RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420148.5

PBRM1-210, Transcript of polybromo 1, humanhuman

TSL 3

Gene PBRM1, Length 783 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1-210ENST00000420148 NISCHQ9Y2I1 1504 aa64.95■■■■■ 7.99
PBRM1-210ENST00000420148 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa58.17■■■■■ 6.9
PBRM1-210ENST00000420148 ABCC9O60706 1549 aa57.86■■■■■ 6.85
PBRM1-210ENST00000420148 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.24■■■■■ 6.43
PBRM1-210ENST00000420148 NACADO15069 1562 aa54.96■■■■■ 6.39
PBRM1-210ENST00000420148 DCAF8L2P0C7V8 631 aa54.55■■■■■ 6.32
PBRM1-210ENST00000420148 MYO15BQ96JP2 1530 aa54.37■■■■■ 6.29
PBRM1-210ENST00000420148 DNAJC5BQ9UF47 199 aa54.13■■■■■ 6.26
PBRM1-210ENST00000420148 UNC13AQ9UPW8 1703 aa53.96■■■■■ 6.23
PBRM1-210ENST00000420148 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP53.9■■■■■ 6.22
PBRM1-210ENST00000420148 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP53.89■■■■■ 6.22
PBRM1-210ENST00000420148 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa53.73■■■■■ 6.19
PBRM1-210ENST00000420148 BICRAQ9NZM4 1560 aa53.65■■■■■ 6.18
PBRM1-210ENST00000420148 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa53.03■■■■■ 6.08
PBRM1-210ENST00000420148 SCRIBQ14160 1630 aa52.93■■■■■ 6.06
PBRM1-210ENST00000420148 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.32■■■■■ 5.97
PBRM1-210ENST00000420148 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.3■■■■■ 5.96
PBRM1-210ENST00000420148 CECR2Q9BXF3 1484 aa52.14■■■■■ 5.94
PBRM1-210ENST00000420148 NCAPD3P42695 1498 aa50.77■■■■■ 5.72
PBRM1-210ENST00000420148 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa50.6■■■■■ 5.69
PBRM1-210ENST00000420148 SMARCA4P51532 1647 aa50.58■■■■■ 5.69
PBRM1-210ENST00000420148 SMARCA2P51531 1590 aa50.47■■■■■ 5.67
PBRM1-210ENST00000420148 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP50.39■■■■■ 5.66
PBRM1-210ENST00000420148 HMGXB3Q12766 1538 aa50.39■■■■■ 5.66
PBRM1-210ENST00000420148 PEG3Q9GZU2 1588 aa50.17■■■■■ 5.62
PBRM1-210ENST00000420148 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP50.09■■■■■ 5.61
PBRM1-210ENST00000420148 MROH2BQ7Z745 1585 aa50.02■■■■■ 5.6
PBRM1-210ENST00000420148 ERCC6Q03468 1493 aa49.94■■■■■ 5.58
PBRM1-210ENST00000420148 CUX2O14529 1486 aa49.86■■■■■ 5.57
PBRM1-210ENST00000420148 NESP48681 1621 aa49.79■■■■■ 5.56
PBRM1-210ENST00000420148 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa49.56■■■■■ 5.52
PBRM1-210ENST00000420148 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa49.53■■■■■ 5.52
PBRM1-210ENST00000420148 WIZO95785 1651 aa49.39■■■■■ 5.5
PBRM1-210ENST00000420148 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.28■■■■■ 5.48
PBRM1-210ENST00000420148 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.25■■■■■ 5.47
PBRM1-210ENST00000420148 CADPSQ9ULU8 1353 aa49.2■■■■■ 5.47
PBRM1-210ENST00000420148 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.14■■■■■ 5.46
PBRM1-210ENST00000420148 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP49.09■■■■■ 5.45
PBRM1-210ENST00000420148 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP48.83■■■■■ 5.41
PBRM1-210ENST00000420148 MRC2Q9UBG0 1479 aa48.8■■■■■ 5.4
PBRM1-210ENST00000420148 CFTRP13569 1480 aa48.71■■■■■ 5.39
PBRM1-210ENST00000420148 WDR62O43379 1518 aa48.68■■■■■ 5.38
PBRM1-210ENST00000420148 CEP164Q9UPV0 1460 aa48.62■■■■■ 5.37
PBRM1-210ENST00000420148 FANCD2Q9BXW9 1451 aa48.61■■■■■ 5.37
PBRM1-210ENST00000420148 CCDC88BA6NC98 1476 aa48.27■■■■■ 5.32
PBRM1-210ENST00000420148 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP48.21■■■■■ 5.31
PBRM1-210ENST00000420148 PRDM2Q13029 1718 aa48.17■■■■■ 5.3
PBRM1-210ENST00000420148 TOPBP1Q92547 1522 aa47.72■■■■■ 5.23
PBRM1-210ENST00000420148 IFT140Q96RY7 1462 aa47.68■■■■■ 5.22
