RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439106.5

PRAME-209, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 891 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-209ENST00000439106 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.39■■□□□ 1.17
PRAME-209ENST00000439106 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.39■■□□□ 1.17
PRAME-209ENST00000439106 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.37■■□□□ 1.17
PRAME-209ENST00000439106 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.35■■□□□ 1.17
PRAME-209ENST00000439106 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.35■■□□□ 1.17
PRAME-209ENST00000439106 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.34■■□□□ 1.17
PRAME-209ENST00000439106 ADAMTSL3P82987 1691 aa22.34■■□□□ 1.17
PRAME-209ENST00000439106 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.33■■□□□ 1.17
PRAME-209ENST00000439106 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.33■■□□□ 1.17
PRAME-209ENST00000439106 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.32■■□□□ 1.16
PRAME-209ENST00000439106 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.31■■□□□ 1.16
PRAME-209ENST00000439106 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.3■■□□□ 1.16
PRAME-209ENST00000439106 MADDQ8WXG6 1647 aa22.3■■□□□ 1.16
PRAME-209ENST00000439106 ABCC1P33527 1531 aa22.26■■□□□ 1.15
PRAME-209ENST00000439106 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
PRAME-209ENST00000439106 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PRAME-209ENST00000439106 KDM5CP41229 1560 aa22.25■■□□□ 1.15
PRAME-209ENST00000439106 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.23■■□□□ 1.15
PRAME-209ENST00000439106 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.23■■□□□ 1.15
PRAME-209ENST00000439106 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.23■■□□□ 1.15
PRAME-209ENST00000439106 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.22■■□□□ 1.15
PRAME-209ENST00000439106 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.22■■□□□ 1.15
PRAME-209ENST00000439106 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa22.21■■□□□ 1.15
PRAME-209ENST00000439106 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.2■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 ABCA6Q8N139 1617 aa22.2■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa22.2■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 AFAP1Q8N556 730 aa22.19■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 PTPRMP28827 1452 aa22.19■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 TIAM1Q13009 1591 aa22.18■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.18■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.18■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.17■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.16■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 ATP10AO60312 1499 aa22.15■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.14■■□□□ 1.14
PRAME-209ENST00000439106 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.13■■□□□ 1.13
PRAME-209ENST00000439106 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRAME-209ENST00000439106 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.13■■□□□ 1.13
PRAME-209ENST00000439106 CCNB3Q8WWL7 1395 aa22.12■■□□□ 1.13
PRAME-209ENST00000439106 MLECQ14165 292 aa22.12■■□□□ 1.13
PRAME-209ENST00000439106 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.09■■□□□ 1.13
PRAME-209ENST00000439106 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.07■■□□□ 1.12
PRAME-209ENST00000439106 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
PRAME-209ENST00000439106 REREQ9P2R6 1566 aa22.06■■□□□ 1.12
PRAME-209ENST00000439106 NCOA2Q15596 1464 aa22.05■■□□□ 1.12
PRAME-209ENST00000439106 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.05■■□□□ 1.123e-11■□□□□ 9.5
PRAME-209ENST00000439106 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
PRAME-209ENST00000439106 ATP7AQ04656 1500 aa22.02■■□□□ 1.12
PRAME-209ENST00000439106 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
PRAME-209ENST00000439106 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.02■■□□□ 1.12
PRAME-209ENST00000439106 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22■■□□□ 1.11
PRAME-209ENST00000439106 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa21.99■■□□□ 1.11
PRAME-209ENST00000439106 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa21.96■■□□□ 1.11
PRAME-209ENST00000439106 LMTK3Q96Q04 1460 aa21.96■■□□□ 1.11
PRAME-209ENST00000439106 AGLP35573 1532 aa21.96■■□□□ 1.11
PRAME-209ENST00000439106 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PRAME-209ENST00000439106 C3P01024 1663 aa21.95■■□□□ 1.1
PRAME-209ENST00000439106 ADGBQ8N7X0 1667 aa21.95■■□□□ 1.1
PRAME-209ENST00000439106 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PRAME-209ENST00000439106 MBD5Q9P267 1494 aa21.95■■□□□ 1.1
PRAME-209ENST00000439106 MAP3K1Q13233 1512 aa21.93■■□□□ 1.1
PRAME-209ENST00000439106 PLXNC1O60486 1568 aa21.92■■□□□ 1.1
PRAME-209ENST00000439106 PREX1Q8TCU6 1659 aa21.91■■□□□ 1.1
PRAME-209ENST00000439106 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PRAME-209ENST00000439106 A2MP01023 1474 aa21.88■■□□□ 1.09
PRAME-209ENST00000439106 CCDC141Q6ZP82 1450 aa21.88■■□□□ 1.09
PRAME-209ENST00000439106 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PRAME-209ENST00000439106 ARHGEF5Q12774 1597 aa21.85■■□□□ 1.09
PRAME-209ENST00000439106 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
PRAME-209ENST00000439106 HSPA2P54652 639 aa21.84■■□□□ 1.09
PRAME-209ENST00000439106 MROH2AA6NES4 1674 aa21.84■■□□□ 1.09
PRAME-209ENST00000439106 MYOM3Q5VTT5 1437 aa21.81■■□□□ 1.08
PRAME-209ENST00000439106 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa21.8■■□□□ 1.08
PRAME-209ENST00000439106 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PRAME-209ENST00000439106 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.77■■□□□ 1.08
PRAME-209ENST00000439106 APLP2Q06481 763 aa21.77■■□□□ 1.08
PRAME-209ENST00000439106 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.77■■□□□ 1.07
PRAME-209ENST00000439106 MAST1Q9Y2H9 1570 aa21.75■■□□□ 1.07
PRAME-209ENST00000439106 CNTLNQ9NXG0 1405 aa21.75■■□□□ 1.07
PRAME-209ENST00000439106 GGT6Q6P531 493 aa21.75■■□□□ 1.07
PRAME-209ENST00000439106 MIA2Q96PC5 1412 aa21.74■■□□□ 1.07
PRAME-209ENST00000439106 STRCQ7RTU9 1775 aa21.73■■□□□ 1.07
PRAME-209ENST00000439106 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa21.72■■□□□ 1.07
PRAME-209ENST00000439106 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PRAME-209ENST00000439106 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.69■■□□□ 1.06
PRAME-209ENST00000439106 ZMYM3Q14202 1370 aa21.69■■□□□ 1.06
PRAME-209ENST00000439106 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.68■■□□□ 1.06
PRAME-209ENST00000439106 TSPY4P0CV99 314 aa21.67■■□□□ 1.06
PRAME-209ENST00000439106 TSPY10P0CW01 314 aa21.67■■□□□ 1.06
PRAME-209ENST00000439106 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
PRAME-209ENST00000439106 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.66■■□□□ 1.06
PRAME-209ENST00000439106 KIF3BO15066 747 aa21.66■■□□□ 1.06
PRAME-209ENST00000439106 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
PRAME-209ENST00000439106 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PRAME-209ENST00000439106 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
PRAME-209ENST00000439106 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.64■■□□□ 1.05
PRAME-209ENST00000439106 CEP152O94986 1710 aa21.63■■□□□ 1.05
PRAME-209ENST00000439106 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
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