RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432502.1

NUP50-AS1-202, humanhuman

TSL 2

Gene NUP50-AS1, Length 596 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-202ENST00000432502 POGZQ7Z3K3 1410 aa31.9■■■□□ 2.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa31.89■■■□□ 2.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CLIP1P30622 1438 aa31.89■■■□□ 2.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa31.89■■■□□ 2.7
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP31.88■■■□□ 2.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 YEATS2Q9ULM3 1422 aa31.87■■■□□ 2.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCDC18Q5T9S5 1454 aa31.86■■■□□ 2.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MADDQ8WXG6 1647 aa31.86■■■□□ 2.69
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa31.8■■■□□ 2.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ARHGAP5Q13017 1502 aa31.79■■■□□ 2.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.78■■■□□ 2.68
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.74■■■□□ 2.67
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.73■■■□□ 2.67
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP31.73■■■□□ 2.67
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ATP10AO60312 1499 aa31.72■■■□□ 2.67
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KDM5CP41229 1560 aa31.71■■■□□ 2.67
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PREX2Q70Z35 1606 aa31.71■■■□□ 2.67
NUP50-AS1-202ENST00000432502 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.67■■■□□ 2.66
NUP50-AS1-202ENST00000432502 AFAP1Q8N556 730 aa31.66■■■□□ 2.66
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ABCC1P33527 1531 aa31.62■■■□□ 2.65
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.61■■■□□ 2.65
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.6■■■□□ 2.65
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.6■■■□□ 2.65
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.59■■■□□ 2.65
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MLECQ14165 292 aa31.59■■■□□ 2.65
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.59■■■□□ 2.65
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP31.57■■■□□ 2.64
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.57■■■□□ 2.64
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.56■■■□□ 2.64
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.56■■■□□ 2.64
NUP50-AS1-202ENST00000432502 REREQ9P2R6 1566 aa31.55■■■□□ 2.64
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.52■■■□□ 2.64
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ABCA6Q8N139 1617 aa31.51■■■□□ 2.63
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.49■■■□□ 2.63
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.47■■■□□ 2.63
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.46■■■□□ 2.63
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CEP162Q5TB80 1403 aa31.46■■■□□ 2.63
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.45■■■□□ 2.62
NUP50-AS1-202ENST00000432502 AGLP35573 1532 aa31.44■■■□□ 2.62
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.43■■■□□ 2.62
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.41■■■□□ 2.62
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.41■■■□□ 2.62
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.4■■■□□ 2.62
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.4■■■□□ 2.62
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
NUP50-AS1-202ENST00000432502 HSPA2P54652 639 aa31.37■■■□□ 2.61
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.37■■■□□ 2.61
NUP50-AS1-202ENST00000432502 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.35■■■□□ 2.61
NUP50-AS1-202ENST00000432502 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.35■■■□□ 2.61
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.34■■■□□ 2.61
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.32■■■□□ 2.6
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TIAM1Q13009 1591 aa31.31■■■□□ 2.6
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.31■■■□□ 2.6
NUP50-AS1-202ENST00000432502 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.27■■■□□ 2.6
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.27■■■□□ 2.6
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ATP7AQ04656 1500 aa31.27■■■□□ 2.6
NUP50-AS1-202ENST00000432502 C3P01024 1663 aa31.25■■■□□ 2.59
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.23■■■□□ 2.59
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.22■■■□□ 2.59
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PLXNC1O60486 1568 aa31.21■■■□□ 2.59
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.21■■■□□ 2.59
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MBD5Q9P267 1494 aa31.21■■■□□ 2.59
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FBXO41Q8TF61 875 aa31.2■■■□□ 2.59
NUP50-AS1-202ENST00000432502 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.2■■■□□ 2.59
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.18■■■□□ 2.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 A2MP01023 1474 aa31.17■■■□□ 2.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.17■■■□□ 2.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NCOA2Q15596 1464 aa31.16■■■□□ 2.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.15■■■□□ 2.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MROH2AA6NES4 1674 aa31.14■■■□□ 2.58
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.11■■■□□ 2.57
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.11■■■□□ 2.57
NUP50-AS1-202ENST00000432502 STRCQ7RTU9 1775 aa31.09■■■□□ 2.57
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NPATQ14207 1427 aa31.07■■■□□ 2.57
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZMYM3Q14202 1370 aa31.07■■■□□ 2.56
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.06■■■□□ 2.56
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.04■■■□□ 2.56
NUP50-AS1-202ENST00000432502 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.04■■■□□ 2.56
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.03■■■□□ 2.56
NUP50-AS1-202ENST00000432502 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.02■■■□□ 2.56
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.02■■■□□ 2.56
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MAP3K1Q13233 1512 aa31.01■■■□□ 2.55
NUP50-AS1-202ENST00000432502 GGT6Q6P531 493 aa31■■■□□ 2.55
NUP50-AS1-202ENST00000432502 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CERKQ8TCT0 537 aa30.97■■■□□ 2.55
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ARHGEF5Q12774 1597 aa30.96■■■□□ 2.55
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PTPRTO14522 1441 aa30.94■■■□□ 2.54
NUP50-AS1-202ENST00000432502 PTPRKQ15262 1439 aa30.94■■■□□ 2.54
NUP50-AS1-202ENST00000432502 NCOA1Q15788 1441 aa30.92■■■□□ 2.54
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP30.92■■■□□ 2.54
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.87■■■□□ 2.53
NUP50-AS1-202ENST00000432502 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
NUP50-AS1-202ENST00000432502 KIF3BO15066 747 aa30.86■■■□□ 2.53
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TSPY4P0CV99 314 aa30.86■■■□□ 2.53
NUP50-AS1-202ENST00000432502 TSPY10P0CW01 314 aa30.86■■■□□ 2.53
NUP50-AS1-202ENST00000432502 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.85■■■□□ 2.53
NUP50-AS1-202ENST00000432502 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.85■■■□□ 2.53
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.84■■■□□ 2.53
NUP50-AS1-202ENST00000432502 MIA2Q96PC5 1412 aa30.84■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.3 ms