PBRM1-210ENST00000420148 ABCC8Q09428 1581 aa47.67■■■■■ 5.22
PBRM1-210ENST00000420148 OSCARQ8IYS5 282 aa47.59■■■■■ 5.21
PBRM1-210ENST00000420148 DNMBPQ6XZF7 1577 aa47.57■■■■■ 5.21
PBRM1-210ENST00000420148 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP47.55■■■■■ 5.2
PBRM1-210ENST00000420148 TRIM41Q8WV44 630 aa47.34■■■■■ 5.17
PBRM1-210ENST00000420148 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP47.29■■■■■ 5.16
PBRM1-210ENST00000420148 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP47.28■■■■■ 5.16
PBRM1-210ENST00000420148 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP47.25■■■■■ 5.15
PBRM1-210ENST00000420148 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP47.14■■■■■ 5.146e-6■■■■□ 23.2
PBRM1-210ENST00000420148 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa47.04■■■■■ 5.12
PBRM1-210ENST00000420148 SOGA1O94964 1423 aa47.03■■■■■ 5.12
PBRM1-210ENST00000420148 CUX1P39880 1505 aa46.99■■■■■ 5.11
PBRM1-210ENST00000420148 FGD5Q6ZNL6 1462 aa46.97■■■■■ 5.11
PBRM1-210ENST00000420148 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP46.97■■■■■ 5.11
PBRM1-210ENST00000420148 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa46.92■■■■■ 5.1
PBRM1-210ENST00000420148 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa46.92■■■■■ 5.1
PBRM1-210ENST00000420148 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa46.92■■■■■ 5.1
PBRM1-210ENST00000420148 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP46.89■■■■■ 5.1
PBRM1-210ENST00000420148 WDR97A6NE52 1622 aa46.87■■■■■ 5.09
PBRM1-210ENST00000420148 CHD1O14646 1710 aa46.86■■■■■ 5.09
PBRM1-210ENST00000420148 ARHGEF11O15085 1522 aa46.82■■■■■ 5.09
PBRM1-210ENST00000420148 FBLN2P98095 1184 aa46.71■■■■■ 5.07
PBRM1-210ENST00000420148 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa46.67■■■■■ 5.06
PBRM1-210ENST00000420148 GRIN2BQ13224 1484 aa46.61■■■■■ 5.05
PBRM1-210ENST00000420148 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP46.61■■■■■ 5.05
PBRM1-210ENST00000420148 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa46.5■■■■■ 5.03
PBRM1-210ENST00000420148 GAPVD1Q14C86 1478 aa46.47■■■■■ 5.03
PBRM1-210ENST00000420148 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP46.47■■■■■ 5.03
PBRM1-210ENST00000420148 SYNJ2O15056 1496 aa46.44■■■■■ 5.02
PBRM1-210ENST00000420148 CLASP1Q7Z460 1538 aa46.42■■■■■ 5.02
PBRM1-210ENST00000420148 CYB5RLQ6IPT4 315 aa46.41■■■■■ 5.02
PBRM1-210ENST00000420148 ARAP1Q96P48 1450 aa46.38■■■■■ 5.02
PBRM1-210ENST00000420148 PBRM1Q86U86 1689 aa46.38■■■■■ 5.02
PBRM1-210ENST00000420148 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa46.38■■■■■ 5.01
PBRM1-210ENST00000420148 SYNJ1O43426 1573 aa46.37■■■■■ 5.01
PBRM1-210ENST00000420148 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP46.34■■■■■ 5.01
PBRM1-210ENST00000420148 TOP2BQ02880 1626 aa46.3■■■■■ 5
PBRM1-210ENST00000420148 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa46.29■■■■■ 5
PBRM1-210ENST00000420148 GRIN2AQ12879 1464 aa46.01■■■■■ 4.96
PBRM1-210ENST00000420148 ADAMTS12P58397 1594 aa46.01■■■■■ 4.96
PBRM1-210ENST00000420148 ERICH3Q5RHP9 1530 aa45.92■■■■■ 4.94
PBRM1-210ENST00000420148 FHAD1B1AJZ9 1412 aa45.91■■■■■ 4.94
PBRM1-210ENST00000420148 NUP160Q12769 1436 aa45.89■■■■■ 4.94
PBRM1-210ENST00000420148 CEP170Q5SW79 1584 aa45.82■■■■■ 4.93
PBRM1-210ENST00000420148 TRHP20396 242 aaPredicted RBP45.77■■■■■ 4.92
PBRM1-210ENST00000420148 ERCC6L2Q5T890 1561 aa45.66■■■■■ 4.9
PBRM1-210ENST00000420148 SHROOM2Q13796 1616 aa45.64■■■■■ 4.9
PBRM1-210ENST00000420148 KIF27Q86VH2 1401 aa45.4■■■■■ 4.86
PBRM1-210ENST00000420148 IGF1RP08069 1367 aa45.39■■■■■ 4.86
PBRM1-210ENST00000420148 JPH4Q96JJ6 628 aa45.37■■■■■ 4.85
PBRM1-210ENST00000420148 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP45.36■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.1 ms