RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440289.6

PTPRJ-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 3,158 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-202ENST00000440289 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.88■■□□□ 1.57
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PTPRJ-202ENST00000440289 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.86■■□□□ 1.57
PTPRJ-202ENST00000440289 ERCC6Q03468 1493 aa24.85■■□□□ 1.57
PTPRJ-202ENST00000440289 CCDC7Q96M83 1385 aa24.83■■□□□ 1.57
PTPRJ-202ENST00000440289 SAMD9Q5K651 1589 aa24.83■■□□□ 1.56
PTPRJ-202ENST00000440289 GRIN2BQ13224 1484 aa24.82■■□□□ 1.56
PTPRJ-202ENST00000440289 KDM6BO15054 1643 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRJ-202ENST00000440289 TMC1Q8TDI8 760 aa24.81■■□□□ 1.56
PTPRJ-202ENST00000440289 CNTLNQ9NXG0 1405 aa24.8■■□□□ 1.56
PTPRJ-202ENST00000440289 PBRM1Q86U86 1689 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-202ENST00000440289 AKNAQ7Z591 1439 aa24.79■■□□□ 1.56
PTPRJ-202ENST00000440289 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
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PTPRJ-202ENST00000440289 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-202ENST00000440289 IQGAP2Q13576 1575 aa24.74■■□□□ 1.55
PTPRJ-202ENST00000440289 PKD2Q13563 968 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ADAMTS12P58397 1594 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-202ENST00000440289 FANCIQ9NVI1 1328 aa24.73■■□□□ 1.55
PTPRJ-202ENST00000440289 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.72■■□□□ 1.55
PTPRJ-202ENST00000440289 IFT140Q96RY7 1462 aa24.71■■□□□ 1.55
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PTPRJ-202ENST00000440289 CARD11Q9BXL7 1154 aa24.68■■□□□ 1.54
PTPRJ-202ENST00000440289 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
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PTPRJ-202ENST00000440289 WDR62O43379 1518 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 UGGT2Q9NYU1 1516 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP24.62■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 KDM5BQ9UGL1 1544 aa24.62■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.61■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.6■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 NUDCQ9Y266 331 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 NCOA1Q15788 1441 aa24.59■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 USP47Q96K76 1375 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 SKAP1Q86WV1 359 aa24.58■■□□□ 1.53
PTPRJ-202ENST00000440289 GRIN2AQ12879 1464 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-202ENST00000440289 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa24.57■■□□□ 1.52
PTPRJ-202ENST00000440289 DISP1Q96F81 1524 aa24.56■■□□□ 1.52
PTPRJ-202ENST00000440289 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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PTPRJ-202ENST00000440289 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa24.55■■□□□ 1.52
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PTPRJ-202ENST00000440289 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP24.54■■□□□ 1.52
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PTPRJ-202ENST00000440289 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.52■■□□□ 1.52
PTPRJ-202ENST00000440289 DAPK1P53355 1430 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.5■■□□□ 1.51
PTPRJ-202ENST00000440289 ABCC5O15440 1437 aa24.49■■□□□ 1.51
PTPRJ-202ENST00000440289 NUP155O75694 1391 aa24.48■■□□□ 1.51
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PTPRJ-202ENST00000440289 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.47■■□□□ 1.51
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PTPRJ-202ENST00000440289 KIAA0556O60303 1618 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRJ-202ENST00000440289 ARHGEF11O15085 1522 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.45■■□□□ 1.5
PTPRJ-202ENST00000440289 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRJ-202ENST00000440289 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
PTPRJ-202ENST00000440289 TSPY4P0CV99 314 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRJ-202ENST00000440289 TSPY10P0CW01 314 aa24.43■■□□□ 1.5
PTPRJ-202ENST00000440289 CEP170Q5SW79 1584 aa24.42■■□□□ 1.5
PTPRJ-202ENST00000440289 SYNJ2O15056 1496 aa24.39■■□□□ 1.5
PTPRJ-202ENST00000440289 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.38■■□□□ 1.49
PTPRJ-202ENST00000440289 MIA2Q96PC5 1412 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-202ENST00000440289 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.37■■□□□ 1.49
PTPRJ-202ENST00000440289 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-202ENST00000440289 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.36■■□□□ 1.49
PTPRJ-202ENST00000440289 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
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PTPRJ-202ENST00000440289 TEX14Q8IWB6 1497 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-202ENST00000440289 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.34■■□□□ 1.49
PTPRJ-202ENST00000440289 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa24.33■■□□□ 1.48
PTPRJ-202ENST00000440289 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
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PTPRJ-202ENST00000440289 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
PTPRJ-202ENST00000440289 SLC4A3P48751 1232 aa24.31■■□□□ 1.48
PTPRJ-202ENST00000440289 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa24.3■■□□□ 1.48
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PTPRJ-202ENST00000440289 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.28■■□□□ 1.48
PTPRJ-202ENST00000440289 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-202ENST00000440289 NEFMP07197 916 aa24.27■■□□□ 1.48
PTPRJ-202ENST00000440289 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.26■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.25■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 PDE4AP27815 886 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 KIF15Q9NS87 1388 aa24.23■■□□□ 1.47
PTPRJ-202ENST00000440289 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
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