RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R37O75864 691 aa9.76□□□□□ -0.85
RABGGTB-202ENST00000370826 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP9.76□□□□□ -0.857e-13■□□□□ 8.1
RABGGTB-202ENST00000370826 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.74□□□□□ -0.85
RABGGTB-202ENST00000370826 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.72□□□□□ -0.85
RABGGTB-202ENST00000370826 SNPHO15079 494 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGGTB-202ENST00000370826 C3orf67Q6ZVT6 689 aa9.71□□□□□ -0.86
RABGGTB-202ENST00000370826 MARVELD3Q96A59 401 aa9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
RABGGTB-202ENST00000370826 DPY19L2Q6NUT2 758 aa9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-202ENST00000370826 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
RABGGTB-202ENST00000370826 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.66□□□□□ -0.86
RABGGTB-202ENST00000370826 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP9.64□□□□□ -0.87
RABGGTB-202ENST00000370826 EMP3P54852 163 aa9.61□□□□□ -0.87
RABGGTB-202ENST00000370826 MMRN1Q13201 1228 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-202ENST00000370826 SPNS2Q8IVW8 549 aa9.6□□□□□ -0.87
RABGGTB-202ENST00000370826 MICALL2Q8IY33 904 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-202ENST00000370826 BOLA1Q9Y3E2 137 aa9.59□□□□□ -0.87
RABGGTB-202ENST00000370826 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa9.56□□□□□ -0.88
RABGGTB-202ENST00000370826 G3V3G9 751 aa9.55□□□□□ -0.88
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM205CA6NFA0 338 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PDE4AP27815 886 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.53□□□□□ -0.88
RABGGTB-202ENST00000370826 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR70Q9NW82 654 aa9.52□□□□□ -0.89
RABGGTB-202ENST00000370826 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
RABGGTB-202ENST00000370826 POTEB3A0JP26 581 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-202ENST00000370826 POTEBQ6S5H4 581 aa9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-202ENST00000370826 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
RABGGTB-202ENST00000370826 MFSD10Q14728 455 aa9.48□□□□□ -0.89
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM92Q6UXU6 159 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 TMC2Q8TDI7 906 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.46□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 KIF3CO14782 793 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF710Q8N1W2 664 aa9.45□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 C2orf72A6NCS6 295 aa9.44□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 E2F4Q16254 413 aa9.43□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 DSG2Q14126 1118 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.42□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 FOXK1P85037 733 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.41□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 DOK7Q18PE1 504 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 P3H3Q8IVL6 736 aa9.4□□□□□ -0.9
RABGGTB-202ENST00000370826 CAMK2BQ13554 666 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-202ENST00000370826 BCANQ96GW7 911 aa9.39□□□□□ -0.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ERBB3P21860 1342 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-202ENST00000370826 PLPP6Q8IY26 295 aa9.38□□□□□ -0.91
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP9.37□□□□□ -0.91
RABGGTB-202ENST00000370826 RIMBP2O15034 1052 aa9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RABGGTB-202ENST00000370826 NBR1Q14596 966 aa9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-202ENST00000370826 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP9.33□□□□□ -0.92
RABGGTB-202ENST00000370826 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-202ENST00000370826 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
RABGGTB-202ENST00000370826 DPYSL4O14531 572 aa9.27□□□□□ -0.93
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC34A2O95436 690 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-202ENST00000370826 OXER1Q8TDS5 423 aa9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-202ENST00000370826 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
RABGGTB-202ENST00000370826 MAP3K9P80192 1104 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-202ENST00000370826 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa9.24□□□□□ -0.93
RABGGTB-202ENST00000370826 SEMA3EO15041 775 aa9.23□□□□□ -0.93
RABGGTB-202ENST00000370826 GPR153Q6NV75 609 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-202ENST00000370826 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.22□□□□□ -0.93
RABGGTB-202ENST00000370826 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF687Q8N1G0 1237 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-202ENST00000370826 PDIA6Q15084 440 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ARSIQ5FYB1 569 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-202ENST00000370826 TBC1D12O60347 775 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa9.18□□□□□ -0.94
RABGGTB-202ENST00000370826 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP9.17□□□□□ -0.941e-9■■□□□ 11.9
RABGGTB-202ENST00000370826 EVI5O60447 810 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.16□□□□□ -0.94
RABGGTB-202ENST00000370826 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-202ENST00000370826 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP9.15□□□□□ -0.94
RABGGTB-202ENST00000370826 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
RABGGTB-202ENST00000370826 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.13□□□□□ -0.95
RABGGTB-202ENST00000370826 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-202ENST00000370826 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-202ENST00000370826 PTGER2P43116 358 aa9.12□□□□□ -0.95
RABGGTB-202ENST00000370826 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-202ENST00000370826 NUDT7P0C024 238 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-202ENST00000370826 LMOD2Q6P5Q4 547 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-202ENST00000370826 DDX12PQ92771 950 aa9.09□□□□□ -0.95
RABGGTB-202ENST00000370826 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP9.08□□□□□ -0.96
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-202ENST00000370826 TPRNQ4KMQ1 711 aa9.06□□□□□ -0.96
RABGGTB-202ENST00000370826 OSBPP22059 807 aa9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
RABGGTB-202ENST00000370826 PHF14O94880 888 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-202ENST00000370826 AXIN2Q9Y2T1 843 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGGTB-202ENST00000370826 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-202ENST00000370826 LHX6Q9UPM6 363 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-202ENST00000370826 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGGTB-202ENST00000370826 FOSBP53539 338 aa9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms