RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 YEATS2Q9ULM3 1422 aa32.14■■■□□ 2.74
CXCL3-201ENST00000296026 MAGI2Q86UL8 1455 aa32.12■■■□□ 2.73
CXCL3-201ENST00000296026 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa32.12■■■□□ 2.73
CXCL3-201ENST00000296026 POGZQ7Z3K3 1410 aa32.11■■■□□ 2.73
CXCL3-201ENST00000296026 CLIP1P30622 1438 aa32.09■■■□□ 2.73
CXCL3-201ENST00000296026 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
CXCL3-201ENST00000296026 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP32.06■■■□□ 2.72
CXCL3-201ENST00000296026 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa32.06■■■□□ 2.72
CXCL3-201ENST00000296026 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP32.05■■■□□ 2.72
CXCL3-201ENST00000296026 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa32.04■■■□□ 2.72
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGAP5Q13017 1502 aa32.03■■■□□ 2.72
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC18Q5T9S5 1454 aa32■■■□□ 2.71
CXCL3-201ENST00000296026 MLECQ14165 292 aa31.96■■■□□ 2.71
CXCL3-201ENST00000296026 ATP10AO60312 1499 aa31.96■■■□□ 2.71
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa31.95■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa31.94■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 C9orf84Q5VXU9 1444 aa31.92■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 AFAP1Q8N556 730 aa31.92■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 LMTK3Q96Q04 1460 aa31.91■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 PLPPR3Q6T4P5 718 aa31.91■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 FYCO1Q9BQS8 1478 aa31.91■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 KDM5CP41229 1560 aa31.9■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 PREX2Q70Z35 1606 aa31.89■■■□□ 2.7
CXCL3-201ENST00000296026 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa31.89■■■□□ 2.69
CXCL3-201ENST00000296026 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.85■■■□□ 2.69
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa31.83■■■□□ 2.69
CXCL3-201ENST00000296026 ABCC1P33527 1531 aa31.81■■■□□ 2.68
CXCL3-201ENST00000296026 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa31.8■■■□□ 2.68
CXCL3-201ENST00000296026 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa31.79■■■□□ 2.68
CXCL3-201ENST00000296026 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa31.78■■■□□ 2.68
CXCL3-201ENST00000296026 MLH3Q9UHC1 1453 aa31.78■■■□□ 2.68
CXCL3-201ENST00000296026 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.77■■■□□ 2.68
CXCL3-201ENST00000296026 HSPA2P54652 639 aa31.76■■■□□ 2.67
CXCL3-201ENST00000296026 ABCA6Q8N139 1617 aa31.75■■■□□ 2.67
CXCL3-201ENST00000296026 REREQ9P2R6 1566 aa31.73■■■□□ 2.67
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP31.7■■■□□ 2.67
CXCL3-201ENST00000296026 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
CXCL3-201ENST00000296026 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP31.68■■■□□ 2.66
CXCL3-201ENST00000296026 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa31.66■■■□□ 2.66
CXCL3-201ENST00000296026 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa31.66■■■□□ 2.66
CXCL3-201ENST00000296026 AGLP35573 1532 aa31.64■■■□□ 2.66
CXCL3-201ENST00000296026 FBXO41Q8TF61 875 aa31.62■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 SYCP2Q9BX26 1530 aa31.62■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 PREX1Q8TCU6 1659 aa31.61■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 MTUS2Q5JR59 1369 aa31.61■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 CCNB3Q8WWL7 1395 aa31.59■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP31.58■■■□□ 2.65
CXCL3-201ENST00000296026 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP31.55■■■□□ 2.64
CXCL3-201ENST00000296026 CEP162Q5TB80 1403 aa31.55■■■□□ 2.64
CXCL3-201ENST00000296026 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP31.54■■■□□ 2.64
CXCL3-201ENST00000296026 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa31.54■■■□□ 2.64
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa31.53■■■□□ 2.64
CXCL3-201ENST00000296026 C3P01024 1663 aa31.52■■■□□ 2.64
CXCL3-201ENST00000296026 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa31.5■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa31.49■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 ATP7AQ04656 1500 aa31.49■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP31.48■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 TIAM1Q13009 1591 aa31.47■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP31.46■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.45■■■□□ 2.63
CXCL3-201ENST00000296026 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP31.44■■■□□ 2.62
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.42■■■□□ 2.62
CXCL3-201ENST00000296026 A2MP01023 1474 aa31.39■■■□□ 2.62
CXCL3-201ENST00000296026 STRCQ7RTU9 1775 aa31.38■■■□□ 2.61
CXCL3-201ENST00000296026 PLXNC1O60486 1568 aa31.38■■■□□ 2.61
CXCL3-201ENST00000296026 MROH2AA6NES4 1674 aa31.36■■■□□ 2.61
CXCL3-201ENST00000296026 MBD5Q9P267 1494 aa31.35■■■□□ 2.61
CXCL3-201ENST00000296026 CERKQ8TCT0 537 aa31.35■■■□□ 2.61
CXCL3-201ENST00000296026 DMRT2Q9Y5R5 561 aa31.35■■■□□ 2.61
CXCL3-201ENST00000296026 ZMYM3Q14202 1370 aa31.32■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 ADGBQ8N7X0 1667 aa31.32■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 NCOA2Q15596 1464 aa31.31■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa31.29■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 NPATQ14207 1427 aa31.29■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 GGT6Q6P531 493 aa31.28■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa31.26■■■□□ 2.6
CXCL3-201ENST00000296026 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.23■■■□□ 2.59
CXCL3-201ENST00000296026 VPS8Q8N3P4 1428 aa31.23■■■□□ 2.59
CXCL3-201ENST00000296026 PTPRTO14522 1441 aa31.22■■■□□ 2.59
CXCL3-201ENST00000296026 CCDC141Q6ZP82 1450 aa31.21■■■□□ 2.59
CXCL3-201ENST00000296026 PPP6R1Q9UPN7 881 aa31.19■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 NCOA1Q15788 1441 aa31.18■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 RSPH4AQ5TD94 716 aa31.17■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 PTPRKQ15262 1439 aa31.16■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa31.15■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa31.15■■■□□ 2.58
CXCL3-201ENST00000296026 MYO3AQ8NEV4 1616 aa31.13■■■□□ 2.57
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP31.1■■■□□ 2.57
CXCL3-201ENST00000296026 ARHGEF5Q12774 1597 aa31.1■■■□□ 2.57
CXCL3-201ENST00000296026 KIF3BO15066 747 aa31.1■■■□□ 2.57
CXCL3-201ENST00000296026 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP31.08■■■□□ 2.57
CXCL3-201ENST00000296026 TSPY4P0CV99 314 aa31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-201ENST00000296026 TSPY10P0CW01 314 aa31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-201ENST00000296026 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-201ENST00000296026 MAP3K1Q13233 1512 aa31.06■■■□□ 2.56
CXCL3-201ENST00000296026 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa31.04■■■□□ 2.56
CXCL3-201ENST00000296026 LTBP4Q8N2S1 1624 aa31.02■■■□□ 2.56
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