RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCC5O15440 1437 aa30.11■■■□□ 2.41
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.11■■■□□ 2.41
TMEM200B-201ENST00000420504 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.1■■■□□ 2.41
TMEM200B-201ENST00000420504 FOXD1Q16676 465 aa30.1■■■□□ 2.41
TMEM200B-201ENST00000420504 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.1■■■□□ 2.41
TMEM200B-201ENST00000420504 IFT140Q96RY7 1462 aa30.09■■■□□ 2.41
TMEM200B-201ENST00000420504 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa30.07■■■□□ 2.4
TMEM200B-201ENST00000420504 TEX14Q8IWB6 1497 aa30.07■■■□□ 2.4
TMEM200B-201ENST00000420504 NCOA1Q15788 1441 aa30.07■■■□□ 2.4
TMEM200B-201ENST00000420504 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP30.07■■■□□ 2.4
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP30.03■■■□□ 2.4
TMEM200B-201ENST00000420504 ANP32EQ9BTT0 268 aa30.03■■■□□ 2.4
TMEM200B-201ENST00000420504 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP30.02■■■□□ 2.4
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC7Q96M83 1385 aa30.01■■■□□ 2.4
TMEM200B-201ENST00000420504 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.99■■■□□ 2.39
TMEM200B-201ENST00000420504 GRIN2AQ12879 1464 aa29.99■■■□□ 2.39
TMEM200B-201ENST00000420504 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
TMEM200B-201ENST00000420504 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.95■■■□□ 2.39
TMEM200B-201ENST00000420504 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC184Q52MB2 194 aa29.94■■■□□ 2.38
TMEM200B-201ENST00000420504 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
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TMEM200B-201ENST00000420504 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
TMEM200B-201ENST00000420504 PZPP20742 1482 aa29.92■■■□□ 2.38
TMEM200B-201ENST00000420504 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
TMEM200B-201ENST00000420504 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
TMEM200B-201ENST00000420504 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.9■■■□□ 2.38
TMEM200B-201ENST00000420504 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.9■■■□□ 2.38
TMEM200B-201ENST00000420504 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.9■■■□□ 2.38
TMEM200B-201ENST00000420504 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.38
TMEM200B-201ENST00000420504 ADCY10Q96PN6 1610 aa29.86■■■□□ 2.37
TMEM200B-201ENST00000420504 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.85■■■□□ 2.37
TMEM200B-201ENST00000420504 KIF7Q2M1P5 1343 aa29.85■■■□□ 2.37
TMEM200B-201ENST00000420504 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.84■■■□□ 2.37
TMEM200B-201ENST00000420504 KIF14Q15058 1648 aa29.83■■■□□ 2.37
TMEM200B-201ENST00000420504 ADGRL2O95490 1459 aa29.82■■■□□ 2.36
TMEM200B-201ENST00000420504 MBD5Q9P267 1494 aa29.82■■■□□ 2.36
TMEM200B-201ENST00000420504 PLB1Q6P1J6 1458 aa29.82■■■□□ 2.36
TMEM200B-201ENST00000420504 CEP170Q5SW79 1584 aa29.81■■■□□ 2.36
TMEM200B-201ENST00000420504 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
TMEM200B-201ENST00000420504 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP29.8■■■□□ 2.36
TMEM200B-201ENST00000420504 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
TMEM200B-201ENST00000420504 MRS2Q9HD23 443 aa29.77■■■□□ 2.36
TMEM200B-201ENST00000420504 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.76■■■□□ 2.36
TMEM200B-201ENST00000420504 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.74■■■□□ 2.35
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM9BQ8IZU0 186 aa29.73■■■□□ 2.35
TMEM200B-201ENST00000420504 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.73■■■□□ 2.35
TMEM200B-201ENST00000420504 SYNJ2O15056 1496 aa29.72■■■□□ 2.35
TMEM200B-201ENST00000420504 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.7■■■□□ 2.34
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.67■■■□□ 2.34
