RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420148.5

PBRM1-210, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 783 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-210ENST00000420148 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.46■■■■■ 4.39
PBRM1-210ENST00000420148 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa42.45■■■■■ 4.39
PBRM1-210ENST00000420148 CLIP1P30622 1438 aa42.45■■■■■ 4.39
PBRM1-210ENST00000420148 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.44■■■■■ 4.38
PBRM1-210ENST00000420148 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.42■■■■■ 4.38
PBRM1-210ENST00000420148 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
PBRM1-210ENST00000420148 MADDQ8WXG6 1647 aa42.4■■■■■ 4.38
PBRM1-210ENST00000420148 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.39■■■■■ 4.38
PBRM1-210ENST00000420148 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.3■■■■■ 4.36
PBRM1-210ENST00000420148 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.3■■■■■ 4.36
PBRM1-210ENST00000420148 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.3■■■■■ 4.36
PBRM1-210ENST00000420148 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.25■■■■■ 4.35
PBRM1-210ENST00000420148 ATP10AO60312 1499 aa42.23■■■■■ 4.35
PBRM1-210ENST00000420148 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.22■■■■■ 4.35
PBRM1-210ENST00000420148 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.22■■■■■ 4.35
PBRM1-210ENST00000420148 KDM5CP41229 1560 aa42.21■■■■■ 4.35
PBRM1-210ENST00000420148 PREX2Q70Z35 1606 aa42.18■■■■■ 4.34
PBRM1-210ENST00000420148 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.17■■■■■ 4.34
PBRM1-210ENST00000420148 AFAP1Q8N556 730 aa42.16■■■■■ 4.34
PBRM1-210ENST00000420148 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.08■■■■■ 4.33
PBRM1-210ENST00000420148 ABCC1P33527 1531 aa42.08■■■■■ 4.33
PBRM1-210ENST00000420148 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.07■■■■■ 4.33
PBRM1-210ENST00000420148 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.06■■■■■ 4.32
PBRM1-210ENST00000420148 MLECQ14165 292 aa42.06■■■■■ 4.32
PBRM1-210ENST00000420148 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.05■■■■■ 4.32
PBRM1-210ENST00000420148 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.05■■■■■ 4.32
PBRM1-210ENST00000420148 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.03■■■■■ 4.32
PBRM1-210ENST00000420148 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.02■■■■■ 4.32
PBRM1-210ENST00000420148 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.01■■■■■ 4.32
PBRM1-210ENST00000420148 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42■■■■■ 4.31
PBRM1-210ENST00000420148 REREQ9P2R6 1566 aa41.99■■■■■ 4.31
PBRM1-210ENST00000420148 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
PBRM1-210ENST00000420148 ABCA6Q8N139 1617 aa41.94■■■■■ 4.3
PBRM1-210ENST00000420148 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.92■■■■■ 4.3
PBRM1-210ENST00000420148 PLPPR3Q6T4P5 718 aa41.88■■■■■ 4.29
PBRM1-210ENST00000420148 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.88■■■■■ 4.29
PBRM1-210ENST00000420148 AGLP35573 1532 aa41.86■■■■■ 4.29
PBRM1-210ENST00000420148 CEP162Q5TB80 1403 aa41.86■■■■■ 4.29
PBRM1-210ENST00000420148 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.85■■■■■ 4.29
PBRM1-210ENST00000420148 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.83■■■■■ 4.29
PBRM1-210ENST00000420148 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.82■■■■■ 4.29
PBRM1-210ENST00000420148 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.79■■■■■ 4.28
PBRM1-210ENST00000420148 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.79■■■■■ 4.28
PBRM1-210ENST00000420148 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.79■■■■■ 4.28
PBRM1-210ENST00000420148 HSPA2P54652 639 aa41.78■■■■■ 4.28
PBRM1-210ENST00000420148 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
PBRM1-210ENST00000420148 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.76■■■■■ 4.28
PBRM1-210ENST00000420148 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
