RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431155.1

GRAMD4-204, Transcript of GRAM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene GRAMD4, Length 311 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4-204ENST00000431155 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa48.56■■■■■ 5.36
GRAMD4-204ENST00000431155 PREX2Q70Z35 1606 aa48.54■■■■■ 5.36
GRAMD4-204ENST00000431155 POGZQ7Z3K3 1410 aa48.54■■■■■ 5.36
GRAMD4-204ENST00000431155 MTUS2Q5JR59 1369 aa48.53■■■■■ 5.36
GRAMD4-204ENST00000431155 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa48.5■■■■■ 5.35
GRAMD4-204ENST00000431155 VPS8Q8N3P4 1428 aa48.48■■■■■ 5.35
GRAMD4-204ENST00000431155 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa48.47■■■■■ 5.35
GRAMD4-204ENST00000431155 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa48.47■■■■■ 5.35
GRAMD4-204ENST00000431155 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa48.4■■■■■ 5.34
GRAMD4-204ENST00000431155 YEATS2Q9ULM3 1422 aa48.4■■■■■ 5.34
GRAMD4-204ENST00000431155 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa48.39■■■■■ 5.34
GRAMD4-204ENST00000431155 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP48.39■■■■■ 5.34
GRAMD4-204ENST00000431155 MAGI2Q86UL8 1455 aa48.38■■■■■ 5.34
GRAMD4-204ENST00000431155 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa48.35■■■■■ 5.33
GRAMD4-204ENST00000431155 AFAP1Q8N556 730 aa48.34■■■■■ 5.33
GRAMD4-204ENST00000431155 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP48.33■■■■■ 5.33
GRAMD4-204ENST00000431155 CCNB3Q8WWL7 1395 aa48.33■■■■■ 5.33
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCC1P33527 1531 aa48.32■■■■■ 5.33
GRAMD4-204ENST00000431155 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP48.32■■■■■ 5.33
GRAMD4-204ENST00000431155 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa48.3■■■■■ 5.32
GRAMD4-204ENST00000431155 TIAM1Q13009 1591 aa48.3■■■■■ 5.32
GRAMD4-204ENST00000431155 KDM5CP41229 1560 aa48.26■■■■■ 5.32
GRAMD4-204ENST00000431155 ITSN2Q9NZM3 1697 aa48.24■■■■■ 5.31
GRAMD4-204ENST00000431155 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa48.24■■■■■ 5.31
GRAMD4-204ENST00000431155 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP48.24■■■■■ 5.31
GRAMD4-204ENST00000431155 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa48.24■■■■■ 5.31
GRAMD4-204ENST00000431155 BCORL1Q5H9F3 1711 aa48.19■■■■■ 5.31
GRAMD4-204ENST00000431155 MYT1LQ9UL68 1186 aa48.18■■■■■ 5.3
GRAMD4-204ENST00000431155 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa48.18■■■■■ 5.3
GRAMD4-204ENST00000431155 ADAMTSL3P82987 1691 aa48.18■■■■■ 5.3
GRAMD4-204ENST00000431155 ATP10AO60312 1499 aa48.16■■■■■ 5.3
GRAMD4-204ENST00000431155 HECW2Q9P2P5 1572 aa48.15■■■■■ 5.3
GRAMD4-204ENST00000431155 SYCP2Q9BX26 1530 aa48.13■■■■■ 5.3
GRAMD4-204ENST00000431155 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP48.12■■■■■ 5.29
GRAMD4-204ENST00000431155 NCOA2Q15596 1464 aa48.12■■■■■ 5.29
GRAMD4-204ENST00000431155 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa48.1■■■■■ 5.29
GRAMD4-204ENST00000431155 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP48.1■■■■■ 5.29
GRAMD4-204ENST00000431155 MLH3Q9UHC1 1453 aa48.1■■■■■ 5.29
GRAMD4-204ENST00000431155 C9orf84Q5VXU9 1444 aa48.09■■■■■ 5.29
GRAMD4-204ENST00000431155 MAP3K1Q13233 1512 aa48.06■■■■■ 5.28
GRAMD4-204ENST00000431155 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa48.05■■■■■ 5.28
GRAMD4-204ENST00000431155 MADDQ8WXG6 1647 aa48.04■■■■■ 5.28
GRAMD4-204ENST00000431155 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP48.04■■■■■ 5.28
GRAMD4-204ENST00000431155 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa48.04■■■■■ 5.28
GRAMD4-204ENST00000431155 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa48.04■■■■■ 5.28
GRAMD4-204ENST00000431155 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP48.03■■■■■ 5.28
