RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395211.6

TMOD1-203, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,259 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-203ENST00000395211 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
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TMOD1-203ENST00000395211 PRDM4Q9UKN5 801 aa12.48□□□□□ -0.41
TMOD1-203ENST00000395211 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa12.47□□□□□ -0.41
TMOD1-203ENST00000395211 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP12.47□□□□□ -0.41
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TMOD1-203ENST00000395211 RRP1P56182 461 aaKnown RBP12.46□□□□□ -0.41
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TMOD1-203ENST00000395211 C20orf194Q5TEA3 1177 aa12.26□□□□□ -0.45
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TMOD1-203ENST00000395211 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP12.16□□□□□ -0.46
TMOD1-203ENST00000395211 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP12.16□□□□□ -0.46
TMOD1-203ENST00000395211 DMTNQ08495 405 aa12.16□□□□□ -0.46
TMOD1-203ENST00000395211 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
TMOD1-203ENST00000395211 ERICH3Q5RHP9 1530 aa12.15□□□□□ -0.46
TMOD1-203ENST00000395211 ZSCAN30Q86W11 494 aa12.15□□□□□ -0.46
TMOD1-203ENST00000395211 MAP3K1Q13233 1512 aa12.15□□□□□ -0.46
TMOD1-203ENST00000395211 ZBTB22O15209 634 aa12.14□□□□□ -0.47
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