RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317555.6

PGAM5-201, Transcript of PGAM family member 5, mitochondrial serine/threonine protein phosphatase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGAM5, Length 1,182 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5-201ENST00000317555 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa43■■■■■ 4.47
PGAM5-201ENST00000317555 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.96■■■■■ 4.47
PGAM5-201ENST00000317555 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.95■■■■■ 4.47
PGAM5-201ENST00000317555 PREX2Q70Z35 1606 aa42.93■■■■■ 4.46
PGAM5-201ENST00000317555 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.91■■■■■ 4.46
PGAM5-201ENST00000317555 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.89■■■■■ 4.46
PGAM5-201ENST00000317555 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.89■■■■■ 4.46
PGAM5-201ENST00000317555 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.85■■■■■ 4.45
PGAM5-201ENST00000317555 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP42.84■■■■■ 4.45
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PGAM5-201ENST00000317555 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.8■■■■■ 4.44
PGAM5-201ENST00000317555 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.8■■■■■ 4.44
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PGAM5-201ENST00000317555 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.69■■■■■ 4.42
PGAM5-201ENST00000317555 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.68■■■■■ 4.42
PGAM5-201ENST00000317555 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.66■■■■■ 4.42
PGAM5-201ENST00000317555 MADDQ8WXG6 1647 aa42.65■■■■■ 4.42
PGAM5-201ENST00000317555 ATP10AO60312 1499 aa42.65■■■■■ 4.42
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PGAM5-201ENST00000317555 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.64■■■■■ 4.42
PGAM5-201ENST00000317555 PTPRMP28827 1452 aa42.62■■■■■ 4.41
PGAM5-201ENST00000317555 VPS8Q8N3P4 1428 aa42.62■■■■■ 4.41
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PGAM5-201ENST00000317555 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.6■■■■■ 4.41
PGAM5-201ENST00000317555 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.59■■■■■ 4.41
PGAM5-201ENST00000317555 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.56■■■■■ 4.4
PGAM5-201ENST00000317555 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.56■■■■■ 4.4
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PGAM5-201ENST00000317555 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.53■■■■■ 4.4
PGAM5-201ENST00000317555 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.52■■■■■ 4.4
PGAM5-201ENST00000317555 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.52■■■■■ 4.4
PGAM5-201ENST00000317555 ABCA6Q8N139 1617 aa42.49■■■■■ 4.39
PGAM5-201ENST00000317555 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.49■■■■■ 4.39
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PGAM5-201ENST00000317555 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.45■■■■■ 4.39
PGAM5-201ENST00000317555 REREQ9P2R6 1566 aa42.44■■■■■ 4.39
PGAM5-201ENST00000317555 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.44■■■■■ 4.38
PGAM5-201ENST00000317555 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.44■■■■■ 4.38
PGAM5-201ENST00000317555 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.43■■■■■ 4.38
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PGAM5-201ENST00000317555 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.34■■■■■ 4.37
PGAM5-201ENST00000317555 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa42.34■■■■■ 4.37
PGAM5-201ENST00000317555 MAP3K1Q13233 1512 aa42.33■■■■■ 4.37
PGAM5-201ENST00000317555 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
PGAM5-201ENST00000317555 AGLP35573 1532 aa42.29■■■■■ 4.36
PGAM5-201ENST00000317555 ATP7AQ04656 1500 aa42.28■■■■■ 4.36
PGAM5-201ENST00000317555 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.27■■■■■ 4.36
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PGAM5-201ENST00000317555 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.1■■■■■ 4.33
PGAM5-201ENST00000317555 A2MP01023 1474 aa42.09■■■■■ 4.33
PGAM5-201ENST00000317555 PLXNC1O60486 1568 aa42.09■■■■■ 4.33
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PGAM5-201ENST00000317555 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.07■■■■■ 4.33
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PGAM5-201ENST00000317555 MIA2Q96PC5 1412 aa41.96■■■■■ 4.31
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PGAM5-201ENST00000317555 MROH2AA6NES4 1674 aa41.9■■■■■ 4.3
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PGAM5-201ENST00000317555 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.8■■■■■ 4.28
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PGAM5-201ENST00000317555 NPATQ14207 1427 aa41.7■■■■■ 4.27
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PGAM5-201ENST00000317555 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.64■■■■■ 4.26
PGAM5-201ENST00000317555 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.62■■■■■ 4.25
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PGAM5-201ENST00000317555 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.6■■■■■ 4.25
PGAM5-201ENST00000317555 ABCC5O15440 1437 aa41.59■■■■■ 4.25
PGAM5-201ENST00000317555 PTPRKQ15262 1439 aa41.59■■■■■ 4.25
PGAM5-201ENST00000317555 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.59■■■■■ 4.25
PGAM5-201ENST00000317555 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.58■■■■■ 4.25
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