RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa38.65■■■■□ 3.78
PPP1CB-208ENST00000455580 MAGI2Q86UL8 1455 aa38.65■■■■□ 3.78
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGAP5Q13017 1502 aa38.64■■■■□ 3.78
PPP1CB-208ENST00000455580 CEP162Q5TB80 1403 aa38.63■■■■□ 3.77
PPP1CB-208ENST00000455580 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.6■■■■□ 3.77
PPP1CB-208ENST00000455580 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.58■■■■□ 3.77
PPP1CB-208ENST00000455580 ADAMTSL3P82987 1691 aa38.58■■■■□ 3.77
PPP1CB-208ENST00000455580 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa38.55■■■■□ 3.76
PPP1CB-208ENST00000455580 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa38.55■■■■□ 3.76
PPP1CB-208ENST00000455580 BCORL1Q5H9F3 1711 aa38.53■■■■□ 3.76
PPP1CB-208ENST00000455580 AFAP1Q8N556 730 aa38.53■■■■□ 3.76
PPP1CB-208ENST00000455580 PREX2Q70Z35 1606 aa38.5■■■■□ 3.75
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa38.5■■■■□ 3.75
PPP1CB-208ENST00000455580 PTPRMP28827 1452 aa38.47■■■■□ 3.75
PPP1CB-208ENST00000455580 ATP10AO60312 1499 aa38.44■■■■□ 3.74
PPP1CB-208ENST00000455580 MTUS2Q5JR59 1369 aa38.43■■■■□ 3.74
PPP1CB-208ENST00000455580 KDM5CP41229 1560 aa38.42■■■■□ 3.74
PPP1CB-208ENST00000455580 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa38.42■■■■□ 3.74
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.41■■■■□ 3.74
PPP1CB-208ENST00000455580 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP38.41■■■■□ 3.74
PPP1CB-208ENST00000455580 MADDQ8WXG6 1647 aa38.39■■■■□ 3.74
PPP1CB-208ENST00000455580 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.39■■■■□ 3.74
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCC1P33527 1531 aa38.38■■■■□ 3.74
PPP1CB-208ENST00000455580 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa38.38■■■■□ 3.73
PPP1CB-208ENST00000455580 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.37■■■■□ 3.73
PPP1CB-208ENST00000455580 C9orf84Q5VXU9 1444 aa38.37■■■■□ 3.73
PPP1CB-208ENST00000455580 MYT1LQ9UL68 1186 aa38.36■■■■□ 3.73
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP38.36■■■■□ 3.73
PPP1CB-208ENST00000455580 CCNB3Q8WWL7 1395 aa38.33■■■■□ 3.73
PPP1CB-208ENST00000455580 MLH3Q9UHC1 1453 aa38.33■■■■□ 3.73
PPP1CB-208ENST00000455580 MLECQ14165 292 aa38.32■■■■□ 3.72
PPP1CB-208ENST00000455580 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP38.31■■■■□ 3.72
PPP1CB-208ENST00000455580 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.29■■■■□ 3.72
PPP1CB-208ENST00000455580 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.26■■■■□ 3.72
PPP1CB-208ENST00000455580 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP38.25■■■■□ 3.712e-6■■□□□ 12.6
PPP1CB-208ENST00000455580 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP38.25■■■■□ 3.71
PPP1CB-208ENST00000455580 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.25■■■■□ 3.71
PPP1CB-208ENST00000455580 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa38.23■■■■□ 3.71
PPP1CB-208ENST00000455580 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa38.21■■■■□ 3.71
PPP1CB-208ENST00000455580 VPS8Q8N3P4 1428 aa38.21■■■■□ 3.71
PPP1CB-208ENST00000455580 SYCP2Q9BX26 1530 aa38.18■■■■□ 3.7
PPP1CB-208ENST00000455580 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa38.18■■■■□ 3.7
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCA6Q8N139 1617 aa38.17■■■■□ 3.7
PPP1CB-208ENST00000455580 REREQ9P2R6 1566 aa38.17■■■■□ 3.7
PPP1CB-208ENST00000455580 TIAM1Q13009 1591 aa38.14■■■■□ 3.7
PPP1CB-208ENST00000455580 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa38.14■■■■□ 3.7
PPP1CB-208ENST00000455580 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP38.13■■■■□ 3.7
PPP1CB-208ENST00000455580 PLPPR3Q6T4P5 718 aa38.12■■■■□ 3.69
PPP1CB-208ENST00000455580 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.11■■■■□ 3.69
