RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335497.11

RNF220-201, Transcript of ring finger protein 220, humanhuman

TSL 5

Gene RNF220, Length 1,203 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220-201ENST00000335497 KIF14Q15058 1648 aa42.55■■■■■ 4.4
RNF220-201ENST00000335497 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.54■■■■■ 4.4
RNF220-201ENST00000335497 CLIP1P30622 1438 aa42.52■■■■■ 4.4
RNF220-201ENST00000335497 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.52■■■■■ 4.4
RNF220-201ENST00000335497 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa42.51■■■■■ 4.4
RNF220-201ENST00000335497 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa42.46■■■■■ 4.39
RNF220-201ENST00000335497 CCDC18Q5T9S5 1454 aa42.42■■■■■ 4.38
RNF220-201ENST00000335497 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.41■■■■■ 4.38
RNF220-201ENST00000335497 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP42.4■■■■■ 4.38
RNF220-201ENST00000335497 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.39■■■■■ 4.38
RNF220-201ENST00000335497 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.39■■■■■ 4.38
RNF220-201ENST00000335497 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.38■■■■■ 4.38
RNF220-201ENST00000335497 ATP10AO60312 1499 aa42.34■■■■■ 4.37
RNF220-201ENST00000335497 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.34■■■■■ 4.37
RNF220-201ENST00000335497 FYCO1Q9BQS8 1478 aa42.29■■■■■ 4.36
RNF220-201ENST00000335497 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.29■■■■■ 4.36
RNF220-201ENST00000335497 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.27■■■■■ 4.36
RNF220-201ENST00000335497 KDM5CP41229 1560 aa42.27■■■■■ 4.36
RNF220-201ENST00000335497 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.24■■■■■ 4.35
RNF220-201ENST00000335497 AFAP1Q8N556 730 aa42.24■■■■■ 4.35
RNF220-201ENST00000335497 MLECQ14165 292 aa42.23■■■■■ 4.35
RNF220-201ENST00000335497 PREX2Q70Z35 1606 aa42.23■■■■■ 4.35
RNF220-201ENST00000335497 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.19■■■■■ 4.34
RNF220-201ENST00000335497 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.16■■■■■ 4.34
RNF220-201ENST00000335497 ABCC1P33527 1531 aa42.13■■■■■ 4.33
RNF220-201ENST00000335497 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.12■■■■■ 4.33
RNF220-201ENST00000335497 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.11■■■■■ 4.33
RNF220-201ENST00000335497 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.1■■■■■ 4.33
RNF220-201ENST00000335497 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.09■■■■■ 4.33
RNF220-201ENST00000335497 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.08■■■■■ 4.33
RNF220-201ENST00000335497 REREQ9P2R6 1566 aa42.07■■■■■ 4.33
RNF220-201ENST00000335497 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.07■■■■■ 4.33
RNF220-201ENST00000335497 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.06■■■■■ 4.32
RNF220-201ENST00000335497 ABCA6Q8N139 1617 aa42.01■■■■■ 4.32
RNF220-201ENST00000335497 HSPA2P54652 639 aa41.98■■■■■ 4.31
RNF220-201ENST00000335497 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP41.97■■■■■ 4.31
RNF220-201ENST00000335497 AGLP35573 1532 aa41.93■■■■■ 4.3
RNF220-201ENST00000335497 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.91■■■■■ 4.3
RNF220-201ENST00000335497 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
RNF220-201ENST00000335497 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa41.91■■■■■ 4.3
RNF220-201ENST00000335497 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.88■■■■■ 4.29
RNF220-201ENST00000335497 MTUS2Q5JR59 1369 aa41.87■■■■■ 4.29
RNF220-201ENST00000335497 FBXO41Q8TF61 875 aa41.86■■■■■ 4.29
RNF220-201ENST00000335497 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.85■■■■■ 4.29
RNF220-201ENST00000335497 SYCP2Q9BX26 1530 aa41.84■■■■■ 4.29
RNF220-201ENST00000335497 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP41.83■■■■■ 4.29
RNF220-201ENST00000335497 CCNB3Q8WWL7 1395 aa41.83■■■■■ 4.29
RNF220-201ENST00000335497 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.83■■■■■ 4.29
