RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272139.4

C1orf35-201, Transcript of chromosome 1 open reading frame 35, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene C1orf35, Length 1,427 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf35-201ENST00000272139 FANCAO15360 1455 aa35.51■■■■□ 3.27
C1orf35-201ENST00000272139 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa35.51■■■■□ 3.27
C1orf35-201ENST00000272139 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
C1orf35-201ENST00000272139 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa35.47■■■■□ 3.27
C1orf35-201ENST00000272139 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa35.46■■■■□ 3.27
C1orf35-201ENST00000272139 PREX2Q70Z35 1606 aa35.45■■■■□ 3.27
C1orf35-201ENST00000272139 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP35.45■■■■□ 3.27
C1orf35-201ENST00000272139 AKNAQ7Z591 1439 aa35.45■■■■□ 3.27
C1orf35-201ENST00000272139 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa35.43■■■■□ 3.26
C1orf35-201ENST00000272139 ITSN2Q9NZM3 1697 aa35.43■■■■□ 3.26
C1orf35-201ENST00000272139 ARHGAP5Q13017 1502 aa35.43■■■■□ 3.26
C1orf35-201ENST00000272139 RAPGEF3O95398 923 aa35.41■■■■□ 3.26
C1orf35-201ENST00000272139 ADGRL1O94910 1474 aa35.41■■■■□ 3.26
C1orf35-201ENST00000272139 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
C1orf35-201ENST00000272139 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP35.4■■■■□ 3.26
C1orf35-201ENST00000272139 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa35.38■■■■□ 3.25
C1orf35-201ENST00000272139 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP35.33■■■■□ 3.25
C1orf35-201ENST00000272139 RICTORQ6R327 1708 aa35.32■■■■□ 3.24
C1orf35-201ENST00000272139 MYOM3Q5VTT5 1437 aa35.32■■■■□ 3.24
C1orf35-201ENST00000272139 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa35.24■■■■□ 3.23
C1orf35-201ENST00000272139 MIA2Q96PC5 1412 aa35.24■■■■□ 3.23
C1orf35-201ENST00000272139 SCAPERQ9BY12 1400 aa35.24■■■■□ 3.23
C1orf35-201ENST00000272139 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa35.22■■■■□ 3.23
C1orf35-201ENST00000272139 POGZQ7Z3K3 1410 aa35.22■■■■□ 3.23
C1orf35-201ENST00000272139 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa35.22■■■■□ 3.23
C1orf35-201ENST00000272139 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP35.2■■■■□ 3.22
C1orf35-201ENST00000272139 MAGI2Q86UL8 1455 aa35.19■■■■□ 3.22
C1orf35-201ENST00000272139 FGD6Q6ZV73 1430 aa35.18■■■■□ 3.22
C1orf35-201ENST00000272139 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa35.17■■■■□ 3.22
C1orf35-201ENST00000272139 ABCC1P33527 1531 aa35.15■■■■□ 3.22
C1orf35-201ENST00000272139 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa35.14■■■■□ 3.22
C1orf35-201ENST00000272139 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa35.14■■■■□ 3.22
C1orf35-201ENST00000272139 PTPN23Q9H3S7 1636 aa35.13■■■■□ 3.21
C1orf35-201ENST00000272139 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa35.12■■■■□ 3.21
C1orf35-201ENST00000272139 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP35.12■■■■□ 3.21
C1orf35-201ENST00000272139 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa35.11■■■■□ 3.21
C1orf35-201ENST00000272139 SYCP2Q9BX26 1530 aa35.1■■■■□ 3.21
C1orf35-201ENST00000272139 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa35.09■■■■□ 3.21
C1orf35-201ENST00000272139 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
C1orf35-201ENST00000272139 YEATS2Q9ULM3 1422 aa35.04■■■■□ 3.2
C1orf35-201ENST00000272139 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
C1orf35-201ENST00000272139 AFAP1Q8N556 730 aa35.04■■■■□ 3.2
C1orf35-201ENST00000272139 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP35.04■■■■□ 3.2
C1orf35-201ENST00000272139 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa35.02■■■■□ 3.2
C1orf35-201ENST00000272139 KDM5CP41229 1560 aa35.02■■■■□ 3.2
C1orf35-201ENST00000272139 RSPH4AQ5TD94 716 aa35.02■■■■□ 3.2
