RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373162.5

TRAPPC3-202, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,056 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-202ENST00000373162 PREX2Q70Z35 1606 aa29.24■■■□□ 2.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.23■■■□□ 2.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 CEP162Q5TB80 1403 aa29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.22■■■□□ 2.27
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 YEATS2Q9ULM3 1422 aa29.2■■■□□ 2.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 KDM5CP41229 1560 aa29.18■■■□□ 2.26
TRAPPC3-202ENST00000373162 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 ABCC1P33527 1531 aa29.13■■■□□ 2.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.1■■■□□ 2.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 MADDQ8WXG6 1647 aa29.09■■■□□ 2.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 ITSN2Q9NZM3 1697 aa29.08■■■□□ 2.25
TRAPPC3-202ENST00000373162 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTPRMP28827 1452 aa29.06■■■□□ 2.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.03■■■□□ 2.24
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATP10AO60312 1499 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 MLH3Q9UHC1 1453 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa29.01■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa29■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 REREQ9P2R6 1566 aa29■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 C9orf84Q5VXU9 1444 aa28.99■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 ABCA6Q8N139 1617 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 AFAP1Q8N556 730 aa28.98■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 TIAM1Q13009 1591 aa28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.96■■■□□ 2.23
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 MTUS2Q5JR59 1369 aa28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.94■■■□□ 2.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 SYCP2Q9BX26 1530 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 VPS8Q8N3P4 1428 aa28.92■■■□□ 2.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.9■■■□□ 2.22
TRAPPC3-202ENST00000373162 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.88■■■□□ 2.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 AGLP35573 1532 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCNB3Q8WWL7 1395 aa28.87■■■□□ 2.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa28.85■■■□□ 2.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
TRAPPC3-202ENST00000373162 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP28.81■■■□□ 2.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAP3K1Q13233 1512 aa28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 NCOA2Q15596 1464 aa28.8■■■□□ 2.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 LMTK3Q96Q04 1460 aa28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 MBD5Q9P267 1494 aa28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
TRAPPC3-202ENST00000373162 ATP7AQ04656 1500 aa28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa28.76■■■□□ 2.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLXNC1O60486 1568 aa28.75■■■□□ 2.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 MLECQ14165 292 aa28.73■■■□□ 2.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
TRAPPC3-202ENST00000373162 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.66■■■□□ 2.18
TRAPPC3-202ENST00000373162 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa28.63■■■□□ 2.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 C3P01024 1663 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 ADGBQ8N7X0 1667 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 A2MP01023 1474 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYT1LQ9UL68 1186 aa28.62■■■□□ 2.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.61■■■□□ 2.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.59■■■□□ 2.17
TRAPPC3-202ENST00000373162 MROH2AA6NES4 1674 aa28.58■■■□□ 2.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.54■■■□□ 2.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYOM3Q5VTT5 1437 aa28.52■■■□□ 2.16
TRAPPC3-202ENST00000373162 MIA2Q96PC5 1412 aa28.51■■■□□ 2.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.5■■■□□ 2.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 RSPH4AQ5TD94 716 aa28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 PLPPR3Q6T4P5 718 aa28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 HSPA2P54652 639 aa28.46■■■□□ 2.15
TRAPPC3-202ENST00000373162 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 NPATQ14207 1427 aa28.42■■■□□ 2.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.41■■■□□ 2.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 FBXO41Q8TF61 875 aa28.4■■■□□ 2.14
TRAPPC3-202ENST00000373162 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZMYM3Q14202 1370 aa28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 STRCQ7RTU9 1775 aa28.38■■■□□ 2.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.36■■■□□ 2.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTPN23Q9H3S7 1636 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 PTPRKQ15262 1439 aa28.35■■■□□ 2.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.13
TRAPPC3-202ENST00000373162 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 FGD6Q6ZV73 1430 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.31■■■□□ 2.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 GGT6Q6P531 493 aa28.3■■■□□ 2.12
TRAPPC3-202ENST00000373162 MYO3AQ8NEV4 1616 aa28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35 ms