RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432588.5

ACTB-205, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-205ENST00000432588 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.45■■□□□ 1.82
ACTB-205ENST00000432588 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.45■■□□□ 1.82
ACTB-205ENST00000432588 MADDQ8WXG6 1647 aa26.44■■□□□ 1.82
ACTB-205ENST00000432588 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.42■■□□□ 1.82
ACTB-205ENST00000432588 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa26.39■■□□□ 1.81
ACTB-205ENST00000432588 CCDC18Q5T9S5 1454 aa26.37■■□□□ 1.81
ACTB-205ENST00000432588 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
ACTB-205ENST00000432588 ARHGAP5Q13017 1502 aa26.37■■□□□ 1.81
ACTB-205ENST00000432588 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.36■■□□□ 1.81
ACTB-205ENST00000432588 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
ACTB-205ENST00000432588 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
ACTB-205ENST00000432588 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.33■■□□□ 1.81
ACTB-205ENST00000432588 ATP10AO60312 1499 aa26.31■■□□□ 1.8
ACTB-205ENST00000432588 FYCO1Q9BQS8 1478 aa26.3■■□□□ 1.8
ACTB-205ENST00000432588 MLECQ14165 292 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-205ENST00000432588 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.29■■□□□ 1.8
ACTB-205ENST00000432588 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.28■■□□□ 1.8
ACTB-205ENST00000432588 AFAP1Q8N556 730 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-205ENST00000432588 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.26■■□□□ 1.79
ACTB-205ENST00000432588 LMTK3Q96Q04 1460 aa26.25■■□□□ 1.79
ACTB-205ENST00000432588 KDM5CP41229 1560 aa26.24■■□□□ 1.79
ACTB-205ENST00000432588 PLPPR3Q6T4P5 718 aa26.24■■□□□ 1.79
ACTB-205ENST00000432588 PREX2Q70Z35 1606 aa26.23■■□□□ 1.79
ACTB-205ENST00000432588 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.22■■□□□ 1.79
ACTB-205ENST00000432588 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa26.21■■□□□ 1.79
ACTB-205ENST00000432588 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.19■■□□□ 1.78
ACTB-205ENST00000432588 ABCC1P33527 1531 aa26.18■■□□□ 1.78
ACTB-205ENST00000432588 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.17■■□□□ 1.78
ACTB-205ENST00000432588 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.14■■□□□ 1.78
ACTB-205ENST00000432588 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.14■■□□□ 1.77
ACTB-205ENST00000432588 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.13■■□□□ 1.77
ACTB-205ENST00000432588 REREQ9P2R6 1566 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-205ENST00000432588 ITSN2Q9NZM3 1697 aa26.12■■□□□ 1.77
ACTB-205ENST00000432588 HSPA2P54652 639 aa26.1■■□□□ 1.77
ACTB-205ENST00000432588 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
ACTB-205ENST00000432588 ABCA6Q8N139 1617 aa26.09■■□□□ 1.77
ACTB-205ENST00000432588 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
ACTB-205ENST00000432588 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.06■■□□□ 1.76
ACTB-205ENST00000432588 AGLP35573 1532 aa26.04■■□□□ 1.76
ACTB-205ENST00000432588 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
ACTB-205ENST00000432588 FBXO41Q8TF61 875 aa26.04■■□□□ 1.76
ACTB-205ENST00000432588 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
ACTB-205ENST00000432588 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
ACTB-205ENST00000432588 CCNB3Q8WWL7 1395 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-205ENST00000432588 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.03■■□□□ 1.76
ACTB-205ENST00000432588 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.01■■□□□ 1.75
ACTB-205ENST00000432588 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.01■■□□□ 1.75
ACTB-205ENST00000432588 SYCP2Q9BX26 1530 aa26.01■■□□□ 1.75
ACTB-205ENST00000432588 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.01■■□□□ 1.75
ACTB-205ENST00000432588 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
ACTB-205ENST00000432588 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.753e-29■□□□□ 9.6
ACTB-205ENST00000432588 CEP162Q5TB80 1403 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTB-205ENST00000432588 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.98■■□□□ 1.75
ACTB-205ENST00000432588 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.96■■□□□ 1.75
ACTB-205ENST00000432588 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.94■■□□□ 1.74
ACTB-205ENST00000432588 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa25.93■■□□□ 1.74
ACTB-205ENST00000432588 ATP7AQ04656 1500 aa25.91■■□□□ 1.74
ACTB-205ENST00000432588 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
ACTB-205ENST00000432588 C3P01024 1663 aa25.9■■□□□ 1.74
ACTB-205ENST00000432588 TIAM1Q13009 1591 aa25.88■■□□□ 1.73
ACTB-205ENST00000432588 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
ACTB-205ENST00000432588 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.87■■□□□ 1.73
ACTB-205ENST00000432588 A2MP01023 1474 aa25.85■■□□□ 1.73
ACTB-205ENST00000432588 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
ACTB-205ENST00000432588 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
ACTB-205ENST00000432588 PLXNC1O60486 1568 aa25.82■■□□□ 1.72
ACTB-205ENST00000432588 MROH2AA6NES4 1674 aa25.8■■□□□ 1.72
ACTB-205ENST00000432588 CERKQ8TCT0 537 aa25.8■■□□□ 1.72
ACTB-205ENST00000432588 NPATQ14207 1427 aa25.79■■□□□ 1.72
ACTB-205ENST00000432588 MBD5Q9P267 1494 aa25.79■■□□□ 1.72
ACTB-205ENST00000432588 ZMYM3Q14202 1370 aa25.78■■□□□ 1.72
ACTB-205ENST00000432588 NCOA2Q15596 1464 aa25.77■■□□□ 1.72
ACTB-205ENST00000432588 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.77■■□□□ 1.72
ACTB-205ENST00000432588 STRCQ7RTU9 1775 aa25.77■■□□□ 1.72
ACTB-205ENST00000432588 GGT6Q6P531 493 aa25.76■■□□□ 1.71
ACTB-205ENST00000432588 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.76■■□□□ 1.71
ACTB-205ENST00000432588 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.74■■□□□ 1.71
ACTB-205ENST00000432588 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTB-205ENST00000432588 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.72■■□□□ 1.71
ACTB-205ENST00000432588 PTPRTO14522 1441 aa25.71■■□□□ 1.71
ACTB-205ENST00000432588 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
ACTB-205ENST00000432588 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.71■■□□□ 1.71
ACTB-205ENST00000432588 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.71■■□□□ 1.71
ACTB-205ENST00000432588 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.7■■□□□ 1.7
ACTB-205ENST00000432588 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
ACTB-205ENST00000432588 NCOA1Q15788 1441 aa25.67■■□□□ 1.7
ACTB-205ENST00000432588 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.66■■□□□ 1.7
ACTB-205ENST00000432588 PTPRKQ15262 1439 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTB-205ENST00000432588 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.63■■□□□ 1.69
ACTB-205ENST00000432588 TSPY4P0CV99 314 aa25.62■■□□□ 1.69
ACTB-205ENST00000432588 TSPY10P0CW01 314 aa25.62■■□□□ 1.69
ACTB-205ENST00000432588 KIF3BO15066 747 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-205ENST00000432588 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.61■■□□□ 1.69
ACTB-205ENST00000432588 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.59■■□□□ 1.69
ACTB-205ENST00000432588 MAP3K1Q13233 1512 aa25.58■■□□□ 1.69
ACTB-205ENST00000432588 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.58■■□□□ 1.68
ACTB-205ENST00000432588 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
ACTB-205ENST00000432588 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.56■■□□□ 1.68
ACTB-205ENST00000432588 PLA2R1Q13018 1463 aa25.54■■□□□ 1.68
ACTB-205ENST00000432588 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.54■■□□□ 1.68
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