RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271843.8

JTB-201, Transcript of jumping translocation breakpoint, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene JTB, Length 1,287 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JTB-201ENST00000271843 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.89■■□□□ 1.74
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JTB-201ENST00000271843 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.88■■□□□ 1.73
JTB-201ENST00000271843 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.88■■□□□ 1.73
JTB-201ENST00000271843 PREX2Q70Z35 1606 aa25.86■■□□□ 1.73
JTB-201ENST00000271843 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa25.83■■□□□ 1.73
JTB-201ENST00000271843 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.83■■□□□ 1.73
JTB-201ENST00000271843 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.81■■□□□ 1.72
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JTB-201ENST00000271843 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.8■■□□□ 1.72
JTB-201ENST00000271843 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.8■■□□□ 1.72
JTB-201ENST00000271843 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.78■■□□□ 1.72
JTB-201ENST00000271843 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.77■■□□□ 1.72
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JTB-201ENST00000271843 MTUS2Q5JR59 1369 aa25.72■■□□□ 1.71
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JTB-201ENST00000271843 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.71■■□□□ 1.71
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JTB-201ENST00000271843 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.7■■□□□ 1.71
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JTB-201ENST00000271843 PTPRMP28827 1452 aa25.66■■□□□ 1.7
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JTB-201ENST00000271843 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.64■■□□□ 1.69
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JTB-201ENST00000271843 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
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JTB-201ENST00000271843 A2MP01023 1474 aa25.34■■□□□ 1.65
JTB-201ENST00000271843 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.33■■□□□ 1.65
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JTB-201ENST00000271843 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.29■■□□□ 1.64
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JTB-201ENST00000271843 MIA2Q96PC5 1412 aa25.26■■□□□ 1.63
JTB-201ENST00000271843 HSPA2P54652 639 aa25.24■■□□□ 1.63
JTB-201ENST00000271843 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.23■■□□□ 1.63
JTB-201ENST00000271843 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.22■■□□□ 1.63
JTB-201ENST00000271843 APLP2Q06481 763 aa25.22■■□□□ 1.63
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JTB-201ENST00000271843 TSPY10P0CW01 314 aa25.14■■□□□ 1.62
JTB-201ENST00000271843 FGD6Q6ZV73 1430 aa25.12■■□□□ 1.61
JTB-201ENST00000271843 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.12■■□□□ 1.61
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JTB-201ENST00000271843 KIF3BO15066 747 aa25.1■■□□□ 1.61
JTB-201ENST00000271843 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.09■■□□□ 1.61
JTB-201ENST00000271843 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.09■■□□□ 1.61
JTB-201ENST00000271843 ABCC5O15440 1437 aa25.09■■□□□ 1.61
JTB-201ENST00000271843 NPATQ14207 1427 aa25.09■■□□□ 1.61
JTB-201ENST00000271843 PTPRKQ15262 1439 aa25.06■■□□□ 1.6
JTB-201ENST00000271843 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
JTB-201ENST00000271843 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.05■■□□□ 1.6
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