RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258781.10

CCM2-201, Transcript of CCM2 scaffold protein, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCM2, Length 1,894 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCM2-201ENST00000258781 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP40.9■■■■■ 4.14
CCM2-201ENST00000258781 PTPRKQ15262 1439 aa40.86■■■■■ 4.13
CCM2-201ENST00000258781 PREX2Q70Z35 1606 aa40.84■■■■■ 4.13
CCM2-201ENST00000258781 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.84■■■■■ 4.13
CCM2-201ENST00000258781 HFM1A2PYH4 1435 aa40.83■■■■■ 4.13
CCM2-201ENST00000258781 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP40.81■■■■■ 4.12
CCM2-201ENST00000258781 MYO5CQ9NQX4 1742 aa40.81■■■■■ 4.12
CCM2-201ENST00000258781 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
CCM2-201ENST00000258781 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.76■■■■■ 4.12
CCM2-201ENST00000258781 MAPKBP1O60336 1514 aa40.73■■■■■ 4.11
CCM2-201ENST00000258781 ABCA9Q8IUA7 1624 aa40.72■■■■■ 4.11
CCM2-201ENST00000258781 AKNAQ7Z591 1439 aa40.71■■■■■ 4.11
CCM2-201ENST00000258781 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP40.69■■■■■ 4.1
CCM2-201ENST00000258781 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.69■■■■■ 4.1
CCM2-201ENST00000258781 NAIPQ13075 1403 aa40.69■■■■■ 4.1
CCM2-201ENST00000258781 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
CCM2-201ENST00000258781 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.66■■■■■ 4.1
CCM2-201ENST00000258781 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa40.65■■■■■ 4.1
CCM2-201ENST00000258781 PLCH2O75038 1416 aa40.64■■■■■ 4.1
CCM2-201ENST00000258781 DAPK1P53355 1430 aa40.58■■■■■ 4.09
CCM2-201ENST00000258781 ABCC5O15440 1437 aa40.56■■■■■ 4.08
CCM2-201ENST00000258781 ARAP3Q8WWN8 1544 aa40.55■■■■■ 4.08
CCM2-201ENST00000258781 CROCC2H7BZ55 1655 aa40.52■■■■■ 4.08
CCM2-201ENST00000258781 ROCK1Q13464 1354 aa40.51■■■■■ 4.08
CCM2-201ENST00000258781 SYCP2Q9BX26 1530 aa40.47■■■■■ 4.07
CCM2-201ENST00000258781 MBD5Q9P267 1494 aa40.47■■■■■ 4.07
CCM2-201ENST00000258781 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.46■■■■■ 4.07
CCM2-201ENST00000258781 ARHGEF5Q12774 1597 aa40.45■■■■■ 4.07
CCM2-201ENST00000258781 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP40.43■■■■■ 4.062e-6■■■□□ 15.7
CCM2-201ENST00000258781 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.43■■■■■ 4.06
CCM2-201ENST00000258781 FANCAO15360 1455 aa40.41■■■■■ 4.06
CCM2-201ENST00000258781 ABCC1P33527 1531 aa40.41■■■■■ 4.06
CCM2-201ENST00000258781 DIP2BQ9P265 1576 aa40.41■■■■■ 4.06
CCM2-201ENST00000258781 ADGBQ8N7X0 1667 aa40.41■■■■■ 4.06
CCM2-201ENST00000258781 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa40.41■■■■■ 4.06
CCM2-201ENST00000258781 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa40.4■■■■■ 4.06
CCM2-201ENST00000258781 CD109Q6YHK3 1445 aa40.4■■■■■ 4.06
CCM2-201ENST00000258781 GLI2P10070 1586 aa40.38■■■■■ 4.06
CCM2-201ENST00000258781 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa40.38■■■■■ 4.05
CCM2-201ENST00000258781 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa40.37■■■■■ 4.05
CCM2-201ENST00000258781 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa40.37■■■■■ 4.05
CCM2-201ENST00000258781 CCDC141Q6ZP82 1450 aa40.35■■■■■ 4.05
CCM2-201ENST00000258781 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP40.34■■■■■ 4.05
CCM2-201ENST00000258781 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.34■■■■■ 4.05
CCM2-201ENST00000258781 KDM6BO15054 1643 aa40.34■■■■■ 4.05
CCM2-201ENST00000258781 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP40.33■■■■■ 4.05
CCM2-201ENST00000258781 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.33■■■■■ 4.05
CCM2-201ENST00000258781 ADGRL2O95490 1459 aa40.3■■■■■ 4.04
CCM2-201ENST00000258781 C9orf84Q5VXU9 1444 aa40.28■■■■■ 4.04