PPP1CB-208ENST00000455580 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa38.1■■■■□ 3.69
PPP1CB-208ENST00000455580 AGLP35573 1532 aa38.08■■■■□ 3.69
PPP1CB-208ENST00000455580 NCOA2Q15596 1464 aa38.07■■■■□ 3.68
PPP1CB-208ENST00000455580 LMTK3Q96Q04 1460 aa38.03■■■■□ 3.68
PPP1CB-208ENST00000455580 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP38.02■■■■□ 3.68
PPP1CB-208ENST00000455580 MBD5Q9P267 1494 aa38.01■■■■□ 3.67
PPP1CB-208ENST00000455580 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa38■■■■□ 3.67
PPP1CB-208ENST00000455580 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.99■■■■□ 3.67
PPP1CB-208ENST00000455580 ATP7AQ04656 1500 aa37.98■■■■□ 3.67
PPP1CB-208ENST00000455580 MAP3K1Q13233 1512 aa37.97■■■■□ 3.67
PPP1CB-208ENST00000455580 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.95■■■■□ 3.67
PPP1CB-208ENST00000455580 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
PPP1CB-208ENST00000455580 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.91■■■■□ 3.66
PPP1CB-208ENST00000455580 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.89■■■■□ 3.66
PPP1CB-208ENST00000455580 HSPA2P54652 639 aa37.88■■■■□ 3.65
PPP1CB-208ENST00000455580 A2MP01023 1474 aa37.88■■■■□ 3.65
PPP1CB-208ENST00000455580 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.87■■■■□ 3.65
PPP1CB-208ENST00000455580 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.86■■■■□ 3.65
PPP1CB-208ENST00000455580 PLXNC1O60486 1568 aa37.81■■■■□ 3.64
PPP1CB-208ENST00000455580 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.81■■■■□ 3.64
PPP1CB-208ENST00000455580 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.8■■■■□ 3.64
PPP1CB-208ENST00000455580 APLP2Q06481 763 aa37.78■■■■□ 3.64
PPP1CB-208ENST00000455580 C3P01024 1663 aa37.75■■■■□ 3.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.75■■■■□ 3.63
PPP1CB-208ENST00000455580 GGT6Q6P531 493 aa37.74■■■■□ 3.63
PPP1CB-208ENST00000455580 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
PPP1CB-208ENST00000455580 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.74■■■■□ 3.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.72■■■■□ 3.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TSPY4P0CV99 314 aa37.72■■■■□ 3.63
PPP1CB-208ENST00000455580 TSPY10P0CW01 314 aa37.72■■■■□ 3.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.71■■■■□ 3.63
PPP1CB-208ENST00000455580 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.7■■■■□ 3.63
PPP1CB-208ENST00000455580 MIA2Q96PC5 1412 aa37.7■■■■□ 3.63
PPP1CB-208ENST00000455580 PPP6R1Q9UPN7 881 aa37.7■■■■□ 3.63
PPP1CB-208ENST00000455580 ZMYM3Q14202 1370 aa37.69■■■■□ 3.62
PPP1CB-208ENST00000455580 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa37.69■■■■□ 3.62
PPP1CB-208ENST00000455580 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37.67■■■■□ 3.62
PPP1CB-208ENST00000455580 MROH2AA6NES4 1674 aa37.63■■■■□ 3.62
PPP1CB-208ENST00000455580 KIF3BO15066 747 aa37.6■■■■□ 3.61
PPP1CB-208ENST00000455580 NPATQ14207 1427 aa37.59■■■■□ 3.61
PPP1CB-208ENST00000455580 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.57■■■■□ 3.61
PPP1CB-208ENST00000455580 MAST1Q9Y2H9 1570 aa37.51■■■■□ 3.6
PPP1CB-208ENST00000455580 PTPRKQ15262 1439 aa37.48■■■■□ 3.59
PPP1CB-208ENST00000455580 DMRT2Q9Y5R5 561 aa37.46■■■■□ 3.59
PPP1CB-208ENST00000455580 STRCQ7RTU9 1775 aa37.43■■■■□ 3.58
PPP1CB-208ENST00000455580 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.42■■■■□ 3.58
PPP1CB-208ENST00000455580 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.41■■■■□ 3.58
PPP1CB-208ENST00000455580 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.41■■■■□ 3.58
PPP1CB-208ENST00000455580 ABCC5O15440 1437 aa37.39■■■■□ 3.58
PPP1CB-208ENST00000455580 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.39■■■■□ 3.58
PPP1CB-208ENST00000455580 FBXO41Q8TF61 875 aa37.37■■■■□ 3.57
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