RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.08□□□□□ -0.48
HOXD8-202ENST00000429017 CUX1P39880 1505 aa12.07□□□□□ -0.48
HOXD8-202ENST00000429017 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP12.07□□□□□ -0.48
HOXD8-202ENST00000429017 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.06□□□□□ -0.48
HOXD8-202ENST00000429017 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.05□□□□□ -0.48
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM106CQ9BVX2 250 aa12.04□□□□□ -0.48
HOXD8-202ENST00000429017 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.03□□□□□ -0.48
HOXD8-202ENST00000429017 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
HOXD8-202ENST00000429017 WDR97A6NE52 1622 aa12.01□□□□□ -0.49
HOXD8-202ENST00000429017 GRIN2BQ13224 1484 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXD8-202ENST00000429017 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP11.99□□□□□ -0.49
HOXD8-202ENST00000429017 FAM212AQ96EL1 285 aa11.99□□□□□ -0.49
HOXD8-202ENST00000429017 PLCG2P16885 1265 aa11.98□□□□□ -0.49
HOXD8-202ENST00000429017 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
HOXD8-202ENST00000429017 SYNJ1O43426 1573 aa11.97□□□□□ -0.49
HOXD8-202ENST00000429017 SYNJ2O15056 1496 aa11.96□□□□□ -0.49
HOXD8-202ENST00000429017 PBRM1Q86U86 1689 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXD8-202ENST00000429017 GAPVD1Q14C86 1478 aa11.94□□□□□ -0.5
HOXD8-202ENST00000429017 OCEL1Q9H607 264 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXD8-202ENST00000429017 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa11.93□□□□□ -0.5
HOXD8-202ENST00000429017 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa11.92□□□□□ -0.5
HOXD8-202ENST00000429017 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP11.92□□□□□ -0.5
HOXD8-202ENST00000429017 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
HOXD8-202ENST00000429017 SPNS2Q8IVW8 549 aa11.88□□□□□ -0.51
HOXD8-202ENST00000429017 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.88□□□□□ -0.51
HOXD8-202ENST00000429017 MMRN1Q13201 1228 aa11.87□□□□□ -0.51
HOXD8-202ENST00000429017 PYGBP11216 843 aa11.86□□□□□ -0.51
HOXD8-202ENST00000429017 GRIN2AQ12879 1464 aa11.85□□□□□ -0.51
HOXD8-202ENST00000429017 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP11.84□□□□□ -0.51
HOXD8-202ENST00000429017 PCDHB8Q9UN66 801 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXD8-202ENST00000429017 CEP170Q5SW79 1584 aa11.84□□□□□ -0.51
HOXD8-202ENST00000429017 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP11.84□□□□□ -0.51
HOXD8-202ENST00000429017 ADAMTS12P58397 1594 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXD8-202ENST00000429017 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa11.83□□□□□ -0.52
HOXD8-202ENST00000429017 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
HOXD8-202ENST00000429017 NUP160Q12769 1436 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXD8-202ENST00000429017 TOP2BQ02880 1626 aa11.82□□□□□ -0.52
HOXD8-202ENST00000429017 SNPHO15079 494 aa11.81□□□□□ -0.52
HOXD8-202ENST00000429017 DCAF8Q5TAQ9 597 aa11.8□□□□□ -0.52
HOXD8-202ENST00000429017 MARVELD3Q96A59 401 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXD8-202ENST00000429017 FHAD1B1AJZ9 1412 aa11.79□□□□□ -0.52
HOXD8-202ENST00000429017 FKBP8Q14318 412 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXD8-202ENST00000429017 SHROOM2Q13796 1616 aa11.78□□□□□ -0.52
HOXD8-202ENST00000429017 ERICH3Q5RHP9 1530 aa11.76□□□□□ -0.53
HOXD8-202ENST00000429017 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
HOXD8-202ENST00000429017 POTEB3A0JP26 581 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXD8-202ENST00000429017 POTEBQ6S5H4 581 aa11.72□□□□□ -0.53
HOXD8-202ENST00000429017 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa11.71□□□□□ -0.54
HOXD8-202ENST00000429017 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa11.71□□□□□ -0.54
