RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368358.3

HCN3-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN3, Length 3,718 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3-201ENST00000368358 POLR3GLQ9BT43 218 aa19.02■□□□□ 0.64
HCN3-201ENST00000368358 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 MPHOSPH9Q99550 1183 aa19■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa19■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa18.98■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP18.97■□□□□ 0.63
HCN3-201ENST00000368358 MIA2Q96PC5 1412 aa18.95■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 AFAP1Q8N556 730 aa18.95■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 NAIPQ13075 1403 aa18.94■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa18.94■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa18.94■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.94■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 PKD2Q13563 968 aa18.94■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 DAPK1P53355 1430 aa18.93■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 KIF14Q15058 1648 aa18.93■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.92■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 HFM1A2PYH4 1435 aa18.91■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 ABCC5O15440 1437 aa18.91■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 RGL3Q3MIN7 710 aa18.91■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 NUP155O75694 1391 aa18.91■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa18.9■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP18.9■□□□□ 0.62
HCN3-201ENST00000368358 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
HCN3-201ENST00000368358 ABCA8O94911 1581 aa18.86■□□□□ 0.61
HCN3-201ENST00000368358 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
HCN3-201ENST00000368358 KIF15Q9NS87 1388 aa18.85■□□□□ 0.61
HCN3-201ENST00000368358 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.82■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 ABCC2Q92887 1545 aa18.82■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa18.81■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.8■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.8■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 KIF3BO15066 747 aa18.79■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 FAM69CQ0P6D2 419 aa18.79■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 GGT6Q6P531 493 aa18.79■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 RSPH4AQ5TD94 716 aa18.77■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.77■□□□□ 0.6
HCN3-201ENST00000368358 NCOA1Q15788 1441 aa18.76■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 ASXL2Q76L83 1435 aa18.75■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 MAPKBP1O60336 1514 aa18.74■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 RAPGEF3O95398 923 aa18.74■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.74■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 AKNAQ7Z591 1439 aa18.74■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.72■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.71■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 SCAPERQ9BY12 1400 aa18.71■□□□□ 0.59
HCN3-201ENST00000368358 MLECQ14165 292 aa18.7■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 ABCC10Q5T3U5 1492 aa18.7■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 SYCP2Q9BX26 1530 aa18.7■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 ANP32CO43423 234 aa18.69■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 ROCK1Q13464 1354 aa18.69■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 KDM6BO15054 1643 aa18.68■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 CCDC141Q6ZP82 1450 aa18.68■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.67■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 WDR7Q9Y4E6 1490 aa18.67■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP18.66■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 SHROOM2Q13796 1616 aa18.65■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.65■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 TTC37Q6PGP7 1564 aa18.65■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 PLCH2O75038 1416 aa18.65■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa18.65■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.64■□□□□ 0.58
HCN3-201ENST00000368358 CD109Q6YHK3 1445 aa18.64■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 FANCAO15360 1455 aa18.63■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 KDM5BQ9UGL1 1544 aa18.62■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 ADGRL1O94910 1474 aa18.6■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa18.6■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa18.58■□□□□ 0.57
HCN3-201ENST00000368358 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.58■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.57■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.57■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 MBD5Q9P267 1494 aa18.56■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa18.55■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa18.55■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa18.55■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 KANK1Q14678 1352 aa18.54■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.54■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa18.53■□□□□ 0.56
HCN3-201ENST00000368358 CCDC144AA2RUR9 1427 aa18.52■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.51■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa18.51■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 BCANQ96GW7 911 aa18.49■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 MYO5CQ9NQX4 1742 aa18.48■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 PREX2Q70Z35 1606 aa18.47■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 PZPP20742 1482 aa18.46■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa18.46■□□□□ 0.55
HCN3-201ENST00000368358 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.44■□□□□ 0.54
HCN3-201ENST00000368358 ADGRL2O95490 1459 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.4 ms