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCA6Q8N139 1617 aa48■■■■■ 5.27
GRAMD4-204ENST00000431155 MLECQ14165 292 aa48■■■■■ 5.27
GRAMD4-204ENST00000431155 PTPRMP28827 1452 aa47.99■■■■■ 5.27
GRAMD4-204ENST00000431155 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa47.95■■■■■ 5.27
GRAMD4-204ENST00000431155 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP47.92■■■■■ 5.26
GRAMD4-204ENST00000431155 APLP2Q06481 763 aa47.9■■■■■ 5.26
GRAMD4-204ENST00000431155 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP47.89■■■■■ 5.26
GRAMD4-204ENST00000431155 REREQ9P2R6 1566 aa47.88■■■■■ 5.25
GRAMD4-204ENST00000431155 MBD5Q9P267 1494 aa47.84■■■■■ 5.25
GRAMD4-204ENST00000431155 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa47.82■■■■■ 5.25
GRAMD4-204ENST00000431155 ATP7AQ04656 1500 aa47.81■■■■■ 5.24
GRAMD4-204ENST00000431155 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP47.79■■■■■ 5.24
GRAMD4-204ENST00000431155 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa47.77■■■■■ 5.24
GRAMD4-204ENST00000431155 AGLP35573 1532 aa47.73■■■■■ 5.23
GRAMD4-204ENST00000431155 PLPPR3Q6T4P5 718 aa47.72■■■■■ 5.23
GRAMD4-204ENST00000431155 MYOM3Q5VTT5 1437 aa47.68■■■■■ 5.22
GRAMD4-204ENST00000431155 CCDC141Q6ZP82 1450 aa47.66■■■■■ 5.22
GRAMD4-204ENST00000431155 A2MP01023 1474 aa47.6■■■■■ 5.21
GRAMD4-204ENST00000431155 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa47.6■■■■■ 5.21
GRAMD4-204ENST00000431155 RSPH4AQ5TD94 716 aa47.6■■■■■ 5.21
GRAMD4-204ENST00000431155 MIA2Q96PC5 1412 aa47.6■■■■■ 5.21
GRAMD4-204ENST00000431155 ARHGEF5Q12774 1597 aa47.58■■■■■ 5.21
GRAMD4-204ENST00000431155 PLXNC1O60486 1568 aa47.56■■■■■ 5.2
GRAMD4-204ENST00000431155 ADGBQ8N7X0 1667 aa47.53■■■■■ 5.2
GRAMD4-204ENST00000431155 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP47.5■■■■■ 5.19
GRAMD4-204ENST00000431155 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP47.48■■■■■ 5.19
GRAMD4-204ENST00000431155 TSPY4P0CV99 314 aa47.47■■■■■ 5.19
GRAMD4-204ENST00000431155 TSPY10P0CW01 314 aa47.47■■■■■ 5.19
GRAMD4-204ENST00000431155 LMTK3Q96Q04 1460 aa47.41■■■■■ 5.18
GRAMD4-204ENST00000431155 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP47.4■■■■■ 5.18
GRAMD4-204ENST00000431155 PTPN23Q9H3S7 1636 aa47.38■■■■■ 5.18
GRAMD4-204ENST00000431155 FGD6Q6ZV73 1430 aa47.37■■■■■ 5.17
GRAMD4-204ENST00000431155 GGT6Q6P531 493 aa47.36■■■■■ 5.17
GRAMD4-204ENST00000431155 CNTLNQ9NXG0 1405 aa47.34■■■■■ 5.17
GRAMD4-204ENST00000431155 MAST1Q9Y2H9 1570 aa47.32■■■■■ 5.17
GRAMD4-204ENST00000431155 C3P01024 1663 aa47.32■■■■■ 5.17
GRAMD4-204ENST00000431155 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP47.27■■■■■ 5.16
GRAMD4-204ENST00000431155 KIF3BO15066 747 aa47.24■■■■■ 5.15
GRAMD4-204ENST00000431155 HSPA2P54652 639 aa47.23■■■■■ 5.15
GRAMD4-204ENST00000431155 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP47.22■■■■■ 5.15
GRAMD4-204ENST00000431155 ABCC5O15440 1437 aa47.22■■■■■ 5.15
GRAMD4-204ENST00000431155 MROH2AA6NES4 1674 aa47.21■■■■■ 5.15
GRAMD4-204ENST00000431155 ZMYM3Q14202 1370 aa47.2■■■■■ 5.15
GRAMD4-204ENST00000431155 PREX1Q8TCU6 1659 aa47.19■■■■■ 5.15
GRAMD4-204ENST00000431155 CROCC2H7BZ55 1655 aa47.16■■■■■ 5.14
GRAMD4-204ENST00000431155 DAPK1P53355 1430 aa47.16■■■■■ 5.14
GRAMD4-204ENST00000431155 PPP6R1Q9UPN7 881 aa47.16■■■■■ 5.14
GRAMD4-204ENST00000431155 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP47.15■■■■■ 5.14
GRAMD4-204ENST00000431155 SHANK2Q9UPX8 1470 aa47.14■■■■■ 5.14
GRAMD4-204ENST00000431155 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP47.1■■■■■ 5.13
GRAMD4-204ENST00000431155 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa47.1■■■■■ 5.13
GRAMD4-204ENST00000431155 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
GRAMD4-204ENST00000431155 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP47.04■■■■■ 5.12
GRAMD4-204ENST00000431155 NPATQ14207 1427 aa47.03■■■■■ 5.12
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