TMEM200B-201ENST00000420504 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.66■■■□□ 2.34
TMEM200B-201ENST00000420504 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
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TMEM200B-201ENST00000420504 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
TMEM200B-201ENST00000420504 USP47Q96K76 1375 aa29.64■■■□□ 2.34
TMEM200B-201ENST00000420504 KDM5CP41229 1560 aa29.64■■■□□ 2.34
TMEM200B-201ENST00000420504 PKD2Q13563 968 aa29.64■■■□□ 2.34
TMEM200B-201ENST00000420504 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.64■■■□□ 2.34
TMEM200B-201ENST00000420504 NUP160Q12769 1436 aa29.63■■■□□ 2.33
TMEM200B-201ENST00000420504 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa29.63■■■□□ 2.33
TMEM200B-201ENST00000420504 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.61■■■□□ 2.33
TMEM200B-201ENST00000420504 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.6■■■□□ 2.33
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCC10Q5T3U5 1492 aa29.59■■■□□ 2.33
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCA8O94911 1581 aa29.59■■■□□ 2.33
TMEM200B-201ENST00000420504 JPH4Q96JJ6 628 aa29.58■■■□□ 2.33
TMEM200B-201ENST00000420504 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.58■■■□□ 2.33
TMEM200B-201ENST00000420504 MSH5O43196 834 aa29.57■■■□□ 2.32
TMEM200B-201ENST00000420504 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.55■■■□□ 2.32
TMEM200B-201ENST00000420504 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.54■■■□□ 2.32
TMEM200B-201ENST00000420504 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.54■■■□□ 2.32
TMEM200B-201ENST00000420504 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.54■■■□□ 2.32
TMEM200B-201ENST00000420504 ERCC6Q03468 1493 aa29.54■■■□□ 2.32
TMEM200B-201ENST00000420504 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
TMEM200B-201ENST00000420504 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.52■■■□□ 2.32
TMEM200B-201ENST00000420504 ATP10BO94823 1461 aa29.52■■■□□ 2.32
TMEM200B-201ENST00000420504 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.51■■■□□ 2.31
TMEM200B-201ENST00000420504 FBLN2P98095 1184 aa29.51■■■□□ 2.31
TMEM200B-201ENST00000420504 NUP155O75694 1391 aa29.5■■■□□ 2.31
TMEM200B-201ENST00000420504 PLEKHD1A6NEE1 506 aa29.5■■■□□ 2.31
TMEM200B-201ENST00000420504 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.47■■■□□ 2.31
TMEM200B-201ENST00000420504 PTPRGP23470 1445 aa29.44■■■□□ 2.3
TMEM200B-201ENST00000420504 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
TMEM200B-201ENST00000420504 ARHGEF5Q12774 1597 aa29.43■■■□□ 2.3
TMEM200B-201ENST00000420504 POLR3GLQ9BT43 218 aa29.43■■■□□ 2.3
TMEM200B-201ENST00000420504 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.41■■■□□ 2.3
TMEM200B-201ENST00000420504 KIF15Q9NS87 1388 aa29.39■■■□□ 2.3
TMEM200B-201ENST00000420504 TSPY4P0CV99 314 aa29.38■■■□□ 2.29
TMEM200B-201ENST00000420504 TSPY10P0CW01 314 aa29.38■■■□□ 2.29
TMEM200B-201ENST00000420504 CARD11Q9BXL7 1154 aa29.38■■■□□ 2.29
TMEM200B-201ENST00000420504 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
TMEM200B-201ENST00000420504 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
TMEM200B-201ENST00000420504 NUDCQ9Y266 331 aa29.35■■■□□ 2.29
TMEM200B-201ENST00000420504 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.34■■■□□ 2.29
TMEM200B-201ENST00000420504 E9PCH4 1651 aa29.33■■■□□ 2.29
TMEM200B-201ENST00000420504 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.32■■■□□ 2.28
TMEM200B-201ENST00000420504 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa29.32■■■□□ 2.28
TMEM200B-201ENST00000420504 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.32■■■□□ 2.28
TMEM200B-201ENST00000420504 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.3■■■□□ 2.28
TMEM200B-201ENST00000420504 PREX2Q70Z35 1606 aa29.3■■■□□ 2.28
TMEM200B-201ENST00000420504 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.29■■■□□ 2.28
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