PBRM1-210ENST00000420148 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.72■■■■■ 4.27
PBRM1-210ENST00000420148 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.72■■■■■ 4.27
PBRM1-210ENST00000420148 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.69■■■■■ 4.27
PBRM1-210ENST00000420148 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.68■■■■■ 4.26
PBRM1-210ENST00000420148 TIAM1Q13009 1591 aa41.66■■■■■ 4.26
PBRM1-210ENST00000420148 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
PBRM1-210ENST00000420148 ATP7AQ04656 1500 aa41.62■■■■■ 4.25
PBRM1-210ENST00000420148 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.61■■■■■ 4.25
PBRM1-210ENST00000420148 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.58■■■■■ 4.25
PBRM1-210ENST00000420148 C3P01024 1663 aa41.58■■■■■ 4.25
PBRM1-210ENST00000420148 FBXO41Q8TF61 875 aa41.57■■■■■ 4.25
PBRM1-210ENST00000420148 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
PBRM1-210ENST00000420148 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
PBRM1-210ENST00000420148 MBD5Q9P267 1494 aa41.53■■■■■ 4.24
PBRM1-210ENST00000420148 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.53■■■■■ 4.24
PBRM1-210ENST00000420148 PLXNC1O60486 1568 aa41.53■■■■■ 4.24
PBRM1-210ENST00000420148 A2MP01023 1474 aa41.5■■■■■ 4.23
PBRM1-210ENST00000420148 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.48■■■■■ 4.23
PBRM1-210ENST00000420148 NCOA2Q15596 1464 aa41.47■■■■■ 4.23
PBRM1-210ENST00000420148 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.47■■■■■ 4.23
PBRM1-210ENST00000420148 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.44■■■■■ 4.22
PBRM1-210ENST00000420148 MROH2AA6NES4 1674 aa41.43■■■■■ 4.22
PBRM1-210ENST00000420148 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.42■■■■■ 4.22
PBRM1-210ENST00000420148 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.39■■■■■ 4.22
PBRM1-210ENST00000420148 STRCQ7RTU9 1775 aa41.38■■■■■ 4.22
PBRM1-210ENST00000420148 ZMYM3Q14202 1370 aa41.37■■■■■ 4.21
PBRM1-210ENST00000420148 NPATQ14207 1427 aa41.36■■■■■ 4.21
PBRM1-210ENST00000420148 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.33■■■■■ 4.21
PBRM1-210ENST00000420148 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.33■■■■■ 4.21
PBRM1-210ENST00000420148 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.31■■■■■ 4.2
PBRM1-210ENST00000420148 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.31■■■■■ 4.2
PBRM1-210ENST00000420148 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.31■■■■■ 4.2
PBRM1-210ENST00000420148 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.3■■■■■ 4.2
PBRM1-210ENST00000420148 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
PBRM1-210ENST00000420148 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
PBRM1-210ENST00000420148 GGT6Q6P531 493 aa41.27■■■■■ 4.2
PBRM1-210ENST00000420148 MAP3K1Q13233 1512 aa41.27■■■■■ 4.2
PBRM1-210ENST00000420148 CERKQ8TCT0 537 aa41.25■■■■■ 4.19
PBRM1-210ENST00000420148 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.2■■■■■ 4.19
PBRM1-210ENST00000420148 PTPRTO14522 1441 aa41.2■■■■■ 4.19
PBRM1-210ENST00000420148 PTPRKQ15262 1439 aa41.19■■■■■ 4.18
PBRM1-210ENST00000420148 NCOA1Q15788 1441 aa41.18■■■■■ 4.18
PBRM1-210ENST00000420148 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
PBRM1-210ENST00000420148 KIF3BO15066 747 aa41.08■■■■■ 4.17
PBRM1-210ENST00000420148 TSPY4P0CV99 314 aa41.08■■■■■ 4.17
PBRM1-210ENST00000420148 TSPY10P0CW01 314 aa41.08■■■■■ 4.17
PBRM1-210ENST00000420148 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.07■■■■■ 4.17
PBRM1-210ENST00000420148 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.07■■■■■ 4.17
PBRM1-210ENST00000420148 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.07■■■■■ 4.17
PBRM1-210ENST00000420148 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.07■■■■■ 4.16
PBRM1-210ENST00000420148 MIA2Q96PC5 1412 aa41.05■■■■■ 4.16
PBRM1-210ENST00000420148 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.04■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms