RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000456943.6

GMDS-AS1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 2,308 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.41■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.39■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.39■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.38■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.35■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PREX2Q70Z35 1606 aa25.35■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KDM5BQ9UGL1 1544 aa25.32■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADGRL2O95490 1459 aa25.29■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.29■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.29■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.28■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KDM6BO15054 1643 aa25.28■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-201ENST00000456943 OSCARQ8IYS5 282 aa25.27■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.27■■□□□ 1.64
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.26■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.26■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.23■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NCOA1Q15788 1441 aa25.22■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRIM52Q96A61 297 aa25.22■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.22■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.2■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.2■■□□□ 1.63
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NEUROD1Q13562 356 aa25.2■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.18■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.16■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.16■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.16■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TSPY4P0CV99 314 aa25.15■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TSPY10P0CW01 314 aa25.15■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MBD5Q9P267 1494 aa25.14■■□□□ 1.62
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TONSLQ96HA7 1378 aa25.12■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KCNH8Q96L42 1107 aa25.12■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.12■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.1■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLCH2O75038 1416 aa25.1■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-201ENST00000456943 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.1■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-201ENST00000456943 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.09■■□□□ 1.611e-6■■■■□ 22.6
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.09■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.08■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.08■■□□□ 1.61
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.07■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIF15Q9NS87 1388 aa25.02■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.02■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PZPP20742 1482 aa25■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ABCC1P33527 1531 aa25■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PLXNC1O60486 1568 aa24.98■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ASXL2Q76L83 1435 aa24.96■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.96■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP24.96■■□□□ 1.59
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.95■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.92■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NUP155O75694 1391 aa24.89■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FOXD1Q16676 465 aa24.89■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.87■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FANCAO15360 1455 aa24.87■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-201ENST00000456943 UNC13BO14795 1591 aa24.85■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.83■■□□□ 1.57
GMDS-AS1-201ENST00000456943 PKD2Q13563 968 aa24.83■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ERBINQ96RT1 1412 aa24.82■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.82■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.8■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-201ENST00000456943 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.79■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-201ENST00000456943 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.78■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ADGRL1O94910 1474 aa24.78■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.78■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
GMDS-AS1-201ENST00000456943 L3MBTL2Q969R5 705 aa24.75■■□□□ 1.55
GMDS-AS1-201ENST00000456943 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.75■■□□□ 1.55
GMDS-AS1-201ENST00000456943 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.73■■□□□ 1.55
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ATP7AQ04656 1500 aa24.72■■□□□ 1.55
GMDS-AS1-201ENST00000456943 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.71■■□□□ 1.55
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa24.7■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa24.7■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa24.7■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CD109Q6YHK3 1445 aa24.7■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MIER1Q8N108 512 aa24.7■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 AFAP1Q8N556 730 aa24.68■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.65■■□□□ 1.54
GMDS-AS1-201ENST00000456943 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.63■■□□□ 1.531e-6■□□□□ 8.7
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-201ENST00000456943 DEPDC5O75140 1603 aa24.61■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CYB5RLQ6IPT4 315 aa24.59■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-201ENST00000456943 NEO1Q92859 1461 aa24.59■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-201ENST00000456943 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.58■■□□□ 1.53
GMDS-AS1-201ENST00000456943 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-201ENST00000456943 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.57■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-201ENST00000456943 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.57■■□□□ 1.52
GMDS-AS1-201ENST00000456943 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.57■■□□□ 1.52
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