RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa12.42□□□□□ -0.42
SGMS1-201ENST00000361543 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa12.42□□□□□ -0.42
SGMS1-201ENST00000361543 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP12.41□□□□□ -0.42
SGMS1-201ENST00000361543 PLCH2O75038 1416 aa12.41□□□□□ -0.42
SGMS1-201ENST00000361543 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa12.4□□□□□ -0.42
SGMS1-201ENST00000361543 CEP162Q5TB80 1403 aa12.4□□□□□ -0.42
SGMS1-201ENST00000361543 RAPGEF3O95398 923 aa12.4□□□□□ -0.42
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGAP5Q13017 1502 aa12.4□□□□□ -0.42
SGMS1-201ENST00000361543 POGZQ7Z3K3 1410 aa12.37□□□□□ -0.43
SGMS1-201ENST00000361543 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa12.37□□□□□ -0.43
SGMS1-201ENST00000361543 BCORL1Q5H9F3 1711 aa12.37□□□□□ -0.43
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTSL3P82987 1691 aa12.35□□□□□ -0.43
SGMS1-201ENST00000361543 ITSN2Q9NZM3 1697 aa12.35□□□□□ -0.43
SGMS1-201ENST00000361543 SCAPERQ9BY12 1400 aa12.35□□□□□ -0.43
SGMS1-201ENST00000361543 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa12.34□□□□□ -0.43
SGMS1-201ENST00000361543 ABCC1P33527 1531 aa12.34□□□□□ -0.43
SGMS1-201ENST00000361543 ADRA2BP18089 450 aa12.34□□□□□ -0.43
SGMS1-201ENST00000361543 MAGI2Q86UL8 1455 aa12.34□□□□□ -0.43
SGMS1-201ENST00000361543 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa12.33□□□□□ -0.44
SGMS1-201ENST00000361543 KDM5CP41229 1560 aa12.33□□□□□ -0.44
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa12.33□□□□□ -0.44
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SGMS1-201ENST00000361543 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa12.32□□□□□ -0.44
SGMS1-201ENST00000361543 YEATS2Q9ULM3 1422 aa12.31□□□□□ -0.44
SGMS1-201ENST00000361543 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP12.3□□□□□ -0.44
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SGMS1-201ENST00000361543 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa12.29□□□□□ -0.44
SGMS1-201ENST00000361543 ABCA6Q8N139 1617 aa12.29□□□□□ -0.44
SGMS1-201ENST00000361543 MTUS2Q5JR59 1369 aa12.29□□□□□ -0.44
SGMS1-201ENST00000361543 TIAM1Q13009 1591 aa12.28□□□□□ -0.44
SGMS1-201ENST00000361543 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa12.28□□□□□ -0.44
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SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa12.27□□□□□ -0.45
SGMS1-201ENST00000361543 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP12.27□□□□□ -0.45
SGMS1-201ENST00000361543 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa12.26□□□□□ -0.45
SGMS1-201ENST00000361543 PPP6R1Q9UPN7 881 aa12.26□□□□□ -0.45
SGMS1-201ENST00000361543 C9orf84Q5VXU9 1444 aa12.26□□□□□ -0.45
SGMS1-201ENST00000361543 VPS8Q8N3P4 1428 aa12.26□□□□□ -0.45
SGMS1-201ENST00000361543 ATP10AO60312 1499 aa12.26□□□□□ -0.45
SGMS1-201ENST00000361543 PTPRMP28827 1452 aa12.26□□□□□ -0.45
SGMS1-201ENST00000361543 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa12.25□□□□□ -0.45
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SGMS1-201ENST00000361543 MLH3Q9UHC1 1453 aa12.24□□□□□ -0.45
SGMS1-201ENST00000361543 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa12.24□□□□□ -0.45
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SGMS1-201ENST00000361543 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa12.22□□□□□ -0.45
SGMS1-201ENST00000361543 AFAP1Q8N556 730 aa12.22□□□□□ -0.45
SGMS1-201ENST00000361543 NCOA2Q15596 1464 aa12.21□□□□□ -0.46
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SGMS1-201ENST00000361543 ATP7AQ04656 1500 aa12.2□□□□□ -0.46
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SGMS1-201ENST00000361543 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa12.19□□□□□ -0.46
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SGMS1-201ENST00000361543 MAP3K1Q13233 1512 aa12.18□□□□□ -0.46
SGMS1-201ENST00000361543 ADGBQ8N7X0 1667 aa12.18□□□□□ -0.46
SGMS1-201ENST00000361543 AGLP35573 1532 aa12.17□□□□□ -0.46
SGMS1-201ENST00000361543 MLECQ14165 292 aa12.16□□□□□ -0.46
SGMS1-201ENST00000361543 PLXNC1O60486 1568 aa12.16□□□□□ -0.46
SGMS1-201ENST00000361543 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa12.15□□□□□ -0.46
SGMS1-201ENST00000361543 PREX1Q8TCU6 1659 aa12.15□□□□□ -0.46
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SGMS1-201ENST00000361543 C3P01024 1663 aa12.14□□□□□ -0.47
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SGMS1-201ENST00000361543 MBD5Q9P267 1494 aa12.14□□□□□ -0.47
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO41Q8TF61 875 aa12.13□□□□□ -0.47
SGMS1-201ENST00000361543 LMTK3Q96Q04 1460 aa12.13□□□□□ -0.47
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGEF5Q12774 1597 aa12.13□□□□□ -0.47
SGMS1-201ENST00000361543 MROH2AA6NES4 1674 aa12.13□□□□□ -0.47
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP12.12□□□□□ -0.47
SGMS1-201ENST00000361543 CCDC141Q6ZP82 1450 aa12.12□□□□□ -0.47
SGMS1-201ENST00000361543 A2MP01023 1474 aa12.1□□□□□ -0.47
SGMS1-201ENST00000361543 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
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SGMS1-201ENST00000361543 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa12.08□□□□□ -0.48
SGMS1-201ENST00000361543 MYOM3Q5VTT5 1437 aa12.08□□□□□ -0.48
SGMS1-201ENST00000361543 CNTLNQ9NXG0 1405 aa12.07□□□□□ -0.48
SGMS1-201ENST00000361543 MAST1Q9Y2H9 1570 aa12.07□□□□□ -0.48
SGMS1-201ENST00000361543 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
SGMS1-201ENST00000361543 MIA2Q96PC5 1412 aa12.05□□□□□ -0.48
SGMS1-201ENST00000361543 PTPN23Q9H3S7 1636 aa12.05□□□□□ -0.48
SGMS1-201ENST00000361543 APLP2Q06481 763 aa12.05□□□□□ -0.48
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SGMS1-201ENST00000361543 RSPH4AQ5TD94 716 aa12.02□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa12.02□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 MYO3AQ8NEV4 1616 aa12.01□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.01□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 HSPA2P54652 639 aa12□□□□□ -0.49
SGMS1-201ENST00000361543 FGD6Q6ZV73 1430 aa12□□□□□ -0.49
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