C1orf35-201ENST00000272139 MBD5Q9P267 1494 aa35.01■■■■□ 3.2
C1orf35-201ENST00000272139 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35■■■■□ 3.19
C1orf35-201ENST00000272139 ADAMTSL3P82987 1691 aa35■■■■□ 3.19
C1orf35-201ENST00000272139 ARHGEF5Q12774 1597 aa34.96■■■■□ 3.19
C1orf35-201ENST00000272139 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP34.95■■■■□ 3.19
C1orf35-201ENST00000272139 HECW2Q9P2P5 1572 aa34.95■■■■□ 3.19
C1orf35-201ENST00000272139 ATP10AO60312 1499 aa34.94■■■■□ 3.18
C1orf35-201ENST00000272139 MYT1LQ9UL68 1186 aa34.94■■■■□ 3.18
C1orf35-201ENST00000272139 CCDC141Q6ZP82 1450 aa34.94■■■■□ 3.18
C1orf35-201ENST00000272139 C9orf84Q5VXU9 1444 aa34.92■■■■□ 3.18
C1orf35-201ENST00000272139 TSPY4P0CV99 314 aa34.91■■■■□ 3.18
C1orf35-201ENST00000272139 TSPY10P0CW01 314 aa34.91■■■■□ 3.18
C1orf35-201ENST00000272139 MLH3Q9UHC1 1453 aa34.9■■■■□ 3.18
C1orf35-201ENST00000272139 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP34.9■■■■□ 3.18
C1orf35-201ENST00000272139 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP34.9■■■■□ 3.18
C1orf35-201ENST00000272139 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP34.88■■■■□ 3.17
C1orf35-201ENST00000272139 MADDQ8WXG6 1647 aa34.88■■■■□ 3.17
C1orf35-201ENST00000272139 PTPRMP28827 1452 aa34.87■■■■□ 3.17
C1orf35-201ENST00000272139 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.85■■■■□ 3.17
C1orf35-201ENST00000272139 DAPK1P53355 1430 aa34.85■■■■□ 3.17
C1orf35-201ENST00000272139 ABCC5O15440 1437 aa34.84■■■■□ 3.17
C1orf35-201ENST00000272139 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.82■■■■□ 3.17
C1orf35-201ENST00000272139 CROCC2H7BZ55 1655 aa34.81■■■■□ 3.16
C1orf35-201ENST00000272139 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa34.81■■■■□ 3.16
C1orf35-201ENST00000272139 REREQ9P2R6 1566 aa34.8■■■■□ 3.16
C1orf35-201ENST00000272139 ATP7AQ04656 1500 aa34.79■■■■□ 3.16
C1orf35-201ENST00000272139 ITGAEP38570 1179 aa34.79■■■■□ 3.16
C1orf35-201ENST00000272139 ABCA6Q8N139 1617 aa34.79■■■■□ 3.16
C1orf35-201ENST00000272139 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa34.78■■■■□ 3.16
C1orf35-201ENST00000272139 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP34.77■■■■□ 3.16
C1orf35-201ENST00000272139 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP34.75■■■■□ 3.15
C1orf35-201ENST00000272139 MAST1Q9Y2H9 1570 aa34.75■■■■□ 3.15
C1orf35-201ENST00000272139 SHANK2Q9UPX8 1470 aa34.75■■■■□ 3.15
C1orf35-201ENST00000272139 CHIC2Q9UKJ5 165 aa34.73■■■■□ 3.15
C1orf35-201ENST00000272139 MLECQ14165 292 aa34.72■■■■□ 3.15
C1orf35-201ENST00000272139 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa34.69■■■■□ 3.14
C1orf35-201ENST00000272139 AGLP35573 1532 aa34.67■■■■□ 3.14
C1orf35-201ENST00000272139 PTPRKQ15262 1439 aa34.66■■■■□ 3.14
C1orf35-201ENST00000272139 ADGBQ8N7X0 1667 aa34.65■■■■□ 3.14
C1orf35-201ENST00000272139 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa34.64■■■■□ 3.14
C1orf35-201ENST00000272139 PLXNC1O60486 1568 aa34.62■■■■□ 3.13
C1orf35-201ENST00000272139 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa34.61■■■■□ 3.13
C1orf35-201ENST00000272139 ADGRL2O95490 1459 aa34.59■■■■□ 3.13
C1orf35-201ENST00000272139 NCOA1Q15788 1441 aa34.59■■■■□ 3.13
C1orf35-201ENST00000272139 A2MP01023 1474 aa34.57■■■■□ 3.12
C1orf35-201ENST00000272139 ROCK1Q13464 1354 aa34.56■■■■□ 3.12
C1orf35-201ENST00000272139 KIF15Q9NS87 1388 aa34.56■■■■□ 3.12
C1orf35-201ENST00000272139 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.55■■■■□ 3.12
C1orf35-201ENST00000272139 DUOX2Q9NRD8 1548 aa34.52■■■■□ 3.12
C1orf35-201ENST00000272139 PLPPR3Q6T4P5 718 aa34.49■■■■□ 3.11
C1orf35-201ENST00000272139 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP34.49■■■■□ 3.11
C1orf35-201ENST00000272139 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP34.47■■■■□ 3.11
C1orf35-201ENST00000272139 LMTK3Q96Q04 1460 aa34.45■■■■□ 3.11
C1orf35-201ENST00000272139 CNTLNQ9NXG0 1405 aa34.43■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.6 ms