CCM2-201ENST00000258781 KIF13AQ9H1H9 1805 aa40.24■■■■■ 4.03
CCM2-201ENST00000258781 FAM69CQ0P6D2 419 aa40.24■■■■■ 4.03
CCM2-201ENST00000258781 NCOA1Q15788 1441 aa40.23■■■■■ 4.03
CCM2-201ENST00000258781 CFAP74Q9C0B2 1584 aa40.23■■■■■ 4.03
CCM2-201ENST00000258781 ADGRL1O94910 1474 aa40.23■■■■■ 4.03
CCM2-201ENST00000258781 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa40.23■■■■■ 4.03
CCM2-201ENST00000258781 RSPH4AQ5TD94 716 aa40.22■■■■■ 4.03
CCM2-201ENST00000258781 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.22■■■■■ 4.03
CCM2-201ENST00000258781 TSPY4P0CV99 314 aa40.19■■■■■ 4.03
CCM2-201ENST00000258781 TSPY10P0CW01 314 aa40.19■■■■■ 4.03
CCM2-201ENST00000258781 MAST1Q9Y2H9 1570 aa40.19■■■■■ 4.02
CCM2-201ENST00000258781 TSPOAP1O95153 1857 aa40.15■■■■■ 4.02
CCM2-201ENST00000258781 SCAPERQ9BY12 1400 aa40.15■■■■■ 4.02
CCM2-201ENST00000258781 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.15■■■■■ 4.02
CCM2-201ENST00000258781 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.15■■■■■ 4.02
CCM2-201ENST00000258781 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP40.13■■■■■ 4.01
CCM2-201ENST00000258781 NEO1Q92859 1461 aa40.11■■■■■ 4.01
CCM2-201ENST00000258781 AFAP1Q8N556 730 aa40.09■■■■■ 4.01
CCM2-201ENST00000258781 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP40.08■■■■■ 4.01
CCM2-201ENST00000258781 NEUROD1Q13562 356 aa40.07■■■■■ 4.01
CCM2-201ENST00000258781 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP40.07■■■■■ 4.01
CCM2-201ENST00000258781 TRIM52Q96A61 297 aa40.07■■■■■ 4.01
CCM2-201ENST00000258781 PLXNC1O60486 1568 aa40.05■■■■■ 4
CCM2-201ENST00000258781 KIF15Q9NS87 1388 aa40.03■■■■■ 4
CCM2-201ENST00000258781 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa40.02■■■■■ 4
CCM2-201ENST00000258781 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.99■■■■□ 3.99
CCM2-201ENST00000258781 MPHOSPH9Q99550 1183 aa39.98■■■■□ 3.99
CCM2-201ENST00000258781 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.98■■■■□ 3.99
CCM2-201ENST00000258781 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.98■■■■□ 3.99
CCM2-201ENST00000258781 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.97■■■■□ 3.99
CCM2-201ENST00000258781 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
CCM2-201ENST00000258781 KDM5CP41229 1560 aa39.94■■■■□ 3.98
CCM2-201ENST00000258781 ATP7AQ04656 1500 aa39.94■■■■□ 3.98
CCM2-201ENST00000258781 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.94■■■■□ 3.98
CCM2-201ENST00000258781 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.92■■■■□ 3.98
CCM2-201ENST00000258781 TONSLQ96HA7 1378 aa39.91■■■■□ 3.98
CCM2-201ENST00000258781 RICTORQ6R327 1708 aa39.9■■■■□ 3.98
CCM2-201ENST00000258781 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.89■■■■□ 3.98
CCM2-201ENST00000258781 PZPP20742 1482 aa39.86■■■■□ 3.97
CCM2-201ENST00000258781 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.85■■■■□ 3.97
CCM2-201ENST00000258781 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.85■■■■□ 3.97
CCM2-201ENST00000258781 RAPGEF3O95398 923 aa39.83■■■■□ 3.97
CCM2-201ENST00000258781 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.82■■■■□ 3.97
CCM2-201ENST00000258781 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.82■■■■□ 3.96
CCM2-201ENST00000258781 KDM5DQ9BY66 1539 aa39.78■■■■□ 3.96
CCM2-201ENST00000258781 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.78■■■■□ 3.96
CCM2-201ENST00000258781 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP39.77■■■■□ 3.96
CCM2-201ENST00000258781 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa39.76■■■■□ 3.96
CCM2-201ENST00000258781 ERBINQ96RT1 1412 aa39.75■■■■□ 3.95
CCM2-201ENST00000258781 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.75■■■■□ 3.95
CCM2-201ENST00000258781 ABCA6Q8N139 1617 aa39.7■■■■□ 3.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms