RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 SCAPERQ9BY12 1400 aa28.48■■■□□ 2.15
HERC3-205ENST00000426683 PREX2Q70Z35 1606 aa28.47■■■□□ 2.15
HERC3-205ENST00000426683 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa28.45■■■□□ 2.14
HERC3-205ENST00000426683 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
HERC3-205ENST00000426683 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.44■■■□□ 2.14
HERC3-205ENST00000426683 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.43■■■□□ 2.14
HERC3-205ENST00000426683 RICTORQ6R327 1708 aa28.42■■■□□ 2.14
HERC3-205ENST00000426683 MAP3K1Q13233 1512 aa28.42■■■□□ 2.14
HERC3-205ENST00000426683 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.41■■■□□ 2.14
HERC3-205ENST00000426683 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.4■■■□□ 2.14
HERC3-205ENST00000426683 APLP2Q06481 763 aa28.38■■■□□ 2.13
HERC3-205ENST00000426683 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.38■■■□□ 2.13
HERC3-205ENST00000426683 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
HERC3-205ENST00000426683 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.37■■■□□ 2.13
HERC3-205ENST00000426683 NCOA2Q15596 1464 aa28.36■■■□□ 2.13
HERC3-205ENST00000426683 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
HERC3-205ENST00000426683 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.35■■■□□ 2.13
HERC3-205ENST00000426683 ABCC1P33527 1531 aa28.34■■■□□ 2.13
HERC3-205ENST00000426683 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa28.32■■■□□ 2.12
HERC3-205ENST00000426683 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.32■■■□□ 2.12
HERC3-205ENST00000426683 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa28.32■■■□□ 2.12
HERC3-205ENST00000426683 AFAP1Q8N556 730 aa28.31■■■□□ 2.12
HERC3-205ENST00000426683 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa28.31■■■□□ 2.12
HERC3-205ENST00000426683 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.3■■■□□ 2.12
HERC3-205ENST00000426683 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.3■■■□□ 2.12
HERC3-205ENST00000426683 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.29■■■□□ 2.12
HERC3-205ENST00000426683 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa28.28■■■□□ 2.12
HERC3-205ENST00000426683 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.28■■■□□ 2.12
HERC3-205ENST00000426683 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.28■■■□□ 2.12
HERC3-205ENST00000426683 YEATS2Q9ULM3 1422 aa28.27■■■□□ 2.12
HERC3-205ENST00000426683 KDM5CP41229 1560 aa28.25■■■□□ 2.11
HERC3-205ENST00000426683 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.24■■■□□ 2.11
HERC3-205ENST00000426683 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.24■■■□□ 2.11
HERC3-205ENST00000426683 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.24■■■□□ 2.11
HERC3-205ENST00000426683 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.23■■■□□ 2.11
HERC3-205ENST00000426683 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.23■■■□□ 2.11
HERC3-205ENST00000426683 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.22■■■□□ 2.11
HERC3-205ENST00000426683 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
HERC3-205ENST00000426683 MLH3Q9UHC1 1453 aa28.18■■■□□ 2.1
HERC3-205ENST00000426683 HECW2Q9P2P5 1572 aa28.18■■■□□ 2.1
HERC3-205ENST00000426683 ATP10AO60312 1499 aa28.15■■■□□ 2.1
HERC3-205ENST00000426683 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.13■■■□□ 2.09
HERC3-205ENST00000426683 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.12■■■□□ 2.09
HERC3-205ENST00000426683 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.12■■■□□ 2.09
HERC3-205ENST00000426683 MBD5Q9P267 1494 aa28.12■■■□□ 2.09
HERC3-205ENST00000426683 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.12■■■□□ 2.09
HERC3-205ENST00000426683 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa28.1■■■□□ 2.09
HERC3-205ENST00000426683 ABCA6Q8N139 1617 aa28.08■■■□□ 2.09
HERC3-205ENST00000426683 MIA2Q96PC5 1412 aa28.08■■■□□ 2.09
HERC3-205ENST00000426683 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.06■■■□□ 2.08
HERC3-205ENST00000426683 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.06■■■□□ 2.08
HERC3-205ENST00000426683 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.05■■■□□ 2.08
HERC3-205ENST00000426683 ATP7AQ04656 1500 aa28.03■■■□□ 2.08
HERC3-205ENST00000426683 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.03■■■□□ 2.08
HERC3-205ENST00000426683 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.03■■■□□ 2.08
HERC3-205ENST00000426683 MLECQ14165 292 aa28.02■■■□□ 2.08
HERC3-205ENST00000426683 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.02■■■□□ 2.08
HERC3-205ENST00000426683 REREQ9P2R6 1566 aa28.01■■■□□ 2.07
HERC3-205ENST00000426683 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
HERC3-205ENST00000426683 ARHGEF5Q12774 1597 aa27.98■■■□□ 2.07
HERC3-205ENST00000426683 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa27.96■■■□□ 2.07
HERC3-205ENST00000426683 FGD6Q6ZV73 1430 aa27.96■■■□□ 2.07
HERC3-205ENST00000426683 MADDQ8WXG6 1647 aa27.96■■■□□ 2.07
HERC3-205ENST00000426683 TSPY4P0CV99 314 aa27.94■■■□□ 2.06
HERC3-205ENST00000426683 TSPY10P0CW01 314 aa27.94■■■□□ 2.06
HERC3-205ENST00000426683 AGLP35573 1532 aa27.93■■■□□ 2.06
HERC3-205ENST00000426683 PTPN23Q9H3S7 1636 aa27.93■■■□□ 2.06
HERC3-205ENST00000426683 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.92■■■□□ 2.06
HERC3-205ENST00000426683 A2MP01023 1474 aa27.91■■■□□ 2.06
HERC3-205ENST00000426683 PTPRMP28827 1452 aa27.91■■■□□ 2.06
HERC3-205ENST00000426683 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
HERC3-205ENST00000426683 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
HERC3-205ENST00000426683 PLXNC1O60486 1568 aa27.86■■■□□ 2.05
HERC3-205ENST00000426683 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.84■■■□□ 2.05
HERC3-205ENST00000426683 MAST1Q9Y2H9 1570 aa27.83■■■□□ 2.05
HERC3-205ENST00000426683 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
HERC3-205ENST00000426683 ABCC5O15440 1437 aa27.83■■■□□ 2.05
HERC3-205ENST00000426683 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa27.82■■■□□ 2.04
HERC3-205ENST00000426683 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
HERC3-205ENST00000426683 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.8■■■□□ 2.04
HERC3-205ENST00000426683 DAPK1P53355 1430 aa27.8■■■□□ 2.04
HERC3-205ENST00000426683 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
HERC3-205ENST00000426683 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.77■■■□□ 2.04
HERC3-205ENST00000426683 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.76■■■□□ 2.04
HERC3-205ENST00000426683 GGT6Q6P531 493 aa27.75■■■□□ 2.03
HERC3-205ENST00000426683 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.74■■■□□ 2.03
HERC3-205ENST00000426683 KIF3BO15066 747 aa27.72■■■□□ 2.03
HERC3-205ENST00000426683 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP27.7■■■□□ 2.02
HERC3-205ENST00000426683 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.7■■■□□ 2.02
HERC3-205ENST00000426683 CNTLNQ9NXG0 1405 aa27.69■■■□□ 2.02
HERC3-205ENST00000426683 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.68■■■□□ 2.02
HERC3-205ENST00000426683 KIF15Q9NS87 1388 aa27.67■■■□□ 2.02
HERC3-205ENST00000426683 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.65■■■□□ 2.02
HERC3-205ENST00000426683 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.65■■■□□ 2.02
HERC3-205ENST00000426683 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.64■■■□□ 2.02
HERC3-205ENST00000426683 NCOA1Q15788 1441 aa27.6■■■□□ 2.01
HERC3-205ENST00000426683 ZMYM3Q14202 1370 aa27.6■■■□□ 2.01
HERC3-205ENST00000426683 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.6■■■□□ 2.01
HERC3-205ENST00000426683 C3P01024 1663 aa27.59■■■□□ 2.01
HERC3-205ENST00000426683 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP27.59■■■□□ 2.01
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