RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445160.2

BDH1-208, Transcript of 3-hydroxybutyrate dehydrogenase 1, human

TSL 5

Gene BDH1, Length 539 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BDH1-208	ENST00000445160	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		32.91	■■■□□ 2.86
BDH1-208	ENST00000445160	MAGI2	Q86UL8	1455 aa		32.91	■■■□□ 2.86
BDH1-208	ENST00000445160	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		32.9	■■■□□ 2.86
BDH1-208	ENST00000445160	SCAPER	Q9BY12	1400 aa		32.89	■■■□□ 2.86
BDH1-208	ENST00000445160	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	32.88	■■■□□ 2.85
BDH1-208	ENST00000445160	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		32.88	■■■□□ 2.85
BDH1-208	ENST00000445160	PTPRM	P28827	1452 aa		32.87	■■■□□ 2.85
BDH1-208	ENST00000445160	POGZ	Q7Z3K3	1410 aa		32.86	■■■□□ 2.85
BDH1-208	ENST00000445160	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.84	■■■□□ 2.85
BDH1-208	ENST00000445160	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		32.82	■■■□□ 2.84
BDH1-208	ENST00000445160	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		32.8	■■■□□ 2.84
BDH1-208	ENST00000445160	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.79	■■■□□ 2.84
BDH1-208	ENST00000445160	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		32.77	■■■□□ 2.84
BDH1-208	ENST00000445160	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	32.75	■■■□□ 2.83
BDH1-208	ENST00000445160	ZNF518A	Q6AHZ1	1483 aa		32.74	■■■□□ 2.83
BDH1-208	ENST00000445160	PREX2	Q70Z35	1606 aa		32.73	■■■□□ 2.83
BDH1-208	ENST00000445160	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.71	■■■□□ 2.83
BDH1-208	ENST00000445160	ATP10A	O60312	1499 aa		32.7	■■■□□ 2.83
BDH1-208	ENST00000445160	KDM5C	P41229	1560 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BDH1-208	ENST00000445160	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		32.67	■■■□□ 2.82
BDH1-208	ENST00000445160	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BDH1-208	ENST00000445160	FER1L4	A9Z1Z3	1794 aa		32.65	■■■□□ 2.82
BDH1-208	ENST00000445160	AFAP1	Q8N556	730 aa		32.62	■■■□□ 2.81
BDH1-208	ENST00000445160	MYT1L	Q9UL68	1186 aa		32.6	■■■□□ 2.81
BDH1-208	ENST00000445160	MLEC	Q14165	292 aa		32.59	■■■□□ 2.81
BDH1-208	ENST00000445160	ABCC1	P33527	1531 aa		32.59	■■■□□ 2.81
BDH1-208	ENST00000445160	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		32.59	■■■□□ 2.81
BDH1-208	ENST00000445160	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BDH1-208	ENST00000445160	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.54	■■■□□ 2.8
BDH1-208	ENST00000445160	ARHGEF12	Q9NZN5	1544 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BDH1-208	ENST00000445160	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BDH1-208	ENST00000445160	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		32.52	■■■□□ 2.8
BDH1-208	ENST00000445160	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.52	■■■□□ 2.8
BDH1-208	ENST00000445160	TRAPPC8	Q9Y2L5	1435 aa		32.5	■■■□□ 2.79
BDH1-208	ENST00000445160	PLPPR3	Q6T4P5	718 aa		32.49	■■■□□ 2.79
BDH1-208	ENST00000445160	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.48	■■■□□ 2.79
BDH1-208	ENST00000445160	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		32.47	■■■□□ 2.79
BDH1-208	ENST00000445160	GPATCH8	Q9UKJ3	1502 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
BDH1-208	ENST00000445160	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	32.47	■■■□□ 2.79
BDH1-208	ENST00000445160	ZNF777	Q9ULD5	760 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
BDH1-208	ENST00000445160	SAMD9L	Q8IVG5	1584 aa		32.44	■■■□□ 2.78
BDH1-208	ENST00000445160	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		32.43	■■■□□ 2.78
BDH1-208	ENST00000445160	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		32.43	■■■□□ 2.78
BDH1-208	ENST00000445160	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		32.4	■■■□□ 2.78
BDH1-208	ENST00000445160	AGL	P35573	1532 aa		32.4	■■■□□ 2.78
BDH1-208	ENST00000445160	CFDP1	Q9UEE9	299 aa	Predicted RBP	32.39	■■■□□ 2.78
BDH1-208	ENST00000445160	SYCP2	Q9BX26	1530 aa		32.39	■■■□□ 2.78
BDH1-208	ENST00000445160	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		32.36	■■■□□ 2.77
BDH1-208	ENST00000445160	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	32.36	■■■□□ 2.77
BDH1-208	ENST00000445160	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		32.35	■■■□□ 2.77
BDH1-208	ENST00000445160	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		32.35	■■■□□ 2.77
BDH1-208	ENST00000445160	SPAG9	O60271	1321 aa	Known RBP	32.32	■■■□□ 2.76
BDH1-208	ENST00000445160	APLP2	Q06481	763 aa		32.32	■■■□□ 2.76
BDH1-208	ENST00000445160	HNRNPM	P52272	730 aa	Known RBP eCLIP	32.31	■■■□□ 2.76
BDH1-208	ENST00000445160	HSPA2	P54652	639 aa		32.31	■■■□□ 2.76
BDH1-208	ENST00000445160	ESF1	Q9H501	851 aa	Known RBP	32.31	■■■□□ 2.76
BDH1-208	ENST00000445160	MAP3K1	Q13233	1512 aa		32.31	■■■□□ 2.76
BDH1-208	ENST00000445160	TIAM1	Q13009	1591 aa		32.28	■■■□□ 2.76
BDH1-208	ENST00000445160	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	32.28	■■■□□ 2.76
BDH1-208	ENST00000445160	ATP7A	Q04656	1500 aa		32.26	■■■□□ 2.76
BDH1-208	ENST00000445160	C3	P01024	1663 aa		32.24	■■■□□ 2.75
BDH1-208	ENST00000445160	INO80	Q9ULG1	1556 aa	Predicted RBP	32.24	■■■□□ 2.75
BDH1-208	ENST00000445160	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.22	■■■□□ 2.75
BDH1-208	ENST00000445160	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	32.22	■■■□□ 2.75
BDH1-208	ENST00000445160	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.18	■■■□□ 2.74
BDH1-208	ENST00000445160	ADGB	Q8N7X0	1667 aa		32.17	■■■□□ 2.74
BDH1-208	ENST00000445160	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.15	■■■□□ 2.74
BDH1-208	ENST00000445160	A2M	P01023	1474 aa		32.15	■■■□□ 2.74
BDH1-208	ENST00000445160	FBXO41	Q8TF61	875 aa		32.14	■■■□□ 2.74
BDH1-208	ENST00000445160	PLXNC1	O60486	1568 aa		32.14	■■■□□ 2.74
BDH1-208	ENST00000445160	NCOA2	Q15596	1464 aa		32.13	■■■□□ 2.73
BDH1-208	ENST00000445160	ZNF644	Q9H582	1327 aa	Predicted RBP	32.13	■■■□□ 2.73
BDH1-208	ENST00000445160	LRRC9	Q6ZRR7	1453 aa		32.11	■■■□□ 2.73
BDH1-208	ENST00000445160	MBD5	Q9P267	1494 aa		32.11	■■■□□ 2.73
BDH1-208	ENST00000445160	RTEL1-TNFRSF6B	F6WH68	1400 aa		32.08	■■■□□ 2.73
BDH1-208	ENST00000445160	RSPH4A	Q5TD94	716 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BDH1-208	ENST00000445160	DMRT2	Q9Y5R5	561 aa		32.05	■■■□□ 2.72
BDH1-208	ENST00000445160	STRC	Q7RTU9	1775 aa		32.04	■■■□□ 2.72
BDH1-208	ENST00000445160	CLTC	Q00610	1675 aa	Known RBP	32.04	■■■□□ 2.72
BDH1-208	ENST00000445160	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		32.03	■■■□□ 2.72
BDH1-208	ENST00000445160	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		32.03	■■■□□ 2.72
BDH1-208	ENST00000445160	NPAT	Q14207	1427 aa		32.02	■■■□□ 2.72
BDH1-208	ENST00000445160	ZMYM3	Q14202	1370 aa		32.02	■■■□□ 2.72
BDH1-208	ENST00000445160	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		32.01	■■■□□ 2.71
BDH1-208	ENST00000445160	KANK4	Q5T7N3	995 aa	Predicted RBP	32	■■■□□ 2.71
BDH1-208	ENST00000445160	GGT6	Q6P531	493 aa		31.99	■■■□□ 2.71
BDH1-208	ENST00000445160	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	31.95	■■■□□ 2.71
BDH1-208	ENST00000445160	ARHGEF5	Q12774	1597 aa		31.95	■■■□□ 2.71
BDH1-208	ENST00000445160	TSPY4	P0CV99	314 aa		31.9	■■■□□ 2.7
BDH1-208	ENST00000445160	TSPY10	P0CW01	314 aa		31.9	■■■□□ 2.7
BDH1-208	ENST00000445160	CERK	Q8TCT0	537 aa		31.9	■■■□□ 2.7
BDH1-208	ENST00000445160	PTPRT	O14522	1441 aa		31.88	■■■□□ 2.69
BDH1-208	ENST00000445160	PTPRK	Q15262	1439 aa		31.85	■■■□□ 2.69
BDH1-208	ENST00000445160	ZNF142	P52746	1687 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
BDH1-208	ENST00000445160	FAM135A	Q9P2D6	1515 aa		31.85	■■■□□ 2.69
BDH1-208	ENST00000445160	KIF3B	O15066	747 aa		31.84	■■■□□ 2.69
BDH1-208	ENST00000445160	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		31.84	■■■□□ 2.69
BDH1-208	ENST00000445160	NCOA1	Q15788	1441 aa		31.83	■■■□□ 2.69
BDH1-208	ENST00000445160	MIA2	Q96PC5	1412 aa		31.83	■■■□□ 2.69
BDH1-208	ENST00000445160	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		31.82	■■■□□ 2.69

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