RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426047.1

CHTF18-203, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 790 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-203ENST00000426047 TTC37Q6PGP7 1564 aa26.35■■□□□ 1.81
CHTF18-203ENST00000426047 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.33■■□□□ 1.81
CHTF18-203ENST00000426047 PREX1Q8TCU6 1659 aa26.33■■□□□ 1.81
CHTF18-203ENST00000426047 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.33■■□□□ 1.81
CHTF18-203ENST00000426047 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
CHTF18-203ENST00000426047 CFAP74Q9C0B2 1584 aa26.31■■□□□ 1.8
CHTF18-203ENST00000426047 STRCQ7RTU9 1775 aa26.3■■□□□ 1.8
CHTF18-203ENST00000426047 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP26.3■■□□□ 1.8
CHTF18-203ENST00000426047 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.28■■□□□ 1.8
CHTF18-203ENST00000426047 HECW1Q76N89 1606 aa26.28■■□□□ 1.8
CHTF18-203ENST00000426047 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.27■■□□□ 1.8
CHTF18-203ENST00000426047 SCAPERQ9BY12 1400 aa26.26■■□□□ 1.79
CHTF18-203ENST00000426047 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa26.25■■□□□ 1.79
CHTF18-203ENST00000426047 ATP10AO60312 1499 aa26.25■■□□□ 1.79
CHTF18-203ENST00000426047 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP26.24■■□□□ 1.796e-8■■■□□ 19.1
CHTF18-203ENST00000426047 SAMD9Q5K651 1589 aa26.23■■□□□ 1.79
CHTF18-203ENST00000426047 PTPRTO14522 1441 aa26.22■■□□□ 1.79
CHTF18-203ENST00000426047 CEP162Q5TB80 1403 aa26.2■■□□□ 1.78
CHTF18-203ENST00000426047 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.2■■□□□ 1.78
CHTF18-203ENST00000426047 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
CHTF18-203ENST00000426047 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.18■■□□□ 1.78
CHTF18-203ENST00000426047 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
CHTF18-203ENST00000426047 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.13■■□□□ 1.77
CHTF18-203ENST00000426047 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa26.12■■□□□ 1.77
CHTF18-203ENST00000426047 PLCH2O75038 1416 aa26.12■■□□□ 1.77
CHTF18-203ENST00000426047 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.11■■□□□ 1.77
CHTF18-203ENST00000426047 CLIP1P30622 1438 aa26.11■■□□□ 1.77
CHTF18-203ENST00000426047 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.11■■□□□ 1.77
CHTF18-203ENST00000426047 AFAP1Q8N556 730 aa26.05■■□□□ 1.76
CHTF18-203ENST00000426047 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.02■■□□□ 1.76
CHTF18-203ENST00000426047 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CHTF18-203ENST00000426047 NCOA1Q15788 1441 aa25.99■■□□□ 1.75
CHTF18-203ENST00000426047 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CHTF18-203ENST00000426047 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.98■■□□□ 1.75
CHTF18-203ENST00000426047 C3P01024 1663 aa25.97■■□□□ 1.75
CHTF18-203ENST00000426047 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
CHTF18-203ENST00000426047 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.96■■□□□ 1.75
CHTF18-203ENST00000426047 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa25.96■■□□□ 1.75
CHTF18-203ENST00000426047 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
CHTF18-203ENST00000426047 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
CHTF18-203ENST00000426047 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.9■■□□□ 1.74
CHTF18-203ENST00000426047 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.89■■□□□ 1.74
CHTF18-203ENST00000426047 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.88■■□□□ 1.73
CHTF18-203ENST00000426047 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.88■■□□□ 1.73
CHTF18-203ENST00000426047 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.87■■□□□ 1.73
CHTF18-203ENST00000426047 HSPA1LP34931 641 aa25.86■■□□□ 1.73
CHTF18-203ENST00000426047 KDM5CP41229 1560 aa25.86■■□□□ 1.73
CHTF18-203ENST00000426047 PIP4K2BP78356 416 aa25.85■■□□□ 1.73
CHTF18-203ENST00000426047 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.84■■□□□ 1.73
CHTF18-203ENST00000426047 REREQ9P2R6 1566 aa25.83■■□□□ 1.73
CHTF18-203ENST00000426047 PKD2Q13563 968 aa25.82■■□□□ 1.72
CHTF18-203ENST00000426047 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.81■■□□□ 1.72
CHTF18-203ENST00000426047 AGLP35573 1532 aa25.81■■□□□ 1.72
CHTF18-203ENST00000426047 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.8■■□□□ 1.72
CHTF18-203ENST00000426047 ABCA6Q8N139 1617 aa25.8■■□□□ 1.72
CHTF18-203ENST00000426047 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CHTF18-203ENST00000426047 NPATQ14207 1427 aa25.78■■□□□ 1.72
CHTF18-203ENST00000426047 FMN1Q68DA7 1419 aa25.78■■□□□ 1.72
CHTF18-203ENST00000426047 ZMYM3Q14202 1370 aa25.77■■□□□ 1.72
CHTF18-203ENST00000426047 KIF14Q15058 1648 aa25.77■■□□□ 1.72
CHTF18-203ENST00000426047 TOM1O60784 492 aa25.76■■□□□ 1.71
CHTF18-203ENST00000426047 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.75■■□□□ 1.71
CHTF18-203ENST00000426047 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.71■■□□□ 1.71
CHTF18-203ENST00000426047 PLA2R1Q13018 1463 aa25.67■■□□□ 1.7
CHTF18-203ENST00000426047 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa25.64■■□□□ 1.7
CHTF18-203ENST00000426047 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 FYCO1Q9BQS8 1478 aa25.64■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 MROH2AA6NES4 1674 aa25.64■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa25.63■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 MAP3K1Q13233 1512 aa25.63■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.62■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.61■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 ABCC1P33527 1531 aa25.6■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 APLP2Q06481 763 aa25.59■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 GGT6Q6P531 493 aa25.59■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.59■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.58■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.58■■□□□ 1.69
CHTF18-203ENST00000426047 PTPRKQ15262 1439 aa25.57■■□□□ 1.68
CHTF18-203ENST00000426047 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.57■■□□□ 1.68
CHTF18-203ENST00000426047 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
CHTF18-203ENST00000426047 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.55■■□□□ 1.68
CHTF18-203ENST00000426047 CPS1P31327 1500 aa25.53■■□□□ 1.68
CHTF18-203ENST00000426047 PREX2Q70Z35 1606 aa25.52■■□□□ 1.68
CHTF18-203ENST00000426047 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.52■■□□□ 1.683e-7■■■□□ 16
CHTF18-203ENST00000426047 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.52■■□□□ 1.68
CHTF18-203ENST00000426047 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.5■■□□□ 1.67
CHTF18-203ENST00000426047 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.47■■□□□ 1.67
CHTF18-203ENST00000426047 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.47■■□□□ 1.67
CHTF18-203ENST00000426047 TIAM1Q13009 1591 aa25.47■■□□□ 1.67
CHTF18-203ENST00000426047 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.44■■□□□ 1.66
CHTF18-203ENST00000426047 A2MP01023 1474 aa25.43■■□□□ 1.66
CHTF18-203ENST00000426047 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CHTF18-203ENST00000426047 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa25.41■■□□□ 1.66
CHTF18-203ENST00000426047 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.4■■□□□ 1.66
CHTF18-203ENST00000426047 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CHTF18-203ENST00000426047 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CHTF18-203ENST00000426047 ATP7AQ04656 1500 aa25.38■■□□□ 1.65
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