RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379215.8

ECHDC3-201, Transcript of enoyl-CoA hydratase domain containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ECHDC3, Length 1,649 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3-201ENST00000379215 ABCA9Q8IUA7 1624 aa36.83■■■■□ 3.49
ECHDC3-201ENST00000379215 PLCH2O75038 1416 aa36.83■■■■□ 3.49
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGAP5Q13017 1502 aa36.81■■■■□ 3.48
ECHDC3-201ENST00000379215 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa36.8■■■■□ 3.48
ECHDC3-201ENST00000379215 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.79■■■■□ 3.48
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.77■■■■□ 3.48
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.76■■■■□ 3.48
ECHDC3-201ENST00000379215 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.75■■■■□ 3.47
ECHDC3-201ENST00000379215 DAPK1P53355 1430 aa36.75■■■■□ 3.47
ECHDC3-201ENST00000379215 PTPRKQ15262 1439 aa36.72■■■■□ 3.47
ECHDC3-201ENST00000379215 AKNAQ7Z591 1439 aa36.71■■■■□ 3.47
ECHDC3-201ENST00000379215 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.7■■■■□ 3.47
ECHDC3-201ENST00000379215 ABCC5O15440 1437 aa36.7■■■■□ 3.47
ECHDC3-201ENST00000379215 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.7■■■■□ 3.47
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.68■■■■□ 3.46
ECHDC3-201ENST00000379215 SETD5Q9C0A6 1442 aa36.68■■■■□ 3.46
ECHDC3-201ENST00000379215 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.67■■■■□ 3.46
ECHDC3-201ENST00000379215 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.67■■■■□ 3.46
ECHDC3-201ENST00000379215 HFM1A2PYH4 1435 aa36.66■■■■□ 3.46
ECHDC3-201ENST00000379215 ROCK1Q13464 1354 aa36.65■■■■□ 3.46
ECHDC3-201ENST00000379215 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.64■■■■□ 3.46
ECHDC3-201ENST00000379215 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.61■■■■□ 3.45
ECHDC3-201ENST00000379215 HRCP23327 699 aa36.6■■■■□ 3.45
ECHDC3-201ENST00000379215 GLI2P10070 1586 aa36.6■■■■□ 3.45
ECHDC3-201ENST00000379215 MBD5Q9P267 1494 aa36.6■■■■□ 3.45
ECHDC3-201ENST00000379215 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.58■■■■□ 3.45
ECHDC3-201ENST00000379215 CD109Q6YHK3 1445 aa36.58■■■■□ 3.45
ECHDC3-201ENST00000379215 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa36.57■■■■□ 3.45
ECHDC3-201ENST00000379215 FANCAO15360 1455 aa36.57■■■■□ 3.44
ECHDC3-201ENST00000379215 ABCC1P33527 1531 aa36.56■■■■□ 3.44
ECHDC3-201ENST00000379215 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.56■■■■□ 3.44
ECHDC3-201ENST00000379215 ADGRL2O95490 1459 aa36.54■■■■□ 3.44
ECHDC3-201ENST00000379215 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.54■■■■□ 3.44
ECHDC3-201ENST00000379215 NAIPQ13075 1403 aa36.54■■■■□ 3.44
ECHDC3-201ENST00000379215 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.53■■■■□ 3.44
ECHDC3-201ENST00000379215 TSPY4P0CV99 314 aa36.52■■■■□ 3.44
ECHDC3-201ENST00000379215 TSPY10P0CW01 314 aa36.52■■■■□ 3.44
ECHDC3-201ENST00000379215 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.52■■■■□ 3.44
ECHDC3-201ENST00000379215 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.52■■■■□ 3.44
ECHDC3-201ENST00000379215 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP36.51■■■■□ 3.43
ECHDC3-201ENST00000379215 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP36.5■■■■□ 3.43
ECHDC3-201ENST00000379215 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.5■■■■□ 3.43
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.48■■■■□ 3.43
ECHDC3-201ENST00000379215 DIP2BQ9P265 1576 aa36.48■■■■□ 3.43
ECHDC3-201ENST00000379215 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.47■■■■□ 3.43
ECHDC3-201ENST00000379215 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.46■■■■□ 3.43
ECHDC3-201ENST00000379215 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.45■■■■□ 3.42
ECHDC3-201ENST00000379215 NCOA1Q15788 1441 aa36.44■■■■□ 3.42
