RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000453216.1

TRAM2-AS1-201, Transcript of TRAM2 antisense RNA 1 (head to head), humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAM2-AS1, Length 664 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRMP28827 1452 aa42.68■■■■■ 4.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.67■■■■■ 4.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.66■■■■■ 4.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.65■■■■■ 4.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.65■■■■■ 4.42
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.62■■■■■ 4.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.62■■■■■ 4.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MADDQ8WXG6 1647 aa42.61■■■■■ 4.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.57■■■■■ 4.41
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.53■■■■■ 4.4
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.47■■■■■ 4.39
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.43■■■■■ 4.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ATP10AO60312 1499 aa42.42■■■■■ 4.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PREX2Q70Z35 1606 aa42.4■■■■■ 4.38
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AFAP1Q8N556 730 aa42.38■■■■■ 4.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLECQ14165 292 aa42.37■■■■■ 4.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.37■■■■■ 4.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KDM5CP41229 1560 aa42.36■■■■■ 4.37
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.3■■■■■ 4.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCC1P33527 1531 aa42.28■■■■■ 4.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.28■■■■■ 4.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.27■■■■■ 4.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.26■■■■■ 4.36
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.24■■■■■ 4.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.23■■■■■ 4.35
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.22■■■■■ 4.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.22■■■■■ 4.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.22■■■■■ 4.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.2■■■■■ 4.35
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.15■■■■■ 4.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ABCA6Q8N139 1617 aa42.14■■■■■ 4.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.14■■■■■ 4.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 REREQ9P2R6 1566 aa42.14■■■■■ 4.34
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP162Q5TB80 1403 aa42.12■■■■■ 4.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.11■■■■■ 4.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.09■■■■■ 4.33
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.05■■■■■ 4.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.04■■■■■ 4.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.03■■■■■ 4.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HSPA2P54652 639 aa42.01■■■■■ 4.32
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 AGLP35573 1532 aa42■■■■■ 4.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.99■■■■■ 4.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.97■■■■■ 4.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.97■■■■■ 4.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.96■■■■■ 4.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.95■■■■■ 4.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.89■■■■■ 4.3
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TIAM1Q13009 1591 aa41.88■■■■■ 4.3
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.8■■■■■ 4.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.8■■■■■ 4.28
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TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.78■■■■■ 4.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.76■■■■■ 4.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.76■■■■■ 4.28
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.74■■■■■ 4.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 FBXO41Q8TF61 875 aa41.73■■■■■ 4.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 A2MP01023 1474 aa41.71■■■■■ 4.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCOA2Q15596 1464 aa41.7■■■■■ 4.27
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PLXNC1O60486 1568 aa41.69■■■■■ 4.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MBD5Q9P267 1494 aa41.69■■■■■ 4.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.68■■■■■ 4.26
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MROH2AA6NES4 1674 aa41.62■■■■■ 4.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.62■■■■■ 4.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.59■■■■■ 4.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.57■■■■■ 4.25
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZMYM3Q14202 1370 aa41.56■■■■■ 4.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.54■■■■■ 4.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 GGT6Q6P531 493 aa41.54■■■■■ 4.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 STRCQ7RTU9 1775 aa41.53■■■■■ 4.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.53■■■■■ 4.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.53■■■■■ 4.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NPATQ14207 1427 aa41.52■■■■■ 4.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.5■■■■■ 4.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.46■■■■■ 4.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MAP3K1Q13233 1512 aa41.44■■■■■ 4.23
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CERKQ8TCT0 537 aa41.43■■■■■ 4.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.41■■■■■ 4.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.39■■■■■ 4.22
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRKQ15262 1439 aa41.35■■■■■ 4.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPY4P0CV99 314 aa41.35■■■■■ 4.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 TSPY10P0CW01 314 aa41.35■■■■■ 4.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 PTPRTO14522 1441 aa41.35■■■■■ 4.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 KIF3BO15066 747 aa41.33■■■■■ 4.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 NCOA1Q15788 1441 aa41.33■■■■■ 4.21
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.29■■■■■ 4.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.29■■■■■ 4.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.27■■■■■ 4.2
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 MIA2Q96PC5 1412 aa41.25■■■■■ 4.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.24■■■■■ 4.19
TRAM2-AS1-201ENST00000453216 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.21■■■■■ 4.19
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