.07
CAPN7-205ENST00000457023 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa40.47■■■■■ 4.07
CAPN7-205ENST00000457023 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.44■■■■■ 4.06
CAPN7-205ENST00000457023 C3P01024 1663 aa40.43■■■■■ 4.06
CAPN7-205ENST00000457023 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP40.41■■■■■ 4.06
CAPN7-205ENST00000457023 ATP7AQ04656 1500 aa40.41■■■■■ 4.06
CAPN7-205ENST00000457023 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa40.4■■■■■ 4.06
CAPN7-205ENST00000457023 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.4■■■■■ 4.06
CAPN7-205ENST00000457023 TIAM1Q13009 1591 aa40.38■■■■■ 4.05
CAPN7-205ENST00000457023 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.37■■■■■ 4.05
CAPN7-205ENST00000457023 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP40.36■■■■■ 4.05
CAPN7-205ENST00000457023 CERKQ8TCT0 537 aa40.35■■■■■ 4.05
CAPN7-205ENST00000457023 MBD5Q9P267 1494 aa40.34■■■■■ 4.05
CAPN7-205ENST00000457023 A2MP01023 1474 aa40.33■■■■■ 4.05
CAPN7-205ENST00000457023 PLXNC1O60486 1568 aa40.31■■■■■ 4.04
CAPN7-205ENST00000457023 STRCQ7RTU9 1775 aa40.31■■■■■ 4.04
CAPN7-205ENST00000457023 ZMYM3Q14202 1370 aa40.31■■■■■ 4.04
CAPN7-205ENST00000457023 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP40.28■■■■■ 4.04
CAPN7-205ENST00000457023 NPATQ14207 1427 aa40.25■■■■■ 4.03
CAPN7-205ENST00000457023 MROH2AA6NES4 1674 aa40.25■■■■■ 4.03
CAPN7-205ENST00000457023 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa40.25■■■■■ 4.03
CAPN7-205ENST00000457023 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa40.22■■■■■ 4.03
CAPN7-205ENST00000457023 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.22■■■■■ 4.03
CAPN7-205ENST00000457023 GGT6Q6P531 493 aa40.21■■■■■ 4.03
CAPN7-205ENST00000457023 NCOA2Q15596 1464 aa40.2■■■■■ 4.03
CAPN7-205ENST00000457023 PTPRTO14522 1441 aa40.19■■■■■ 4.02
CAPN7-205ENST00000457023 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.17■■■■■ 4.02
CAPN7-205ENST00000457023 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.16■■■■■ 4.02
CAPN7-205ENST00000457023 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP40.14■■■■■ 4.02
CAPN7-205ENST00000457023 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.11■■■■■ 4.01
CAPN7-205ENST00000457023 NCOA1Q15788 1441 aa40.1■■■■■ 4.01
CAPN7-205ENST00000457023 VPS8Q8N3P4 1428 aa40.1■■■■■ 4.01
CAPN7-205ENST00000457023 PTPRKQ15262 1439 aa40.08■■■■■ 4.01
CAPN7-205ENST00000457023 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.08■■■■■ 4.01
CAPN7-205ENST00000457023 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.07■■■■■ 4.01
CAPN7-205ENST00000457023 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa40.04■■■■■ 4
CAPN7-205ENST00000457023 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.01■■■■■ 4
CAPN7-205ENST00000457023 KIF3BO15066 747 aa39.98■■■■□ 3.99
CAPN7-205ENST00000457023 TSPY4P0CV99 314 aa39.95■■■■□ 3.99
CAPN7-205ENST00000457023 TSPY10P0CW01 314 aa39.95■■■■□ 3.99
CAPN7-205ENST00000457023 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.95■■■■□ 3.99
CAPN7-205ENST00000457023 MAP3K1Q13233 1512 aa39.95■■■■□ 3.99
CAPN7-205ENST00000457023 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP39.94■■■■□ 3.98
CAPN7-205ENST00000457023 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa39.93■■■■□ 3.98
CAPN7-205ENST00000457023 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.91■■■■□ 3.98
CAPN7-205ENST00000457023 LTBP4Q8N2S1 1624 aa39.91■■■■□ 3.98
CAPN7-205ENST00000457023 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP39.9■■■■□ 3.98
CAPN7-205ENST00000457023 PLA2R1Q13018 1463 aa39.89■■■■□ 3.98
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