RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
NOP56-201ENST00000329276 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.14■■□□□ 1.78
NOP56-201ENST00000329276 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.14■■□□□ 1.78
NOP56-201ENST00000329276 NUDCQ9Y266 331 aa26.13■■□□□ 1.77
NOP56-201ENST00000329276 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
NOP56-201ENST00000329276 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.09■■□□□ 1.77
NOP56-201ENST00000329276 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
NOP56-201ENST00000329276 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26.08■■□□□ 1.76
NOP56-201ENST00000329276 ARHGEF11O15085 1522 aa26.08■■□□□ 1.76
NOP56-201ENST00000329276 UGGT2Q9NYU1 1516 aa26.08■■□□□ 1.76
NOP56-201ENST00000329276 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
NOP56-201ENST00000329276 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa26.07■■□□□ 1.76
NOP56-201ENST00000329276 SAMD9Q5K651 1589 aa26.05■■□□□ 1.76
NOP56-201ENST00000329276 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.05■■□□□ 1.76
NOP56-201ENST00000329276 GRIN2BQ13224 1484 aa26.05■■□□□ 1.76
NOP56-201ENST00000329276 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.05■■□□□ 1.76
NOP56-201ENST00000329276 USP35Q9P2H5 1018 aa26.04■■□□□ 1.76
NOP56-201ENST00000329276 KIF7Q2M1P5 1343 aa26.03■■□□□ 1.76
NOP56-201ENST00000329276 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
NOP56-201ENST00000329276 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
NOP56-201ENST00000329276 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.99■■□□□ 1.75
NOP56-201ENST00000329276 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.97■■□□□ 1.75
NOP56-201ENST00000329276 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.97■■□□□ 1.75
NOP56-201ENST00000329276 MIA2Q96PC5 1412 aa25.97■■□□□ 1.75
NOP56-201ENST00000329276 IL27Q8NEV9 243 aa25.94■■□□□ 1.74
NOP56-201ENST00000329276 KDM6BO15054 1643 aa25.94■■□□□ 1.74
NOP56-201ENST00000329276 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
NOP56-201ENST00000329276 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.92■■□□□ 1.74
NOP56-201ENST00000329276 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
NOP56-201ENST00000329276 WDR62O43379 1518 aa25.9■■□□□ 1.74
NOP56-201ENST00000329276 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.89■■□□□ 1.74
NOP56-201ENST00000329276 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
NOP56-201ENST00000329276 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
NOP56-201ENST00000329276 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.86■■□□□ 1.73
NOP56-201ENST00000329276 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
NOP56-201ENST00000329276 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.86■■□□□ 1.73
NOP56-201ENST00000329276 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.85■■□□□ 1.73
NOP56-201ENST00000329276 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.84■■□□□ 1.73
NOP56-201ENST00000329276 MS4A1P11836 297 aa25.84■■□□□ 1.73
NOP56-201ENST00000329276 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.72
NOP56-201ENST00000329276 NEFMP07197 916 aa25.82■■□□□ 1.72
NOP56-201ENST00000329276 ROCK1Q13464 1354 aa25.82■■□□□ 1.72
NOP56-201ENST00000329276 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
NOP56-201ENST00000329276 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
NOP56-201ENST00000329276 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
NOP56-201ENST00000329276 PDE4AP27815 886 aa25.77■■□□□ 1.72
NOP56-201ENST00000329276 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
NOP56-201ENST00000329276 BACH2Q9BYV9 841 aa25.76■■□□□ 1.71
NOP56-201ENST00000329276 FOXD1Q16676 465 aa25.75■■□□□ 1.71
NOP56-201ENST00000329276 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
NOP56-201ENST00000329276 IFT140Q96RY7 1462 aa25.75■■□□□ 1.71
NOP56-201ENST00000329276 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
NOP56-201ENST00000329276 MBD5Q9P267 1494 aa25.73■■□□□ 1.71
NOP56-201ENST00000329276 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.73■■□□□ 1.71
NOP56-201ENST00000329276 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
NOP56-201ENST00000329276 TMC1Q8TDI8 760 aa25.73■■□□□ 1.71
NOP56-201ENST00000329276 USP47Q96K76 1375 aa25.71■■□□□ 1.71
NOP56-201ENST00000329276 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.71■■□□□ 1.71
NOP56-201ENST00000329276 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 KIF14Q15058 1648 aa25.69■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 KDM5CP41229 1560 aa25.67■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 DAPK1P53355 1430 aa25.67■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 KIF15Q9NS87 1388 aa25.66■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa25.66■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 EXOC6Q8TAG9 804 aa25.65■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 PDE3BQ13370 1112 aa25.64■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.64■■□□□ 1.7
NOP56-201ENST00000329276 PBRM1Q86U86 1689 aa25.63■■□□□ 1.69
NOP56-201ENST00000329276 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
NOP56-201ENST00000329276 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
NOP56-201ENST00000329276 GSE1Q14687 1217 aa25.6■■□□□ 1.69
NOP56-201ENST00000329276 RALBP1Q15311 655 aa25.6■■□□□ 1.69
NOP56-201ENST00000329276 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
NOP56-201ENST00000329276 ABCC5O15440 1437 aa25.58■■□□□ 1.69
NOP56-201ENST00000329276 PZPP20742 1482 aa25.56■■□□□ 1.68
NOP56-201ENST00000329276 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.55■■□□□ 1.68
NOP56-201ENST00000329276 POLR3GLQ9BT43 218 aa25.55■■□□□ 1.68
NOP56-201ENST00000329276 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.54■■□□□ 1.68
NOP56-201ENST00000329276 FBLN2P98095 1184 aa25.53■■□□□ 1.68
NOP56-201ENST00000329276 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.53■■□□□ 1.68
NOP56-201ENST00000329276 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
NOP56-201ENST00000329276 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
NOP56-201ENST00000329276 E9PCH4 1651 aa25.5■■□□□ 1.67
NOP56-201ENST00000329276 BRPF3Q9ULD4 1205 aa25.49■■□□□ 1.67
NOP56-201ENST00000329276 INSRP06213 1382 aa25.48■■□□□ 1.67
NOP56-201ENST00000329276 ADAMTS12P58397 1594 aa25.48■■□□□ 1.67
NOP56-201ENST00000329276 NFKBIBQ15653 356 aa25.47■■□□□ 1.67
NOP56-201ENST00000329276 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.47■■□□□ 1.67
NOP56-201ENST00000329276 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.46■■□□□ 1.67
NOP56-201ENST00000329276 NLRP13Q86W25 1043 aa25.44■■□□□ 1.66
NOP56-201ENST00000329276 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.44■■□□□ 1.66
NOP56-201ENST00000329276 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.43■■□□□ 1.66
NOP56-201ENST00000329276 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
NOP56-201ENST00000329276 IQGAP2Q13576 1575 aa25.43■■□□□ 1.66
NOP56-201ENST00000329276 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
NOP56-201ENST00000329276 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
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