RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378543.2

FAAP20-201, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene FAAP20, Length 569 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.95■■■■□ 3.67
FAAP20-201ENST00000378543 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.94■■■■□ 3.66
FAAP20-201ENST00000378543 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa37.93■■■■□ 3.66
FAAP20-201ENST00000378543 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP37.91■■■■□ 3.66
FAAP20-201ENST00000378543 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.91■■■■□ 3.66
FAAP20-201ENST00000378543 YEATS2Q9ULM3 1422 aa37.91■■■■□ 3.66
FAAP20-201ENST00000378543 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa37.91■■■■□ 3.66
FAAP20-201ENST00000378543 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.9■■■■□ 3.66
FAAP20-201ENST00000378543 CEP162Q5TB80 1403 aa37.88■■■■□ 3.66
FAAP20-201ENST00000378543 PREX2Q70Z35 1606 aa37.87■■■■□ 3.65
FAAP20-201ENST00000378543 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa37.82■■■■□ 3.65
FAAP20-201ENST00000378543 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa37.82■■■■□ 3.65
FAAP20-201ENST00000378543 MADDQ8WXG6 1647 aa37.79■■■■□ 3.64
FAAP20-201ENST00000378543 PTPRMP28827 1452 aa37.78■■■■□ 3.64
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.77■■■■□ 3.64
FAAP20-201ENST00000378543 HECW2Q9P2P5 1572 aa37.77■■■■□ 3.64
FAAP20-201ENST00000378543 AFAP1Q8N556 730 aa37.76■■■■□ 3.64
FAAP20-201ENST00000378543 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa37.75■■■■□ 3.63
FAAP20-201ENST00000378543 KDM5CP41229 1560 aa37.74■■■■□ 3.63
FAAP20-201ENST00000378543 ABCC1P33527 1531 aa37.72■■■■□ 3.63
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.71■■■■□ 3.63
FAAP20-201ENST00000378543 ATP10AO60312 1499 aa37.71■■■■□ 3.63
FAAP20-201ENST00000378543 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.69■■■■□ 3.62
FAAP20-201ENST00000378543 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
FAAP20-201ENST00000378543 MTUS2Q5JR59 1369 aa37.68■■■■□ 3.62
FAAP20-201ENST00000378543 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.67■■■■□ 3.62
FAAP20-201ENST00000378543 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.66■■■■□ 3.62
FAAP20-201ENST00000378543 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.65■■■■□ 3.62
FAAP20-201ENST00000378543 MLECQ14165 292 aa37.62■■■■□ 3.61
FAAP20-201ENST00000378543 MYT1LQ9UL68 1186 aa37.62■■■■□ 3.61
FAAP20-201ENST00000378543 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.61■■■■□ 3.61
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.61■■■■□ 3.61
FAAP20-201ENST00000378543 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.59■■■■□ 3.61
FAAP20-201ENST00000378543 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.59■■■■□ 3.61
FAAP20-201ENST00000378543 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.57■■■■□ 3.61
FAAP20-201ENST00000378543 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa37.56■■■■□ 3.6
FAAP20-201ENST00000378543 ABCA6Q8N139 1617 aa37.56■■■■□ 3.6
FAAP20-201ENST00000378543 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.55■■■■□ 3.6
FAAP20-201ENST00000378543 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.53■■■■□ 3.6
FAAP20-201ENST00000378543 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.52■■■■□ 3.6
FAAP20-201ENST00000378543 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.51■■■■□ 3.6
FAAP20-201ENST00000378543 TIAM1Q13009 1591 aa37.5■■■■□ 3.59
FAAP20-201ENST00000378543 REREQ9P2R6 1566 aa37.49■■■■□ 3.59
FAAP20-201ENST00000378543 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.48■■■■□ 3.59
FAAP20-201ENST00000378543 VPS8Q8N3P4 1428 aa37.46■■■■□ 3.59
FAAP20-201ENST00000378543 PLPPR3Q6T4P5 718 aa37.46■■■■□ 3.59
FAAP20-201ENST00000378543 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.44■■■■□ 3.58
FAAP20-201ENST00000378543 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.44■■■■□ 3.58
FAAP20-201ENST00000378543 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP37.38■■■■□ 3.57
FAAP20-201ENST00000378543 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP37.37■■■■□ 3.57
FAAP20-201ENST00000378543 AGLP35573 1532 aa37.37■■■■□ 3.57
FAAP20-201ENST00000378543 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.37■■■■□ 3.57
FAAP20-201ENST00000378543 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
FAAP20-201ENST00000378543 NCOA2Q15596 1464 aa37.35■■■■□ 3.57
FAAP20-201ENST00000378543 ATP7AQ04656 1500 aa37.31■■■■□ 3.56
FAAP20-201ENST00000378543 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.3■■■■□ 3.56
FAAP20-201ENST00000378543 MBD5Q9P267 1494 aa37.27■■■■□ 3.56
FAAP20-201ENST00000378543 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP37.27■■■■□ 3.56
FAAP20-201ENST00000378543 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa37.26■■■■□ 3.56
FAAP20-201ENST00000378543 MAP3K1Q13233 1512 aa37.21■■■■□ 3.55
FAAP20-201ENST00000378543 HSPA2P54652 639 aa37.18■■■■□ 3.54
FAAP20-201ENST00000378543 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP37.18■■■■□ 3.54
FAAP20-201ENST00000378543 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.18■■■■□ 3.54
FAAP20-201ENST00000378543 A2MP01023 1474 aa37.17■■■■□ 3.54
FAAP20-201ENST00000378543 PLXNC1O60486 1568 aa37.17■■■■□ 3.54
FAAP20-201ENST00000378543 C3P01024 1663 aa37.16■■■■□ 3.54
FAAP20-201ENST00000378543 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP37.15■■■■□ 3.54
FAAP20-201ENST00000378543 PREX1Q8TCU6 1659 aa37.14■■■■□ 3.54
FAAP20-201ENST00000378543 ADGBQ8N7X0 1667 aa37.13■■■■□ 3.53
FAAP20-201ENST00000378543 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.1■■■■□ 3.53
FAAP20-201ENST00000378543 CCDC141Q6ZP82 1450 aa37.1■■■■□ 3.53
FAAP20-201ENST00000378543 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP37.09■■■■□ 3.53
FAAP20-201ENST00000378543 CNTLNQ9NXG0 1405 aa37.08■■■■□ 3.53
FAAP20-201ENST00000378543 RSPH4AQ5TD94 716 aa37.04■■■■□ 3.52
FAAP20-201ENST00000378543 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.03■■■■□ 3.52
FAAP20-201ENST00000378543 MROH2AA6NES4 1674 aa37.02■■■■□ 3.52
FAAP20-201ENST00000378543 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP37■■■■□ 3.51
FAAP20-201ENST00000378543 GGT6Q6P531 493 aa36.99■■■■□ 3.51
FAAP20-201ENST00000378543 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa36.99■■■■□ 3.51
FAAP20-201ENST00000378543 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
FAAP20-201ENST00000378543 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.97■■■■□ 3.51
FAAP20-201ENST00000378543 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.97■■■■□ 3.51
FAAP20-201ENST00000378543 APLP2Q06481 763 aa36.97■■■■□ 3.51
FAAP20-201ENST00000378543 ZMYM3Q14202 1370 aa36.95■■■■□ 3.51
FAAP20-201ENST00000378543 MIA2Q96PC5 1412 aa36.93■■■■□ 3.5
FAAP20-201ENST00000378543 TSPY4P0CV99 314 aa36.91■■■■□ 3.5
FAAP20-201ENST00000378543 TSPY10P0CW01 314 aa36.91■■■■□ 3.5
FAAP20-201ENST00000378543 NPATQ14207 1427 aa36.86■■■■□ 3.49
FAAP20-201ENST00000378543 PPP6R1Q9UPN7 881 aa36.86■■■■□ 3.49
FAAP20-201ENST00000378543 KIF3BO15066 747 aa36.85■■■■□ 3.49
FAAP20-201ENST00000378543 STRCQ7RTU9 1775 aa36.84■■■■□ 3.49
FAAP20-201ENST00000378543 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.84■■■■□ 3.49
FAAP20-201ENST00000378543 PTPRKQ15262 1439 aa36.78■■■■□ 3.48
FAAP20-201ENST00000378543 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.77■■■■□ 3.48
FAAP20-201ENST00000378543 KDM5DQ9BY66 1539 aa36.7■■■■□ 3.47
FAAP20-201ENST00000378543 MYO3AQ8NEV4 1616 aa36.7■■■■□ 3.47
FAAP20-201ENST00000378543 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.69■■■■□ 3.46
FAAP20-201ENST00000378543 FAM135AQ9P2D6 1515 aa36.68■■■■□ 3.46
FAAP20-201ENST00000378543 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.67■■■■□ 3.46
FAAP20-201ENST00000378543 DMRT2Q9Y5R5 561 aa36.67■■■■□ 3.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 136.5 ms