RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000279387.11

PPP4C-201, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP4C, Length 1,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4C-201ENST00000279387 PREX2Q70Z35 1606 aa38.43■■■■□ 3.74
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PPP4C-201ENST00000279387 SCAPERQ9BY12 1400 aa38.39■■■■□ 3.74
PPP4C-201ENST00000279387 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa38.38■■■■□ 3.74
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PPP4C-201ENST00000279387 POGZQ7Z3K3 1410 aa38.27■■■■□ 3.72
PPP4C-201ENST00000279387 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa38.27■■■■□ 3.72
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PPP4C-201ENST00000279387 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa38.2■■■■□ 3.71
PPP4C-201ENST00000279387 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa38.2■■■■□ 3.71
PPP4C-201ENST00000279387 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa38.2■■■■□ 3.71
PPP4C-201ENST00000279387 NCOA2Q15596 1464 aa38.19■■■■□ 3.7
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PPP4C-201ENST00000279387 ITSN2Q9NZM3 1697 aa38.18■■■■□ 3.7
PPP4C-201ENST00000279387 YEATS2Q9ULM3 1422 aa38.18■■■■□ 3.7
PPP4C-201ENST00000279387 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa38.15■■■■□ 3.7
PPP4C-201ENST00000279387 MAP3K1Q13233 1512 aa38.14■■■■□ 3.7
PPP4C-201ENST00000279387 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa38.14■■■■□ 3.7
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PPP4C-201ENST00000279387 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP38.09■■■■□ 3.69
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PPP4C-201ENST00000279387 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.04■■■■□ 3.68
PPP4C-201ENST00000279387 HECW2Q9P2P5 1572 aa38.03■■■■□ 3.68
PPP4C-201ENST00000279387 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.96■■■■□ 3.67
PPP4C-201ENST00000279387 ABCA6Q8N139 1617 aa37.94■■■■□ 3.66
PPP4C-201ENST00000279387 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.93■■■■□ 3.66
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PPP4C-201ENST00000279387 BCORL1Q5H9F3 1711 aa37.92■■■■□ 3.66
PPP4C-201ENST00000279387 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa37.92■■■■□ 3.66
PPP4C-201ENST00000279387 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa37.92■■■■□ 3.66
PPP4C-201ENST00000279387 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.91■■■■□ 3.66
PPP4C-201ENST00000279387 MLH3Q9UHC1 1453 aa37.91■■■■□ 3.66
PPP4C-201ENST00000279387 C9orf84Q5VXU9 1444 aa37.88■■■■□ 3.65
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PPP4C-201ENST00000279387 ADAMTSL3P82987 1691 aa37.86■■■■□ 3.65
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PPP4C-201ENST00000279387 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.84■■■■□ 3.65
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PPP4C-201ENST00000279387 ATP7AQ04656 1500 aa37.8■■■■□ 3.64
PPP4C-201ENST00000279387 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP37.79■■■■□ 3.64
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PPP4C-201ENST00000279387 PTPRMP28827 1452 aa37.67■■■■□ 3.62
PPP4C-201ENST00000279387 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.67■■■■□ 3.62
PPP4C-201ENST00000279387 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa37.67■■■■□ 3.62
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PPP4C-201ENST00000279387 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.63■■■■□ 3.61
PPP4C-201ENST00000279387 A2MP01023 1474 aa37.6■■■■□ 3.61
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PPP4C-201ENST00000279387 AGLP35573 1532 aa37.59■■■■□ 3.61
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PPP4C-201ENST00000279387 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa37.58■■■■□ 3.61
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PPP4C-201ENST00000279387 ABCC5O15440 1437 aa37.46■■■■□ 3.59
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PPP4C-201ENST00000279387 SHANK2Q9UPX8 1470 aa37.33■■■■□ 3.57
PPP4C-201ENST00000279387 C3P01024 1663 aa37.33■■■■□ 3.57
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PPP4C-201ENST00000279387 MROH2AA6NES4 1674 aa37.21■■■■□ 3.55
PPP4C-201ENST00000279387 LMTK3Q96Q04 1460 aa37.19■■■■□ 3.54
PPP4C-201ENST00000279387 ZMYM3Q14202 1370 aa37.19■■■■□ 3.54
PPP4C-201ENST00000279387 ITGAEP38570 1179 aa37.19■■■■□ 3.54
PPP4C-201ENST00000279387 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.17■■■■□ 3.54
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