RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 NCOA1Q15788 1441 aa23.42■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.42■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.42■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.42■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 ANP32EQ9BTT0 268 aa23.41■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.41■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 KDM6BO15054 1643 aa23.41■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa23.4■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
HCLS1-202ENST00000428394 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.39■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 ADCY10Q96PN6 1610 aa23.38■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 MPHOSPH9Q99550 1183 aa23.37■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.37■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 WASHC2AQ641Q2 1341 aa23.36■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 CEP170Q5SW79 1584 aa23.34■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 TRIM52Q96A61 297 aa23.33■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.33■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 ABCC5O15440 1437 aa23.33■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 NUP160Q12769 1436 aa23.33■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 ADGRL2O95490 1459 aa23.33■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 DISP1Q96F81 1524 aa23.33■■□□□ 1.33
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC7Q96M83 1385 aa23.32■■□□□ 1.32
HCLS1-202ENST00000428394 FBLN2P98095 1184 aa23.32■■□□□ 1.32
HCLS1-202ENST00000428394 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
HCLS1-202ENST00000428394 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.31■■□□□ 1.32
HCLS1-202ENST00000428394 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.31■■□□□ 1.32
HCLS1-202ENST00000428394 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.29■■□□□ 1.32
HCLS1-202ENST00000428394 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
HCLS1-202ENST00000428394 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
HCLS1-202ENST00000428394 MBD5Q9P267 1494 aa23.25■■□□□ 1.31
HCLS1-202ENST00000428394 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.25■■□□□ 1.31
HCLS1-202ENST00000428394 BCANQ96GW7 911 aa23.25■■□□□ 1.31
HCLS1-202ENST00000428394 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.24■■□□□ 1.31
HCLS1-202ENST00000428394 KIF14Q15058 1648 aa23.23■■□□□ 1.31
HCLS1-202ENST00000428394 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.22■■□□□ 1.31
HCLS1-202ENST00000428394 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.22■■□□□ 1.31
HCLS1-202ENST00000428394 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.21■■□□□ 1.31
HCLS1-202ENST00000428394 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
HCLS1-202ENST00000428394 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.21■■□□□ 1.31
HCLS1-202ENST00000428394 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.2■■□□□ 1.31
HCLS1-202ENST00000428394 PZPP20742 1482 aa23.2■■□□□ 1.3
HCLS1-202ENST00000428394 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP23.19■■□□□ 1.3
HCLS1-202ENST00000428394 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.18■■□□□ 1.3
HCLS1-202ENST00000428394 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.17■■□□□ 1.3
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.17■■□□□ 1.3
HCLS1-202ENST00000428394 FANCIQ9NVI1 1328 aa23.17■■□□□ 1.3
HCLS1-202ENST00000428394 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.16■■□□□ 1.3
HCLS1-202ENST00000428394 SHROOM2Q13796 1616 aa23.14■■□□□ 1.29
HCLS1-202ENST00000428394 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.14■■□□□ 1.29
HCLS1-202ENST00000428394 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
HCLS1-202ENST00000428394 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.13■■□□□ 1.29
HCLS1-202ENST00000428394 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.11■■□□□ 1.29
HCLS1-202ENST00000428394 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
HCLS1-202ENST00000428394 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa23.1■■□□□ 1.29
HCLS1-202ENST00000428394 KIF7Q2M1P5 1343 aa23.09■■□□□ 1.29
HCLS1-202ENST00000428394 KDM5CP41229 1560 aa23.08■■□□□ 1.29
HCLS1-202ENST00000428394 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.07■■□□□ 1.28
HCLS1-202ENST00000428394 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
HCLS1-202ENST00000428394 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.06■■□□□ 1.28
HCLS1-202ENST00000428394 MRS2Q9HD23 443 aa23.05■■□□□ 1.28
HCLS1-202ENST00000428394 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.04■■□□□ 1.28
HCLS1-202ENST00000428394 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
HCLS1-202ENST00000428394 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HCLS1-202ENST00000428394 ABCA8O94911 1581 aa23.02■■□□□ 1.28
HCLS1-202ENST00000428394 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.02■■□□□ 1.28
HCLS1-202ENST00000428394 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HCLS1-202ENST00000428394 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
HCLS1-202ENST00000428394 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
HCLS1-202ENST00000428394 JPH4Q96JJ6 628 aa23■■□□□ 1.27
HCLS1-202ENST00000428394 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23■■□□□ 1.27
HCLS1-202ENST00000428394 USP47Q96K76 1375 aa22.99■■□□□ 1.27
HCLS1-202ENST00000428394 ABCC10Q5T3U5 1492 aa22.99■■□□□ 1.27
HCLS1-202ENST00000428394 PTPRGP23470 1445 aa22.98■■□□□ 1.27
HCLS1-202ENST00000428394 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.97■■□□□ 1.27
HCLS1-202ENST00000428394 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.97■■□□□ 1.27
HCLS1-202ENST00000428394 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
HCLS1-202ENST00000428394 FOXD1Q16676 465 aa22.94■■□□□ 1.26
HCLS1-202ENST00000428394 PLB1Q6P1J6 1458 aa22.94■■□□□ 1.26
HCLS1-202ENST00000428394 RNF123Q5XPI4 1314 aa22.93■■□□□ 1.26
HCLS1-202ENST00000428394 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.93■■□□□ 1.26
HCLS1-202ENST00000428394 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.92■■□□□ 1.26
HCLS1-202ENST00000428394 E9PCH4 1651 aa22.92■■□□□ 1.26
HCLS1-202ENST00000428394 CCDC184Q52MB2 194 aa22.9■■□□□ 1.26
HCLS1-202ENST00000428394 LAMC1P11047 1609 aa22.9■■□□□ 1.26
HCLS1-202ENST00000428394 KIF15Q9NS87 1388 aa22.88■■□□□ 1.25
HCLS1-202ENST00000428394 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.88■■□□□ 1.25
HCLS1-202ENST00000428394 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.87■■□□□ 1.25
HCLS1-202ENST00000428394 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.87■■□□□ 1.25
HCLS1-202ENST00000428394 PKD2Q13563 968 aa22.86■■□□□ 1.25
HCLS1-202ENST00000428394 NUDCQ9Y266 331 aa22.86■■□□□ 1.25
HCLS1-202ENST00000428394 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.85■■□□□ 1.25
HCLS1-202ENST00000428394 INSRP06213 1382 aa22.85■■□□□ 1.25
HCLS1-202ENST00000428394 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-202ENST00000428394 PREX2Q70Z35 1606 aa22.84■■□□□ 1.25
HCLS1-202ENST00000428394 PLEKHD1A6NEE1 506 aa22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms