RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367651.3

CITED2-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED2, Length 2,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED2-201ENST00000367651 NCOA1Q15788 1441 aa26.07■■□□□ 1.76
CITED2-201ENST00000367651 CCDC7Q96M83 1385 aa26.05■■□□□ 1.76
CITED2-201ENST00000367651 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.05■■□□□ 1.76
CITED2-201ENST00000367651 TEX14Q8IWB6 1497 aa26.03■■□□□ 1.76
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa26.02■■□□□ 1.76
CITED2-201ENST00000367651 MSH5O43196 834 aa26.02■■□□□ 1.76
CITED2-201ENST00000367651 DAPK1P53355 1430 aa26.02■■□□□ 1.76
CITED2-201ENST00000367651 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
CITED2-201ENST00000367651 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
CITED2-201ENST00000367651 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
CITED2-201ENST00000367651 ABCC5O15440 1437 aa25.98■■□□□ 1.75
CITED2-201ENST00000367651 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CITED2-201ENST00000367651 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.96■■□□□ 1.75
CITED2-201ENST00000367651 ROCK1Q13464 1354 aa25.96■■□□□ 1.75
CITED2-201ENST00000367651 ERCC6Q03468 1493 aa25.95■■□□□ 1.75
CITED2-201ENST00000367651 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.94■■□□□ 1.74
CITED2-201ENST00000367651 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.93■■□□□ 1.74
CITED2-201ENST00000367651 MRS2Q9HD23 443 aa25.92■■□□□ 1.74
CITED2-201ENST00000367651 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
CITED2-201ENST00000367651 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.9■■□□□ 1.74
CITED2-201ENST00000367651 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
CITED2-201ENST00000367651 DISP1Q96F81 1524 aa25.89■■□□□ 1.73
CITED2-201ENST00000367651 KIAA0556O60303 1618 aa25.89■■□□□ 1.73
CITED2-201ENST00000367651 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
CITED2-201ENST00000367651 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CITED2-201ENST00000367651 ZBED9Q6R2W3 1325 aa25.86■■□□□ 1.73
CITED2-201ENST00000367651 PZPP20742 1482 aa25.85■■□□□ 1.73
CITED2-201ENST00000367651 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.85■■□□□ 1.73
CITED2-201ENST00000367651 IFT140Q96RY7 1462 aa25.85■■□□□ 1.73
CITED2-201ENST00000367651 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.84■■□□□ 1.73
CITED2-201ENST00000367651 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.82■■□□□ 1.72
CITED2-201ENST00000367651 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.82■■□□□ 1.72
CITED2-201ENST00000367651 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.79■■□□□ 1.72
CITED2-201ENST00000367651 MBD5Q9P267 1494 aa25.78■■□□□ 1.72
CITED2-201ENST00000367651 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.78■■□□□ 1.72
CITED2-201ENST00000367651 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.78■■□□□ 1.72
CITED2-201ENST00000367651 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP25.77■■□□□ 1.72
CITED2-201ENST00000367651 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.77■■□□□ 1.72
CITED2-201ENST00000367651 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
CITED2-201ENST00000367651 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
CITED2-201ENST00000367651 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.72■■□□□ 1.71
CITED2-201ENST00000367651 KIF14Q15058 1648 aa25.71■■□□□ 1.71
CITED2-201ENST00000367651 BCL11AQ9H165 835 aa25.69■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 USP47Q96K76 1375 aa25.69■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.68■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.68■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 GRIN2AQ12879 1464 aa25.68■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.67■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.66■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 PLB1Q6P1J6 1458 aa25.66■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.66■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 KDM5CP41229 1560 aa25.66■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
CITED2-201ENST00000367651 ADGRL2O95490 1459 aa25.64■■□□□ 1.69
CITED2-201ENST00000367651 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
CITED2-201ENST00000367651 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.63■■□□□ 1.69
CITED2-201ENST00000367651 PKD2Q13563 968 aa25.63■■□□□ 1.69
CITED2-201ENST00000367651 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
CITED2-201ENST00000367651 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.61■■□□□ 1.69
CITED2-201ENST00000367651 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.56■■□□□ 1.68
CITED2-201ENST00000367651 CEP170Q5SW79 1584 aa25.56■■□□□ 1.68
CITED2-201ENST00000367651 NUDCQ9Y266 331 aa25.55■■□□□ 1.68
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.55■■□□□ 1.68
CITED2-201ENST00000367651 FBLN2P98095 1184 aa25.55■■□□□ 1.68
CITED2-201ENST00000367651 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.54■■□□□ 1.68
CITED2-201ENST00000367651 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CITED2-201ENST00000367651 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.52■■□□□ 1.68
CITED2-201ENST00000367651 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.52■■□□□ 1.68
CITED2-201ENST00000367651 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.52■■□□□ 1.68
CITED2-201ENST00000367651 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.52■■□□□ 1.68
CITED2-201ENST00000367651 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CITED2-201ENST00000367651 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
CITED2-201ENST00000367651 NUP155O75694 1391 aa25.47■■□□□ 1.67
CITED2-201ENST00000367651 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CITED2-201ENST00000367651 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.45■■□□□ 1.66
CITED2-201ENST00000367651 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.45■■□□□ 1.66
CITED2-201ENST00000367651 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.43■■□□□ 1.66
CITED2-201ENST00000367651 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.43■■□□□ 1.66
CITED2-201ENST00000367651 SYNJ2O15056 1496 aa25.42■■□□□ 1.66
CITED2-201ENST00000367651 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.42■■□□□ 1.66
CITED2-201ENST00000367651 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CITED2-201ENST00000367651 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.41■■□□□ 1.66
CITED2-201ENST00000367651 TMC1Q8TDI8 760 aa25.41■■□□□ 1.66
CITED2-201ENST00000367651 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.41■■□□□ 1.66
CITED2-201ENST00000367651 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.4■■□□□ 1.66
CITED2-201ENST00000367651 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.4■■□□□ 1.66
CITED2-201ENST00000367651 E9PCH4 1651 aa25.39■■□□□ 1.65
CITED2-201ENST00000367651 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CITED2-201ENST00000367651 KIF15Q9NS87 1388 aa25.39■■□□□ 1.65
CITED2-201ENST00000367651 ABCA8O94911 1581 aa25.37■■□□□ 1.65
CITED2-201ENST00000367651 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
CITED2-201ENST00000367651 JPH4Q96JJ6 628 aa25.36■■□□□ 1.65
CITED2-201ENST00000367651 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa25.35■■□□□ 1.65
CITED2-201ENST00000367651 ATP10BO94823 1461 aa25.35■■□□□ 1.65
CITED2-201ENST00000367651 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.35■■□□□ 1.65
CITED2-201ENST00000367651 PTPRGP23470 1445 aa25.34■■□□□ 1.65
CITED2-201ENST00000367651 NUP160Q12769 1436 aa25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms