RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000252813.5

PGPEP1-201, Transcript of pyroglutamyl-peptidase I, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PGPEP1, Length 1,409 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1-201ENST00000252813 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.04■■□□□ 1.44
PGPEP1-201ENST00000252813 ADGRL1O94910 1474 aa24.03■■□□□ 1.44
PGPEP1-201ENST00000252813 MAP3K1Q13233 1512 aa24.03■■□□□ 1.44
PGPEP1-201ENST00000252813 AFAP1Q8N556 730 aa24.02■■□□□ 1.44
PGPEP1-201ENST00000252813 TIAM1Q13009 1591 aa24.02■■□□□ 1.44
PGPEP1-201ENST00000252813 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.01■■□□□ 1.43
PGPEP1-201ENST00000252813 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa24.01■■□□□ 1.43
PGPEP1-201ENST00000252813 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24■■□□□ 1.43
PGPEP1-201ENST00000252813 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24■■□□□ 1.43
PGPEP1-201ENST00000252813 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.97■■□□□ 1.43
PGPEP1-201ENST00000252813 NCOA2Q15596 1464 aa23.95■■□□□ 1.42
PGPEP1-201ENST00000252813 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa23.95■■□□□ 1.42
PGPEP1-201ENST00000252813 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PGPEP1-201ENST00000252813 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa23.94■■□□□ 1.42
PGPEP1-201ENST00000252813 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.94■■□□□ 1.42
PGPEP1-201ENST00000252813 PREX2Q70Z35 1606 aa23.92■■□□□ 1.42
PGPEP1-201ENST00000252813 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.92■■□□□ 1.42
PGPEP1-201ENST00000252813 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.92■■□□□ 1.42
PGPEP1-201ENST00000252813 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.91■■□□□ 1.42
PGPEP1-201ENST00000252813 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa23.9■■□□□ 1.42
PGPEP1-201ENST00000252813 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.9■■□□□ 1.42
PGPEP1-201ENST00000252813 MAGI2Q86UL8 1455 aa23.88■■□□□ 1.41
PGPEP1-201ENST00000252813 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
PGPEP1-201ENST00000252813 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.88■■□□□ 1.41
PGPEP1-201ENST00000252813 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.88■■□□□ 1.41
PGPEP1-201ENST00000252813 RICTORQ6R327 1708 aa23.87■■□□□ 1.41
PGPEP1-201ENST00000252813 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP23.86■■□□□ 1.41
PGPEP1-201ENST00000252813 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.86■■□□□ 1.41
PGPEP1-201ENST00000252813 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.86■■□□□ 1.41
PGPEP1-201ENST00000252813 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.84■■□□□ 1.41
PGPEP1-201ENST00000252813 ABCC1P33527 1531 aa23.83■■□□□ 1.41
PGPEP1-201ENST00000252813 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.83■■□□□ 1.4
PGPEP1-201ENST00000252813 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.82■■□□□ 1.4
PGPEP1-201ENST00000252813 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.81■■□□□ 1.4
PGPEP1-201ENST00000252813 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.81■■□□□ 1.4
PGPEP1-201ENST00000252813 MLH3Q9UHC1 1453 aa23.8■■□□□ 1.4
PGPEP1-201ENST00000252813 ATP10AO60312 1499 aa23.79■■□□□ 1.4
PGPEP1-201ENST00000252813 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.79■■□□□ 1.4
PGPEP1-201ENST00000252813 MBD5Q9P267 1494 aa23.77■■□□□ 1.4
PGPEP1-201ENST00000252813 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.77■■□□□ 1.4
PGPEP1-201ENST00000252813 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.77■■□□□ 1.4
PGPEP1-201ENST00000252813 KDM5CP41229 1560 aa23.76■■□□□ 1.39
PGPEP1-201ENST00000252813 MIA2Q96PC5 1412 aa23.76■■□□□ 1.39
PGPEP1-201ENST00000252813 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
PGPEP1-201ENST00000252813 ITSN2Q9NZM3 1697 aa23.74■■□□□ 1.39
PGPEP1-201ENST00000252813 TSPY4P0CV99 314 aa23.73■■□□□ 1.39
PGPEP1-201ENST00000252813 TSPY10P0CW01 314 aa23.73■■□□□ 1.39
PGPEP1-201ENST00000252813 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa23.73■■□□□ 1.39
PGPEP1-201ENST00000252813 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.71■■□□□ 1.39
PGPEP1-201ENST00000252813 MLECQ14165 292 aa23.71■■□□□ 1.39
PGPEP1-201ENST00000252813 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23.7■■□□□ 1.38
PGPEP1-201ENST00000252813 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.67■■□□□ 1.38
PGPEP1-201ENST00000252813 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa23.65■■□□□ 1.38
PGPEP1-201ENST00000252813 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.64■■□□□ 1.37
PGPEP1-201ENST00000252813 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.64■■□□□ 1.37
PGPEP1-201ENST00000252813 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.62■■□□□ 1.37
PGPEP1-201ENST00000252813 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.62■■□□□ 1.37
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PGPEP1-201ENST00000252813 ATP7AQ04656 1500 aa23.59■■□□□ 1.37
PGPEP1-201ENST00000252813 ABCA6Q8N139 1617 aa23.58■■□□□ 1.37
PGPEP1-201ENST00000252813 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.58■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 A2MP01023 1474 aa23.57■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.56■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 REREQ9P2R6 1566 aa23.55■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 ABCC5O15440 1437 aa23.55■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.55■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.55■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 AGLP35573 1532 aa23.54■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.54■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 GGT6Q6P531 493 aa23.52■■□□□ 1.36
PGPEP1-201ENST00000252813 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
PGPEP1-201ENST00000252813 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.51■■□□□ 1.35
PGPEP1-201ENST00000252813 PTPRMP28827 1452 aa23.51■■□□□ 1.35
PGPEP1-201ENST00000252813 KIF3BO15066 747 aa23.5■■□□□ 1.35
PGPEP1-201ENST00000252813 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.5■■□□□ 1.35
PGPEP1-201ENST00000252813 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.5■■□□□ 1.35
PGPEP1-201ENST00000252813 DAPK1P53355 1430 aa23.48■■□□□ 1.35
PGPEP1-201ENST00000252813 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
PGPEP1-201ENST00000252813 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.47■■□□□ 1.35
PGPEP1-201ENST00000252813 MADDQ8WXG6 1647 aa23.46■■□□□ 1.35
PGPEP1-201ENST00000252813 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.43■■□□□ 1.34
PGPEP1-201ENST00000252813 PLXNC1O60486 1568 aa23.42■■□□□ 1.34
PGPEP1-201ENST00000252813 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.4■■□□□ 1.34
PGPEP1-201ENST00000252813 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.4■■□□□ 1.34
PGPEP1-201ENST00000252813 ITGAEP38570 1179 aa23.4■■□□□ 1.34
PGPEP1-201ENST00000252813 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
PGPEP1-201ENST00000252813 KIF15Q9NS87 1388 aa23.4■■□□□ 1.34
PGPEP1-201ENST00000252813 ADGBQ8N7X0 1667 aa23.39■■□□□ 1.34
PGPEP1-201ENST00000252813 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PGPEP1-201ENST00000252813 NCOA1Q15788 1441 aa23.38■■□□□ 1.33
PGPEP1-201ENST00000252813 ZMYM3Q14202 1370 aa23.37■■□□□ 1.33
PGPEP1-201ENST00000252813 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.37■■□□□ 1.33
PGPEP1-201ENST00000252813 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
PGPEP1-201ENST00000252813 PTPRKQ15262 1439 aa23.36■■□□□ 1.33
PGPEP1-201ENST00000252813 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.36■■□□□ 1.33
PGPEP1-201ENST00000252813 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.33■■□□□ 1.33
PGPEP1-201ENST00000252813 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
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