ECHDC3-201ENST00000379215 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.43■■■■□ 3.42
ECHDC3-201ENST00000379215 ADGRL1O94910 1474 aa36.41■■■■□ 3.42
ECHDC3-201ENST00000379215 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.41■■■■□ 3.42
ECHDC3-201ENST00000379215 NEO1Q92859 1461 aa36.41■■■■□ 3.42
ECHDC3-201ENST00000379215 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa36.4■■■■□ 3.42
ECHDC3-201ENST00000379215 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP36.39■■■■□ 3.42
ECHDC3-201ENST00000379215 FAM69CQ0P6D2 419 aa36.37■■■■□ 3.41
ECHDC3-201ENST00000379215 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.33■■■■□ 3.41
ECHDC3-201ENST00000379215 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
ECHDC3-201ENST00000379215 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.32■■■■□ 3.4
ECHDC3-201ENST00000379215 CLSPNQ9HAW4 1339 aa36.31■■■■□ 3.4
ECHDC3-201ENST00000379215 PLXNC1O60486 1568 aa36.29■■■■□ 3.4
ECHDC3-201ENST00000379215 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.29■■■■□ 3.4
ECHDC3-201ENST00000379215 KIF15Q9NS87 1388 aa36.27■■■■□ 3.4
ECHDC3-201ENST00000379215 TEX14Q8IWB6 1497 aa36.26■■■■□ 3.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.25■■■■□ 3.39
ECHDC3-201ENST00000379215 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.23■■■■□ 3.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.23■■■■□ 3.39
ECHDC3-201ENST00000379215 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.2■■■■□ 3.39
ECHDC3-201ENST00000379215 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.19■■■■□ 3.38
ECHDC3-201ENST00000379215 KDM6BO15054 1643 aa36.18■■■■□ 3.38
ECHDC3-201ENST00000379215 AFAP1Q8N556 730 aa36.18■■■■□ 3.38
ECHDC3-201ENST00000379215 KIF13AQ9H1H9 1805 aa36.17■■■■□ 3.38
ECHDC3-201ENST00000379215 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.17■■■■□ 3.38
ECHDC3-201ENST00000379215 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.16■■■■□ 3.38
ECHDC3-201ENST00000379215 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.15■■■■□ 3.38
ECHDC3-201ENST00000379215 ATP7AQ04656 1500 aa36.15■■■■□ 3.38
ECHDC3-201ENST00000379215 KDM5CP41229 1560 aa36.14■■■■□ 3.38
ECHDC3-201ENST00000379215 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.11■■■■□ 3.37
ECHDC3-201ENST00000379215 ERBINQ96RT1 1412 aa36.1■■■■□ 3.37
ECHDC3-201ENST00000379215 TRIM52Q96A61 297 aa36.08■■■■□ 3.37
ECHDC3-201ENST00000379215 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.07■■■■□ 3.36
ECHDC3-201ENST00000379215 TSPOAP1O95153 1857 aa36.04■■■■□ 3.36
ECHDC3-201ENST00000379215 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.03■■■■□ 3.36
ECHDC3-201ENST00000379215 MYT1LQ9UL68 1186 aa36■■■■□ 3.35
ECHDC3-201ENST00000379215 RICTORQ6R327 1708 aa35.98■■■■□ 3.35
ECHDC3-201ENST00000379215 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa35.98■■■■□ 3.35
ECHDC3-201ENST00000379215 KDM5DQ9BY66 1539 aa35.97■■■■□ 3.35
ECHDC3-201ENST00000379215 MPHOSPH9Q99550 1183 aa35.94■■■■□ 3.34
ECHDC3-201ENST00000379215 UNC13BO14795 1591 aa35.92■■■■□ 3.34
ECHDC3-201ENST00000379215 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.92■■■■□ 3.34
ECHDC3-201ENST00000379215 RAPGEF3O95398 923 aa35.92■■■■□ 3.34
ECHDC3-201ENST00000379215 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.91■■■■□ 3.34
ECHDC3-201ENST00000379215 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.9■■■■□ 3.34
ECHDC3-201ENST00000379215 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.89■■■■□ 3.34
ECHDC3-201ENST00000379215 NUP155O75694 1391 aa35.89■■■■□ 3.34
ECHDC3-201ENST00000379215 PZPP20742 1482 aa35.89■■■■□ 3.34
ECHDC3-201ENST00000379215 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.88■■■■□ 3.33
ECHDC3-201ENST00000379215 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
ECHDC3-201ENST00000379215 A2MP01023 1474 aa35.86■■■■□ 3.33
ECHDC3-201ENST00000379215 ABCA6Q8N139 1617 aa35.81■■■■□ 3.32
ECHDC3-201ENST00000379215 TRHP20396 242 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.2 ms