RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000215941.8

ANKRD54-201, Transcript of ankyrin repeat domain 54, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD54, Length 2,184 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54-201ENST00000215941 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP31.72■■■□□ 2.67
ANKRD54-201ENST00000215941 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.71■■■□□ 2.67
ANKRD54-201ENST00000215941 FANCIQ9NVI1 1328 aa31.7■■■□□ 2.67
ANKRD54-201ENST00000215941 AKNAQ7Z591 1439 aa31.69■■■□□ 2.66
ANKRD54-201ENST00000215941 MIA2Q96PC5 1412 aa31.67■■■□□ 2.66
ANKRD54-201ENST00000215941 PLB1Q6P1J6 1458 aa31.65■■■□□ 2.66
ANKRD54-201ENST00000215941 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP31.65■■■□□ 2.66
ANKRD54-201ENST00000215941 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP31.61■■■□□ 2.65
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ANKRD54-201ENST00000215941 CNTLNQ9NXG0 1405 aa31.55■■■□□ 2.64
ANKRD54-201ENST00000215941 WASHC2AQ641Q2 1341 aa31.54■■■□□ 2.64
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ANKRD54-201ENST00000215941 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP31.52■■■□□ 2.64
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCA8O94911 1581 aa31.51■■■□□ 2.63
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ANKRD54-201ENST00000215941 CHIC2Q9UKJ5 165 aa31.49■■■□□ 2.63
ANKRD54-201ENST00000215941 PPP4R2Q9NY27 417 aa31.47■■■□□ 2.63
ANKRD54-201ENST00000215941 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP31.47■■■□□ 2.63
ANKRD54-201ENST00000215941 MSH5O43196 834 aa31.46■■■□□ 2.63
ANKRD54-201ENST00000215941 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa31.46■■■□□ 2.63
ANKRD54-201ENST00000215941 ADCY10Q96PN6 1610 aa31.45■■■□□ 2.62
ANKRD54-201ENST00000215941 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP31.44■■■□□ 2.62
ANKRD54-201ENST00000215941 NCOA1Q15788 1441 aa31.43■■■□□ 2.62
ANKRD54-201ENST00000215941 MYT1LQ9UL68 1186 aa31.4■■■□□ 2.62
ANKRD54-201ENST00000215941 KIF14Q15058 1648 aa31.4■■■□□ 2.62
ANKRD54-201ENST00000215941 ITSN2Q9NZM3 1697 aa31.4■■■□□ 2.62
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ANKRD54-201ENST00000215941 DAPK1P53355 1430 aa31.39■■■□□ 2.62
ANKRD54-201ENST00000215941 PTPRGP23470 1445 aa31.38■■■□□ 2.61
ANKRD54-201ENST00000215941 ATP10BO94823 1461 aa31.37■■■□□ 2.61
ANKRD54-201ENST00000215941 ZBED9Q6R2W3 1325 aa31.36■■■□□ 2.61
ANKRD54-201ENST00000215941 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP31.36■■■□□ 2.61
ANKRD54-201ENST00000215941 CCDC7Q96M83 1385 aa31.35■■■□□ 2.61
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCC5O15440 1437 aa31.34■■■□□ 2.61
ANKRD54-201ENST00000215941 SHROOM2Q13796 1616 aa31.34■■■□□ 2.61
ANKRD54-201ENST00000215941 PLEKHD1A6NEE1 506 aa31.34■■■□□ 2.61
ANKRD54-201ENST00000215941 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP31.34■■■□□ 2.61
ANKRD54-201ENST00000215941 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP31.33■■■□□ 2.61
ANKRD54-201ENST00000215941 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP31.32■■■□□ 2.6
ANKRD54-201ENST00000215941 KDM6BO15054 1643 aa31.32■■■□□ 2.6
ANKRD54-201ENST00000215941 ROCK1Q13464 1354 aa31.32■■■□□ 2.6
ANKRD54-201ENST00000215941 ERICH6Q7L0X2 663 aa31.32■■■□□ 2.6
ANKRD54-201ENST00000215941 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa31.3■■■□□ 2.6
ANKRD54-201ENST00000215941 MPHOSPH9Q99550 1183 aa31.29■■■□□ 2.6
ANKRD54-201ENST00000215941 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.29■■■□□ 2.6
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ANKRD54-201ENST00000215941 TEX14Q8IWB6 1497 aa31.22■■■□□ 2.59
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCC10Q5T3U5 1492 aa31.21■■■□□ 2.59
ANKRD54-201ENST00000215941 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa31.21■■■□□ 2.59
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa31.21■■■□□ 2.59
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ANKRD54-201ENST00000215941 CROCC2H7BZ55 1655 aa31.14■■■□□ 2.58
ANKRD54-201ENST00000215941 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
ANKRD54-201ENST00000215941 CLASP1Q7Z460 1538 aa31.12■■■□□ 2.57
ANKRD54-201ENST00000215941 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
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ANKRD54-201ENST00000215941 KIF7Q2M1P5 1343 aa31.08■■■□□ 2.57
ANKRD54-201ENST00000215941 ADGRL2O95490 1459 aa31.08■■■□□ 2.57
ANKRD54-201ENST00000215941 ABCC2Q92887 1545 aa31.06■■■□□ 2.56
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ANKRD54-201ENST00000215941 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa31.02■■■□□ 2.56
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ANKRD54-201ENST00000215941 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa31.01■■■□□ 2.55
ANKRD54-201ENST00000215941 MBD5Q9P267 1494 aa30.99■■■□□ 2.55
ANKRD54-201ENST00000215941 SHANK2Q9UPX8 1470 aa30.99■■■□□ 2.55
ANKRD54-201ENST00000215941 PREX2Q70Z35 1606 aa30.97■■■□□ 2.55
ANKRD54-201ENST00000215941 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa30.95■■■□□ 2.55
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ANKRD54-201ENST00000215941 NUDCQ9Y266 331 aa30.93■■■□□ 2.54
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ANKRD54-201ENST00000215941 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa30.91■■■□□ 2.54
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ANKRD54-201ENST00000215941 TSPY10P0CW01 314 aa30.9■■■□□ 2.54
ANKRD54-201ENST00000215941 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
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ANKRD54-201ENST00000215941 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP30.89■■■□□ 2.53
ANKRD54-201ENST00000215941 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP30.89■■■□□ 2.53
ANKRD54-201ENST00000215941 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.88■■■□□ 2.53
ANKRD54-201ENST00000215941 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30.88■■■□□ 2.53
ANKRD54-201ENST00000215941 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.86■■■□□ 2.53
ANKRD54-201ENST00000215941 KDM5CP41229 1560 aa30.85■■■□□ 2.53
ANKRD54-201ENST00000215941 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.84■■■□□ 2.53
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ANKRD54-201ENST00000215941 ARHGAP5Q13017 1502 aa30.83■■■□□ 2.53
ANKRD54-201ENST00000215941 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa30.82■■■□□ 2.53
ANKRD54-201ENST00000215941 USP47Q96K76 1375 aa30.82■■■□□ 2.52
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