RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317040.11

MVB12A-201, Transcript of multivesicular body subunit 12A, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MVB12A, Length 2,223 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12A-201ENST00000317040 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.34■■□□□ 1.81
MVB12A-201ENST00000317040 KIAA0556O60303 1618 aa26.31■■□□□ 1.8
MVB12A-201ENST00000317040 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
MVB12A-201ENST00000317040 ZBED9Q6R2W3 1325 aa26.31■■□□□ 1.8
MVB12A-201ENST00000317040 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
MVB12A-201ENST00000317040 SAMD9Q5K651 1589 aa26.29■■□□□ 1.8
MVB12A-201ENST00000317040 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.27■■□□□ 1.8
MVB12A-201ENST00000317040 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.27■■□□□ 1.8
MVB12A-201ENST00000317040 NAIPQ13075 1403 aa26.27■■□□□ 1.8
MVB12A-201ENST00000317040 PTPRGP23470 1445 aa26.25■■□□□ 1.79
MVB12A-201ENST00000317040 FMN1Q68DA7 1419 aa26.25■■□□□ 1.79
MVB12A-201ENST00000317040 HECW1Q76N89 1606 aa26.24■■□□□ 1.79
MVB12A-201ENST00000317040 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.23■■□□□ 1.79
MVB12A-201ENST00000317040 PTPRKQ15262 1439 aa26.2■■□□□ 1.78
MVB12A-201ENST00000317040 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
MVB12A-201ENST00000317040 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
MVB12A-201ENST00000317040 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.18■■□□□ 1.78
MVB12A-201ENST00000317040 NCOA1Q15788 1441 aa26.18■■□□□ 1.78
MVB12A-201ENST00000317040 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.17■■□□□ 1.78
MVB12A-201ENST00000317040 AKNAQ7Z591 1439 aa26.16■■□□□ 1.78
MVB12A-201ENST00000317040 MYOM3Q5VTT5 1437 aa26.15■■□□□ 1.78
MVB12A-201ENST00000317040 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
MVB12A-201ENST00000317040 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
MVB12A-201ENST00000317040 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.13■■□□□ 1.77
MVB12A-201ENST00000317040 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
MVB12A-201ENST00000317040 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC7Q96M83 1385 aa26.11■■□□□ 1.77
MVB12A-201ENST00000317040 RNF123Q5XPI4 1314 aa26.09■■□□□ 1.77
MVB12A-201ENST00000317040 MTUS2Q5JR59 1369 aa26.09■■□□□ 1.77
MVB12A-201ENST00000317040 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.09■■□□□ 1.77
MVB12A-201ENST00000317040 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.08■■□□□ 1.77
MVB12A-201ENST00000317040 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
MVB12A-201ENST00000317040 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
MVB12A-201ENST00000317040 MRS2Q9HD23 443 aa26.05■■□□□ 1.76
MVB12A-201ENST00000317040 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC184Q52MB2 194 aa26.03■■□□□ 1.76
MVB12A-201ENST00000317040 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
MVB12A-201ENST00000317040 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
MVB12A-201ENST00000317040 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
MVB12A-201ENST00000317040 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.01■■□□□ 1.75
MVB12A-201ENST00000317040 ABCA8O94911 1581 aa26.01■■□□□ 1.75
MVB12A-201ENST00000317040 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa26■■□□□ 1.75
MVB12A-201ENST00000317040 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.99■■□□□ 1.75
MVB12A-201ENST00000317040 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa25.98■■□□□ 1.75
MVB12A-201ENST00000317040 ABCC2Q92887 1545 aa25.98■■□□□ 1.75
MVB12A-201ENST00000317040 FAM9BQ8IZU0 186 aa25.98■■□□□ 1.75
MVB12A-201ENST00000317040 NBR1Q14596 966 aa25.96■■□□□ 1.75
MVB12A-201ENST00000317040 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.75
MVB12A-201ENST00000317040 NUDCQ9Y266 331 aa25.95■■□□□ 1.74
MVB12A-201ENST00000317040 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.94■■□□□ 1.74
MVB12A-201ENST00000317040 ARID3CA6NKF2 412 aa25.94■■□□□ 1.74
MVB12A-201ENST00000317040 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.93■■□□□ 1.74
MVB12A-201ENST00000317040 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
MVB12A-201ENST00000317040 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
MVB12A-201ENST00000317040 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.9■■□□□ 1.74
MVB12A-201ENST00000317040 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
MVB12A-201ENST00000317040 USP35Q9P2H5 1018 aa25.88■■□□□ 1.73
MVB12A-201ENST00000317040 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
MVB12A-201ENST00000317040 MIA2Q96PC5 1412 aa25.87■■□□□ 1.73
MVB12A-201ENST00000317040 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.87■■□□□ 1.73
MVB12A-201ENST00000317040 ATP10BO94823 1461 aa25.85■■□□□ 1.73
MVB12A-201ENST00000317040 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.85■■□□□ 1.73
MVB12A-201ENST00000317040 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.84■■□□□ 1.73
MVB12A-201ENST00000317040 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.82■■□□□ 1.72
MVB12A-201ENST00000317040 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
MVB12A-201ENST00000317040 KDM6BO15054 1643 aa25.8■■□□□ 1.72
MVB12A-201ENST00000317040 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
MVB12A-201ENST00000317040 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
MVB12A-201ENST00000317040 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
MVB12A-201ENST00000317040 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.79■■□□□ 1.72
MVB12A-201ENST00000317040 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
MVB12A-201ENST00000317040 ROCK1Q13464 1354 aa25.75■■□□□ 1.71
MVB12A-201ENST00000317040 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
MVB12A-201ENST00000317040 ASXL2Q76L83 1435 aa25.73■■□□□ 1.71
MVB12A-201ENST00000317040 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa25.73■■□□□ 1.71
MVB12A-201ENST00000317040 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.73■■□□□ 1.71
MVB12A-201ENST00000317040 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.71■■□□□ 1.71
MVB12A-201ENST00000317040 MS4A1P11836 297 aa25.7■■□□□ 1.7
MVB12A-201ENST00000317040 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.7
MVB12A-201ENST00000317040 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.7■■□□□ 1.7
MVB12A-201ENST00000317040 PLEKHD1A6NEE1 506 aa25.69■■□□□ 1.7
MVB12A-201ENST00000317040 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
MVB12A-201ENST00000317040 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
MVB12A-201ENST00000317040 MBD5Q9P267 1494 aa25.67■■□□□ 1.7
MVB12A-201ENST00000317040 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
MVB12A-201ENST00000317040 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.65■■□□□ 1.7
MVB12A-201ENST00000317040 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
MVB12A-201ENST00000317040 KIF14Q15058 1648 aa25.63■■□□□ 1.69
MVB12A-201ENST00000317040 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
MVB12A-201ENST00000317040 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
MVB12A-201ENST00000317040 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.6■■□□□ 1.69
MVB12A-201ENST00000317040 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
MVB12A-201ENST00000317040 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.59■■□□□ 1.69
MVB12A-201ENST00000317040 KDM5CP41229 1560 aa25.58■■□□□ 1.69
MVB12A-201ENST00000317040 ABCC10Q5T3U5 1492 aa25.58■■□□□ 1.69
MVB12A-201ENST00000317040 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.57■■□□□ 1.68
MVB12A-201ENST00000317040 IL27Q8NEV9 243 aa25.57■■□□□ 1.68
MVB12A-201ENST00000317040 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
MVB12A-201ENST00000317040 RRP1P56182 461 aaKnown RBP25.57■■□□□ 1.68
MVB12A-201ENST00000317040 BACH2Q9BYV9 841 aa25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms