RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446904.5

SH3BP4-206, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 829 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-206ENST00000446904 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-206ENST00000446904 MADDQ8WXG6 1647 aa16.83■□□□□ 0.28
SH3BP4-206ENST00000446904 KIF14Q15058 1648 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-206ENST00000446904 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa16.82■□□□□ 0.28
SH3BP4-206ENST00000446904 CLIP1P30622 1438 aa16.81■□□□□ 0.28
SH3BP4-206ENST00000446904 MAGI2Q86UL8 1455 aa16.8■□□□□ 0.28
SH3BP4-206ENST00000446904 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-206ENST00000446904 MLECQ14165 292 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-206ENST00000446904 PLPPR3Q6T4P5 718 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-206ENST00000446904 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.79■□□□□ 0.28
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.78■□□□□ 0.28
SH3BP4-206ENST00000446904 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP16.77■□□□□ 0.28
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 AFAP1Q8N556 730 aa16.76■□□□□ 0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP16.75■□□□□ 0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP10AO60312 1499 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC18Q5T9S5 1454 aa16.74■□□□□ 0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa16.73■□□□□ 0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 LMTK3Q96Q04 1460 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 FYCO1Q9BQS8 1478 aa16.71■□□□□ 0.27
SH3BP4-206ENST00000446904 HSPA2P54652 639 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 KDM5CP41229 1560 aa16.68■□□□□ 0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.67■□□□□ 0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 PREX2Q70Z35 1606 aa16.66■□□□□ 0.26
SH3BP4-206ENST00000446904 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCC1P33527 1531 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa16.64■□□□□ 0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 MLH3Q9UHC1 1453 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa16.63■□□□□ 0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 ABCA6Q8N139 1617 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.6■□□□□ 0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 ITSN2Q9NZM3 1697 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 MTUS2Q5JR59 1369 aa16.59■□□□□ 0.25
SH3BP4-206ENST00000446904 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.246e-7■■■■□ 20.6
SH3BP4-206ENST00000446904 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 CCNB3Q8WWL7 1395 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 REREQ9P2R6 1566 aa16.58■□□□□ 0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 CEP162Q5TB80 1403 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXO41Q8TF61 875 aa16.56■□□□□ 0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 AGLP35573 1532 aa16.55■□□□□ 0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa16.54■□□□□ 0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa16.53■□□□□ 0.24
SH3BP4-206ENST00000446904 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.52■□□□□ 0.23
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SH3BP4-206ENST00000446904 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 PREX1Q8TCU6 1659 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 ATP7AQ04656 1500 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 CNTLNQ9NXG0 1405 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 TIAM1Q13009 1591 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BP4-206ENST00000446904 C3P01024 1663 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 A2MP01023 1474 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 MBD5Q9P267 1494 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 CERKQ8TCT0 537 aa16.43■□□□□ 0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 ZMYM3Q14202 1370 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 GGT6Q6P531 493 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 NCOA2Q15596 1464 aa16.42■□□□□ 0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 PLXNC1O60486 1568 aa16.41■□□□□ 0.22
SH3BP4-206ENST00000446904 STRCQ7RTU9 1775 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 NPATQ14207 1427 aa16.38■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 VPS8Q8N3P4 1428 aa16.37■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 MROH2AA6NES4 1674 aa16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 PPP6R1Q9UPN7 881 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.35■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 ADGBQ8N7X0 1667 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPRTO14522 1441 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 PTPRKQ15262 1439 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 NCOA1Q15788 1441 aa16.34■□□□□ 0.21
SH3BP4-206ENST00000446904 KIF3BO15066 747 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-206ENST00000446904 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-206ENST00000446904 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa16.33■□□□□ 0.2
SH3BP4-206ENST00000446904 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP16.32■□□□□ 0.2
SH3BP4-206ENST00000446904 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4-206ENST00000446904 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4-206ENST00000446904 TSPY4P0CV99 314 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4-206ENST00000446904 TSPY10P0CW01 314 aa16.3■□□□□ 0.2
SH3BP4-206ENST00000446904 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-206ENST00000446904 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP16.27■□□□□ 0.2
SH3BP4-206ENST00000446904 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.26■□□□□ 0.19
SH3BP4-206ENST00000446904 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.26■□□□□ 0.19
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