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.69□□□□□ -0.54
HOXD8-202ENST00000429017 JPH4Q96JJ6 628 aa11.69□□□□□ -0.54
HOXD8-202ENST00000429017 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
HOXD8-202ENST00000429017 KIF13AQ9H1H9 1805 aa11.68□□□□□ -0.54
HOXD8-202ENST00000429017 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa11.67□□□□□ -0.54
HOXD8-202ENST00000429017 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
HOXD8-202ENST00000429017 EMP3P54852 163 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXD8-202ENST00000429017 C3orf67Q6ZVT6 689 aa11.65□□□□□ -0.54
HOXD8-202ENST00000429017 GSE1Q14687 1217 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXD8-202ENST00000429017 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXD8-202ENST00000429017 FBXO3Q9UK99 471 aa11.64□□□□□ -0.55
HOXD8-202ENST00000429017 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
HOXD8-202ENST00000429017 IGF1RP08069 1367 aa11.62□□□□□ -0.55
HOXD8-202ENST00000429017 PSEN1P49768 467 aa11.61□□□□□ -0.55
HOXD8-202ENST00000429017 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP11.61□□□□□ -0.55
HOXD8-202ENST00000429017 ADCY10Q96PN6 1610 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXD8-202ENST00000429017 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.6□□□□□ -0.55
HOXD8-202ENST00000429017 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.59□□□□□ -0.55
HOXD8-202ENST00000429017 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa11.58□□□□□ -0.55
HOXD8-202ENST00000429017 MAPKBP1O60336 1514 aa11.58□□□□□ -0.56
HOXD8-202ENST00000429017 FAM205CA6NFA0 338 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXD8-202ENST00000429017 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
HOXD8-202ENST00000429017 DPY19L2Q6NUT2 758 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXD8-202ENST00000429017 DIP2BQ9P265 1576 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXD8-202ENST00000429017 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA2Q08379 1002 aa11.57□□□□□ -0.56
HOXD8-202ENST00000429017 KIF27Q86VH2 1401 aa11.56□□□□□ -0.56
HOXD8-202ENST00000429017 CUL7Q14999 1698 aa11.55□□□□□ -0.56
HOXD8-202ENST00000429017 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
HOXD8-202ENST00000429017 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa11.52□□□□□ -0.57
HOXD8-202ENST00000429017 PTPRGP23470 1445 aa11.5□□□□□ -0.57
HOXD8-202ENST00000429017 KLHL34Q8N239 644 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXD8-202ENST00000429017 TSPOAP1O95153 1857 aa11.49□□□□□ -0.57
HOXD8-202ENST00000429017 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP11.48□□□□□ -0.57
HOXD8-202ENST00000429017 BOLA1Q9Y3E2 137 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXD8-202ENST00000429017 KDM6BO15054 1643 aa11.48□□□□□ -0.57
HOXD8-202ENST00000429017 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.47□□□□□ -0.57
HOXD8-202ENST00000429017 TNIKQ9UKE5 1360 aa11.47□□□□□ -0.57
HOXD8-202ENST00000429017 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa11.46□□□□□ -0.57
HOXD8-202ENST00000429017 ABCC2Q92887 1545 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXD8-202ENST00000429017 IQGAP2Q13576 1575 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXD8-202ENST00000429017 CABP2Q9NPB3 220 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXD8-202ENST00000429017 DISP1Q96F81 1524 aa11.45□□□□□ -0.58
HOXD8-202ENST00000429017 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
HOXD8-202ENST00000429017 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXD8-202ENST00000429017 ASXL2Q76L83 1435 aa11.44□□□□□ -0.58
HOXD8-202ENST00000429017 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa11.42□□□□□ -0.58
HOXD8-202ENST00000429017 UACAQ9BZF9 1416 aa11.41□□□□□ -0.58
HOXD8-202ENST00000429017 GLI2P10070 1586 aa11.41□□□□□ -0.58
HOXD8-202ENST00000429017 PLB1Q6P1J6 1458 aa11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms