RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446745.2

LTB-211, Transcript of lymphotoxin beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LTB, Length 853 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTB-211ENST00000446745 SCAPERQ9BY12 1400 aa33.78■■■■□ 3
LTB-211ENST00000446745 POGZQ7Z3K3 1410 aa33.74■■■□□ 2.99
LTB-211ENST00000446745 MAGI2Q86UL8 1455 aa33.74■■■□□ 2.99
LTB-211ENST00000446745 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa33.7■■■□□ 2.99
LTB-211ENST00000446745 PREX2Q70Z35 1606 aa33.7■■■□□ 2.99
LTB-211ENST00000446745 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.7■■■□□ 2.99
LTB-211ENST00000446745 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa33.68■■■□□ 2.98
LTB-211ENST00000446745 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa33.65■■■□□ 2.98
LTB-211ENST00000446745 MTUS2Q5JR59 1369 aa33.63■■■□□ 2.97
LTB-211ENST00000446745 BCORL1Q5H9F3 1711 aa33.61■■■□□ 2.97
LTB-211ENST00000446745 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa33.61■■■□□ 2.97
LTB-211ENST00000446745 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa33.6■■■□□ 2.97
LTB-211ENST00000446745 ADAMTSL3P82987 1691 aa33.59■■■□□ 2.97
LTB-211ENST00000446745 YEATS2Q9ULM3 1422 aa33.58■■■□□ 2.97
LTB-211ENST00000446745 ABCC1P33527 1531 aa33.54■■■□□ 2.96
LTB-211ENST00000446745 KDM5CP41229 1560 aa33.54■■■□□ 2.96
LTB-211ENST00000446745 MYT1LQ9UL68 1186 aa33.53■■■□□ 2.96
LTB-211ENST00000446745 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa33.53■■■□□ 2.96
LTB-211ENST00000446745 ATP10AO60312 1499 aa33.51■■■□□ 2.96
LTB-211ENST00000446745 CCNB3Q8WWL7 1395 aa33.51■■■□□ 2.96
LTB-211ENST00000446745 AFAP1Q8N556 730 aa33.51■■■□□ 2.95
LTB-211ENST00000446745 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP33.5■■■□□ 2.95
LTB-211ENST00000446745 ITSN2Q9NZM3 1697 aa33.5■■■□□ 2.95
LTB-211ENST00000446745 HECW2Q9P2P5 1572 aa33.5■■■□□ 2.95
LTB-211ENST00000446745 C9orf84Q5VXU9 1444 aa33.49■■■□□ 2.95
LTB-211ENST00000446745 PTPRMP28827 1452 aa33.48■■■□□ 2.95
LTB-211ENST00000446745 MADDQ8WXG6 1647 aa33.47■■■□□ 2.95
LTB-211ENST00000446745 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP33.47■■■□□ 2.95
LTB-211ENST00000446745 VPS8Q8N3P4 1428 aa33.45■■■□□ 2.95
LTB-211ENST00000446745 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
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LTB-211ENST00000446745 MLH3Q9UHC1 1453 aa33.44■■■□□ 2.94
LTB-211ENST00000446745 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa33.42■■■□□ 2.94
LTB-211ENST00000446745 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa33.42■■■□□ 2.94
LTB-211ENST00000446745 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa33.42■■■□□ 2.94
LTB-211ENST00000446745 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa33.39■■■□□ 2.94
LTB-211ENST00000446745 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP33.39■■■□□ 2.94
LTB-211ENST00000446745 TIAM1Q13009 1591 aa33.38■■■□□ 2.93
LTB-211ENST00000446745 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa33.37■■■□□ 2.93
LTB-211ENST00000446745 SYCP2Q9BX26 1530 aa33.37■■■□□ 2.93
LTB-211ENST00000446745 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa33.36■■■□□ 2.93
LTB-211ENST00000446745 MLECQ14165 292 aa33.36■■■□□ 2.93
LTB-211ENST00000446745 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
LTB-211ENST00000446745 REREQ9P2R6 1566 aa33.34■■■□□ 2.93
LTB-211ENST00000446745 ABCA6Q8N139 1617 aa33.33■■■□□ 2.93
LTB-211ENST00000446745 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.33■■■□□ 2.93
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LTB-211ENST00000446745 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa33.29■■■□□ 2.92
LTB-211ENST00000446745 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
LTB-211ENST00000446745 NCOA2Q15596 1464 aa33.27■■■□□ 2.92
LTB-211ENST00000446745 MAP3K1Q13233 1512 aa33.26■■■□□ 2.91
LTB-211ENST00000446745 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa33.24■■■□□ 2.91
LTB-211ENST00000446745 AGLP35573 1532 aa33.23■■■□□ 2.91
LTB-211ENST00000446745 ATP7AQ04656 1500 aa33.2■■■□□ 2.91
LTB-211ENST00000446745 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP33.17■■■□□ 2.9
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LTB-211ENST00000446745 PLPPR3Q6T4P5 718 aa33.17■■■□□ 2.9
LTB-211ENST00000446745 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
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LTB-211ENST00000446745 A2MP01023 1474 aa33.07■■■□□ 2.88
LTB-211ENST00000446745 CCDC141Q6ZP82 1450 aa33.07■■■□□ 2.88
LTB-211ENST00000446745 LMTK3Q96Q04 1460 aa33.07■■■□□ 2.88
LTB-211ENST00000446745 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa33.06■■■□□ 2.88
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LTB-211ENST00000446745 PLXNC1O60486 1568 aa33.03■■■□□ 2.88
LTB-211ENST00000446745 ARHGEF5Q12774 1597 aa33■■■□□ 2.87
LTB-211ENST00000446745 MYOM3Q5VTT5 1437 aa32.98■■■□□ 2.87
LTB-211ENST00000446745 MIA2Q96PC5 1412 aa32.98■■■□□ 2.87
LTB-211ENST00000446745 PREX1Q8TCU6 1659 aa32.97■■■□□ 2.87
LTB-211ENST00000446745 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
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LTB-211ENST00000446745 TSPY10P0CW01 314 aa32.96■■■□□ 2.87
LTB-211ENST00000446745 C3P01024 1663 aa32.95■■■□□ 2.87
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LTB-211ENST00000446745 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP32.9■■■□□ 2.86
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LTB-211ENST00000446745 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa32.88■■■□□ 2.85
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LTB-211ENST00000446745 HSPA2P54652 639 aa32.86■■■□□ 2.85
LTB-211ENST00000446745 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP32.83■■■□□ 2.85
LTB-211ENST00000446745 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.82■■■□□ 2.84
LTB-211ENST00000446745 ZMYM3Q14202 1370 aa32.82■■■□□ 2.84
LTB-211ENST00000446745 NPATQ14207 1427 aa32.79■■■□□ 2.84
LTB-211ENST00000446745 KIF3BO15066 747 aa32.78■■■□□ 2.84
LTB-211ENST00000446745 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.77■■■□□ 2.84
LTB-211ENST00000446745 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.75■■■□□ 2.83
LTB-211ENST00000446745 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.73■■■□□ 2.83
LTB-211ENST00000446745 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.68■■■□□ 2.82
LTB-211ENST00000446745 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.68■■■□□ 2.82
LTB-211ENST00000446745 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.68■■■□□ 2.82
LTB-211ENST00000446745 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.67■■■□□ 2.82
LTB-211ENST00000446745 DMRT2Q9Y5R5 561 aa32.66■■■□□ 2.82
LTB-211ENST00000446745 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.66■■■□□ 2.82
LTB-211ENST00000446745 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.65■■■□□ 2.82
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