RNF220-201ENST00000335497 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.81■■■■■ 4.28
RNF220-201ENST00000335497 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP41.79■■■■■ 4.28
RNF220-201ENST00000335497 CEP162Q5TB80 1403 aa41.78■■■■■ 4.28
RNF220-201ENST00000335497 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.78■■■■■ 4.28
RNF220-201ENST00000335497 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
RNF220-201ENST00000335497 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.76■■■■■ 4.28
RNF220-201ENST00000335497 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa41.72■■■■■ 4.27
RNF220-201ENST00000335497 C3P01024 1663 aa41.71■■■■■ 4.27
RNF220-201ENST00000335497 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.71■■■■■ 4.27
RNF220-201ENST00000335497 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.69■■■■■ 4.27
RNF220-201ENST00000335497 ATP7AQ04656 1500 aa41.68■■■■■ 4.26
RNF220-201ENST00000335497 TIAM1Q13009 1591 aa41.66■■■■■ 4.26
RNF220-201ENST00000335497 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.65■■■■■ 4.26
RNF220-201ENST00000335497 PLXNC1O60486 1568 aa41.58■■■■■ 4.25
RNF220-201ENST00000335497 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
RNF220-201ENST00000335497 A2MP01023 1474 aa41.57■■■■■ 4.25
RNF220-201ENST00000335497 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
RNF220-201ENST00000335497 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.55■■■■■ 4.24
RNF220-201ENST00000335497 MROH2AA6NES4 1674 aa41.55■■■■■ 4.24
RNF220-201ENST00000335497 MBD5Q9P267 1494 aa41.53■■■■■ 4.24
RNF220-201ENST00000335497 STRCQ7RTU9 1775 aa41.53■■■■■ 4.24
RNF220-201ENST00000335497 CERKQ8TCT0 537 aa41.49■■■■■ 4.23
RNF220-201ENST00000335497 NPATQ14207 1427 aa41.48■■■■■ 4.23
RNF220-201ENST00000335497 ZMYM3Q14202 1370 aa41.48■■■■■ 4.23
RNF220-201ENST00000335497 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.47■■■■■ 4.23
RNF220-201ENST00000335497 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.46■■■■■ 4.23
RNF220-201ENST00000335497 NCOA2Q15596 1464 aa41.46■■■■■ 4.23
RNF220-201ENST00000335497 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.4■■■■■ 4.22
RNF220-201ENST00000335497 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
RNF220-201ENST00000335497 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa41.38■■■■■ 4.21
RNF220-201ENST00000335497 GGT6Q6P531 493 aa41.38■■■■■ 4.21
RNF220-201ENST00000335497 PTPRTO14522 1441 aa41.37■■■■■ 4.21
RNF220-201ENST00000335497 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.37■■■■■ 4.21
RNF220-201ENST00000335497 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.36■■■■■ 4.21
RNF220-201ENST00000335497 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.34■■■■■ 4.21
RNF220-201ENST00000335497 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.34■■■■■ 4.21
RNF220-201ENST00000335497 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.33■■■■■ 4.21
RNF220-201ENST00000335497 NCOA1Q15788 1441 aa41.3■■■■■ 4.2
RNF220-201ENST00000335497 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.28■■■■■ 4.2
RNF220-201ENST00000335497 PTPRKQ15262 1439 aa41.27■■■■■ 4.2
RNF220-201ENST00000335497 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.22■■■■■ 4.19
RNF220-201ENST00000335497 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.22■■■■■ 4.19
RNF220-201ENST00000335497 MAP3K1Q13233 1512 aa41.21■■■■■ 4.19
RNF220-201ENST00000335497 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.19■■■■■ 4.18
RNF220-201ENST00000335497 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.19■■■■■ 4.18
RNF220-201ENST00000335497 KIF3BO15066 747 aa41.17■■■■■ 4.18
RNF220-201ENST00000335497 TSPY4P0CV99 314 aa41.15■■■■■ 4.18
RNF220-201ENST00000335497 TSPY10P0CW01 314 aa41.15■■■■■ 4.18
RNF220-201ENST00000335497 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
RNF220-201ENST00000335497 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.13■■■■■ 4.18
RNF220-201ENST00000335497 PLA2R1Q13018 1463 aa41.1■■■■■ 4.17
RNF220-201ENST00000335497 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.1■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms