RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229390.7

SRSF9-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF9, Length 1,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9-201ENST00000229390 CEP162Q5TB80 1403 aa42.49■■■■■ 4.39
SRSF9-201ENST00000229390 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.46■■■■■ 4.39
SRSF9-201ENST00000229390 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.46■■■■■ 4.39
SRSF9-201ENST00000229390 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.46■■■■■ 4.39
SRSF9-201ENST00000229390 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa42.45■■■■■ 4.39
SRSF9-201ENST00000229390 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.43■■■■■ 4.38
SRSF9-201ENST00000229390 YEATS2Q9ULM3 1422 aa42.42■■■■■ 4.38
SRSF9-201ENST00000229390 ADAMTSL3P82987 1691 aa42.38■■■■■ 4.38
SRSF9-201ENST00000229390 BCORL1Q5H9F3 1711 aa42.38■■■■■ 4.38
SRSF9-201ENST00000229390 PREX2Q70Z35 1606 aa42.38■■■■■ 4.37
SRSF9-201ENST00000229390 MAGI2Q86UL8 1455 aa42.36■■■■■ 4.37
SRSF9-201ENST00000229390 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa42.34■■■■■ 4.37
SRSF9-201ENST00000229390 AFAP1Q8N556 730 aa42.32■■■■■ 4.37
SRSF9-201ENST00000229390 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.3■■■■■ 4.36
SRSF9-201ENST00000229390 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.29■■■■■ 4.36
SRSF9-201ENST00000229390 MADDQ8WXG6 1647 aa42.28■■■■■ 4.36
SRSF9-201ENST00000229390 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa42.27■■■■■ 4.36
SRSF9-201ENST00000229390 MTUS2Q5JR59 1369 aa42.26■■■■■ 4.35
SRSF9-201ENST00000229390 PTPRMP28827 1452 aa42.25■■■■■ 4.35
SRSF9-201ENST00000229390 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.25■■■■■ 4.35
SRSF9-201ENST00000229390 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.22■■■■■ 4.35
SRSF9-201ENST00000229390 MLECQ14165 292 aa42.21■■■■■ 4.35
SRSF9-201ENST00000229390 ATP10AO60312 1499 aa42.2■■■■■ 4.35
SRSF9-201ENST00000229390 ABCC1P33527 1531 aa42.2■■■■■ 4.35
SRSF9-201ENST00000229390 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.19■■■■■ 4.34
SRSF9-201ENST00000229390 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.19■■■■■ 4.34
SRSF9-201ENST00000229390 KDM5CP41229 1560 aa42.18■■■■■ 4.34
SRSF9-201ENST00000229390 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP42.18■■■■■ 4.34
SRSF9-201ENST00000229390 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.17■■■■■ 4.34
SRSF9-201ENST00000229390 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.16■■■■■ 4.34
SRSF9-201ENST00000229390 CCNB3Q8WWL7 1395 aa42.14■■■■■ 4.34
SRSF9-201ENST00000229390 C9orf84Q5VXU9 1444 aa42.13■■■■■ 4.34
SRSF9-201ENST00000229390 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.1■■■■■ 4.33
SRSF9-201ENST00000229390 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
SRSF9-201ENST00000229390 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.1■■■■■ 4.33
SRSF9-201ENST00000229390 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa42.08■■■■■ 4.33
SRSF9-201ENST00000229390 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.04■■■■■ 4.32
SRSF9-201ENST00000229390 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.04■■■■■ 4.32
SRSF9-201ENST00000229390 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa42.04■■■■■ 4.32
SRSF9-201ENST00000229390 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.03■■■■■ 4.32
SRSF9-201ENST00000229390 ABCA6Q8N139 1617 aa42.02■■■■■ 4.32
SRSF9-201ENST00000229390 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.01■■■■■ 4.32
SRSF9-201ENST00000229390 VPS8Q8N3P4 1428 aa41.99■■■■■ 4.31
SRSF9-201ENST00000229390 TIAM1Q13009 1591 aa41.97■■■■■ 4.31
SRSF9-201ENST00000229390 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.96■■■■■ 4.31
SRSF9-201ENST00000229390 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa41.92■■■■■ 4.3
SRSF9-201ENST00000229390 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.9■■■■■ 4.3
SRSF9-201ENST00000229390 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP41.9■■■■■ 4.3
SRSF9-201ENST00000229390 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP41.89■■■■■ 4.3
SRSF9-201ENST00000229390 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa41.89■■■■■ 4.3
SRSF9-201ENST00000229390 REREQ9P2R6 1566 aa41.88■■■■■ 4.29
SRSF9-201ENST00000229390 NCOA2Q15596 1464 aa41.85■■■■■ 4.29
SRSF9-201ENST00000229390 ATP7AQ04656 1500 aa41.78■■■■■ 4.28
SRSF9-201ENST00000229390 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP41.77■■■■■ 4.28
SRSF9-201ENST00000229390 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa41.77■■■■■ 4.28
SRSF9-201ENST00000229390 AGLP35573 1532 aa41.76■■■■■ 4.28
SRSF9-201ENST00000229390 LMTK3Q96Q04 1460 aa41.75■■■■■ 4.27
SRSF9-201ENST00000229390 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.73■■■■■ 4.27
SRSF9-201ENST00000229390 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
SRSF9-201ENST00000229390 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP41.72■■■■■ 4.27
SRSF9-201ENST00000229390 MBD5Q9P267 1494 aa41.69■■■■■ 4.26
SRSF9-201ENST00000229390 HSPA2P54652 639 aa41.66■■■■■ 4.26
SRSF9-201ENST00000229390 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa41.66■■■■■ 4.26
SRSF9-201ENST00000229390 MAP3K1Q13233 1512 aa41.64■■■■■ 4.26
SRSF9-201ENST00000229390 A2MP01023 1474 aa41.61■■■■■ 4.25
SRSF9-201ENST00000229390 APLP2Q06481 763 aa41.6■■■■■ 4.25
SRSF9-201ENST00000229390 C3P01024 1663 aa41.57■■■■■ 4.25
SRSF9-201ENST00000229390 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.57■■■■■ 4.25
SRSF9-201ENST00000229390 CCDC141Q6ZP82 1450 aa41.55■■■■■ 4.24
SRSF9-201ENST00000229390 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.55■■■■■ 4.24
SRSF9-201ENST00000229390 PLXNC1O60486 1568 aa41.54■■■■■ 4.24
SRSF9-201ENST00000229390 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.52■■■■■ 4.24
SRSF9-201ENST00000229390 RSPH4AQ5TD94 716 aa41.5■■■■■ 4.23
SRSF9-201ENST00000229390 GGT6Q6P531 493 aa41.5■■■■■ 4.23
SRSF9-201ENST00000229390 CNTLNQ9NXG0 1405 aa41.48■■■■■ 4.23
SRSF9-201ENST00000229390 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.46■■■■■ 4.23
SRSF9-201ENST00000229390 ARHGEF5Q12774 1597 aa41.44■■■■■ 4.22
SRSF9-201ENST00000229390 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.44■■■■■ 4.22
SRSF9-201ENST00000229390 TSPY4P0CV99 314 aa41.43■■■■■ 4.22
SRSF9-201ENST00000229390 TSPY10P0CW01 314 aa41.43■■■■■ 4.22
SRSF9-201ENST00000229390 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP41.42■■■■■ 4.22
SRSF9-201ENST00000229390 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.41■■■■■ 4.22
SRSF9-201ENST00000229390 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
SRSF9-201ENST00000229390 MROH2AA6NES4 1674 aa41.39■■■■■ 4.22
SRSF9-201ENST00000229390 ZMYM3Q14202 1370 aa41.37■■■■■ 4.21
SRSF9-201ENST00000229390 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.36■■■■■ 4.21
SRSF9-201ENST00000229390 MIA2Q96PC5 1412 aa41.35■■■■■ 4.21
SRSF9-201ENST00000229390 KIF3BO15066 747 aa41.33■■■■■ 4.21
SRSF9-201ENST00000229390 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.26■■■■■ 4.2
SRSF9-201ENST00000229390 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.21■■■■■ 4.19
SRSF9-201ENST00000229390 NPATQ14207 1427 aa41.21■■■■■ 4.19
SRSF9-201ENST00000229390 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.21■■■■■ 4.19
SRSF9-201ENST00000229390 STRCQ7RTU9 1775 aa41.17■■■■■ 4.18
SRSF9-201ENST00000229390 PTPRKQ15262 1439 aa41.15■■■■■ 4.18
SRSF9-201ENST00000229390 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.12■■■■■ 4.17
SRSF9-201ENST00000229390 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.12■■■■■ 4.17
SRSF9-201ENST00000229390 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.08■■■■■ 4.17
SRSF9-201ENST00000229390 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.08■■■■■ 4.17
SRSF9-201ENST00000229390 ABCC5O15440 1437 aa41.07■■■■■ 4.16
SRSF9-201ENST00000229390 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.07■■■■■ 4.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.6 ms