RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 KIF3BO15066 747 aa26.13■■□□□ 1.77
USP25-202ENST00000285681 RGS3P49796 1198 aa26.11■■□□□ 1.77
USP25-202ENST00000285681 PPP4R2Q9NY27 417 aa26.1■■□□□ 1.77
USP25-202ENST00000285681 ANP32EQ9BTT0 268 aa26.09■■□□□ 1.77
USP25-202ENST00000285681 JPH4Q96JJ6 628 aa26.09■■□□□ 1.77
USP25-202ENST00000285681 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa26.09■■□□□ 1.77
USP25-202ENST00000285681 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.07■■□□□ 1.762e-6■■■■□ 25
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USP25-202ENST00000285681 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
USP25-202ENST00000285681 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
USP25-202ENST00000285681 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
USP25-202ENST00000285681 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa26.04■■□□□ 1.76
USP25-202ENST00000285681 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
USP25-202ENST00000285681 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP26.03■■□□□ 1.76
USP25-202ENST00000285681 FHOD3Q2V2M9 1422 aa26.03■■□□□ 1.76
USP25-202ENST00000285681 WIZO95785 1651 aa26.02■■□□□ 1.76
USP25-202ENST00000285681 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.02■■□□□ 1.76
USP25-202ENST00000285681 CCER2I3L3R5 266 aa26■■□□□ 1.75
USP25-202ENST00000285681 GOLGA2Q08379 1002 aa26■■□□□ 1.75
USP25-202ENST00000285681 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.98■■□□□ 1.75
USP25-202ENST00000285681 CCDC18Q5T9S5 1454 aa25.97■■□□□ 1.75
USP25-202ENST00000285681 FGD1P98174 961 aa25.97■■□□□ 1.75
USP25-202ENST00000285681 KCNJ4P48050 445 aa25.97■■□□□ 1.75
USP25-202ENST00000285681 EID1Q9Y6B2 187 aa25.96■■□□□ 1.75
USP25-202ENST00000285681 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
USP25-202ENST00000285681 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa25.94■■□□□ 1.74
USP25-202ENST00000285681 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.94■■□□□ 1.74
USP25-202ENST00000285681 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
USP25-202ENST00000285681 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
USP25-202ENST00000285681 TPRNQ4KMQ1 711 aa25.9■■□□□ 1.74
USP25-202ENST00000285681 RALBP1Q15311 655 aa25.9■■□□□ 1.74
USP25-202ENST00000285681 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP25.89■■□□□ 1.74
USP25-202ENST00000285681 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.88■■□□□ 1.73
USP25-202ENST00000285681 TERF2IPQ9NYB0 399 aa25.88■■□□□ 1.73
USP25-202ENST00000285681 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.87■■□□□ 1.73
USP25-202ENST00000285681 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
USP25-202ENST00000285681 TAOK2Q9UL54 1235 aa25.86■■□□□ 1.73
USP25-202ENST00000285681 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.86■■□□□ 1.73
USP25-202ENST00000285681 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
USP25-202ENST00000285681 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
USP25-202ENST00000285681 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
USP25-202ENST00000285681 PTPRGP23470 1445 aa25.82■■□□□ 1.72
USP25-202ENST00000285681 PTMAP06454 111 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
USP25-202ENST00000285681 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
USP25-202ENST00000285681 SMARCA4P51532 1647 aa25.79■■□□□ 1.72
USP25-202ENST00000285681 CHMP4AQ9BY43 222 aa25.78■■□□□ 1.72
USP25-202ENST00000285681 CYB5RLQ6IPT4 315 aa25.77■■□□□ 1.72
USP25-202ENST00000285681 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
USP25-202ENST00000285681 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
USP25-202ENST00000285681 OSCARQ8IYS5 282 aa25.75■■□□□ 1.71
USP25-202ENST00000285681 MCCP23508 829 aa25.75■■□□□ 1.71
USP25-202ENST00000285681 CFAP44Q96MT7 982 aa25.74■■□□□ 1.71
USP25-202ENST00000285681 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
USP25-202ENST00000285681 TRAK1Q9UPV9 953 aa25.71■■□□□ 1.71
USP25-202ENST00000285681 APBB1O00213 710 aa25.71■■□□□ 1.71
USP25-202ENST00000285681 HSCBQ8IWL3 235 aa25.71■■□□□ 1.71
USP25-202ENST00000285681 STK31Q9BXU1 1019 aa25.71■■□□□ 1.71
USP25-202ENST00000285681 RCAN3Q9UKA8 241 aa25.7■■□□□ 1.7
USP25-202ENST00000285681 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa25.68■■□□□ 1.7
USP25-202ENST00000285681 NUTM2FA1L443 756 aa25.68■■□□□ 1.7
USP25-202ENST00000285681 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.68■■□□□ 1.7
USP25-202ENST00000285681 AMPHP49418 695 aa25.68■■□□□ 1.7
USP25-202ENST00000285681 ITPRIPQ8IWB1 547 aa25.68■■□□□ 1.7
USP25-202ENST00000285681 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa25.65■■□□□ 1.7
USP25-202ENST00000285681 NLRP13Q86W25 1043 aa25.65■■□□□ 1.7
USP25-202ENST00000285681 PLCB2Q00722 1185 aa25.65■■□□□ 1.7
USP25-202ENST00000285681 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.7
USP25-202ENST00000285681 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 VGFO15240 615 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.62■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 UACAQ9BZF9 1416 aa25.61■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 LMOD3Q0VAK6 560 aa25.6■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP25.6■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP25.6■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 SMC4Q9NTJ3 1288 aa25.6■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.6■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.59■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.59■■□□□ 1.69
USP25-202ENST00000285681 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.58■■□□□ 1.68
USP25-202ENST00000285681 CCDC146Q8IYE0 955 aa25.56■■□□□ 1.68
USP25-202ENST00000285681 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa25.55■■□□□ 1.68
USP25-202ENST00000285681 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
USP25-202ENST00000285681 FGD5Q6ZNL6 1462 aa25.54■■□□□ 1.68
USP25-202ENST00000285681 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.54■■□□□ 1.68
USP25-202ENST00000285681 GORABQ5T7V8 394 aa25.52■■□□□ 1.68
USP25-202ENST00000285681 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.52■■□□□ 1.68
USP25-202ENST00000285681 IGF1RP08069 1367 aa25.52■■□□□ 1.68
USP25-202ENST00000285681 HMMRO75330 724 aa25.51■■□□□ 1.68
USP25-202ENST00000285681 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.51■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.51■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 NRDCO43847 1150 aa25.5■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa25.5■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 EVC2Q86UK5 1308 aa25.5■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 PANK3Q9H999 370 aa25.5■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 SLC4A10Q6U841 1118 aa25.5■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 PDE3BQ13370 1112 aa25.49■■□□□ 1.67
USP25-202ENST00000285681 KIF15Q9NS87 1388 aa25.49■■□□□ 1.67
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