RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000086933.2

GSC2-201, Transcript of goosecoid homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GSC2, Length 1,033 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2-201ENST00000086933 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.64■■■■■ 4.58
GSC2-201ENST00000086933 PREX2Q70Z35 1606 aa43.63■■■■■ 4.58
GSC2-201ENST00000086933 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.63■■■■■ 4.57
GSC2-201ENST00000086933 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa43.62■■■■■ 4.57
GSC2-201ENST00000086933 MAGI2Q86UL8 1455 aa43.62■■■■■ 4.57
GSC2-201ENST00000086933 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.59■■■■■ 4.57
GSC2-201ENST00000086933 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa43.52■■■■■ 4.56
GSC2-201ENST00000086933 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa43.49■■■■■ 4.55
GSC2-201ENST00000086933 KDM5CP41229 1560 aa43.49■■■■■ 4.55
GSC2-201ENST00000086933 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.47■■■■■ 4.55
GSC2-201ENST00000086933 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP43.47■■■■■ 4.55
GSC2-201ENST00000086933 YEATS2Q9ULM3 1422 aa43.47■■■■■ 4.55
GSC2-201ENST00000086933 ABCC1P33527 1531 aa43.45■■■■■ 4.55
GSC2-201ENST00000086933 ADAMTSL3P82987 1691 aa43.44■■■■■ 4.54
GSC2-201ENST00000086933 VPS8Q8N3P4 1428 aa43.44■■■■■ 4.54
GSC2-201ENST00000086933 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa43.43■■■■■ 4.54
GSC2-201ENST00000086933 MTUS2Q5JR59 1369 aa43.41■■■■■ 4.54
GSC2-201ENST00000086933 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.4■■■■■ 4.54
GSC2-201ENST00000086933 BCORL1Q5H9F3 1711 aa43.39■■■■■ 4.54
GSC2-201ENST00000086933 ITSN2Q9NZM3 1697 aa43.33■■■■■ 4.53
GSC2-201ENST00000086933 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa43.33■■■■■ 4.53
GSC2-201ENST00000086933 MLH3Q9UHC1 1453 aa43.32■■■■■ 4.52
GSC2-201ENST00000086933 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.31■■■■■ 4.52
GSC2-201ENST00000086933 TIAM1Q13009 1591 aa43.3■■■■■ 4.52
GSC2-201ENST00000086933 AFAP1Q8N556 730 aa43.3■■■■■ 4.52
GSC2-201ENST00000086933 ATP10AO60312 1499 aa43.3■■■■■ 4.52
GSC2-201ENST00000086933 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.3■■■■■ 4.52
GSC2-201ENST00000086933 HECW2Q9P2P5 1572 aa43.28■■■■■ 4.52
GSC2-201ENST00000086933 CCNB3Q8WWL7 1395 aa43.27■■■■■ 4.52
GSC2-201ENST00000086933 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.25■■■■■ 4.51
GSC2-201ENST00000086933 MAP3K1Q13233 1512 aa43.25■■■■■ 4.51
GSC2-201ENST00000086933 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.24■■■■■ 4.51
GSC2-201ENST00000086933 REREQ9P2R6 1566 aa43.22■■■■■ 4.51
GSC2-201ENST00000086933 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.2■■■■■ 4.51
GSC2-201ENST00000086933 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa43.2■■■■■ 4.51
GSC2-201ENST00000086933 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP43.19■■■■■ 4.5
GSC2-201ENST00000086933 PTPRMP28827 1452 aa43.19■■■■■ 4.5
GSC2-201ENST00000086933 MADDQ8WXG6 1647 aa43.19■■■■■ 4.5
GSC2-201ENST00000086933 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP43.17■■■■■ 4.5
GSC2-201ENST00000086933 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.17■■■■■ 4.5
GSC2-201ENST00000086933 NCOA2Q15596 1464 aa43.14■■■■■ 4.5
GSC2-201ENST00000086933 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
GSC2-201ENST00000086933 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa43.13■■■■■ 4.5
GSC2-201ENST00000086933 ABCA6Q8N139 1617 aa43.13■■■■■ 4.49
GSC2-201ENST00000086933 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa43.12■■■■■ 4.49
GSC2-201ENST00000086933 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.07■■■■■ 4.49
GSC2-201ENST00000086933 AGLP35573 1532 aa43.05■■■■■ 4.48
GSC2-201ENST00000086933 MBD5Q9P267 1494 aa43.04■■■■■ 4.48
GSC2-201ENST00000086933 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP43.01■■■■■ 4.48
GSC2-201ENST00000086933 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.99■■■■■ 4.47
GSC2-201ENST00000086933 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP42.99■■■■■ 4.47
GSC2-201ENST00000086933 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.96■■■■■ 4.47
GSC2-201ENST00000086933 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP42.94■■■■■ 4.46
GSC2-201ENST00000086933 ATP7AQ04656 1500 aa42.93■■■■■ 4.46
GSC2-201ENST00000086933 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP42.93■■■■■ 4.46
GSC2-201ENST00000086933 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa42.92■■■■■ 4.46
GSC2-201ENST00000086933 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.87■■■■■ 4.45
GSC2-201ENST00000086933 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.86■■■■■ 4.45
GSC2-201ENST00000086933 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.85■■■■■ 4.45
GSC2-201ENST00000086933 PLXNC1O60486 1568 aa42.85■■■■■ 4.45
GSC2-201ENST00000086933 MLECQ14165 292 aa42.83■■■■■ 4.45
GSC2-201ENST00000086933 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.79■■■■■ 4.44
GSC2-201ENST00000086933 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.79■■■■■ 4.44
GSC2-201ENST00000086933 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.78■■■■■ 4.44
GSC2-201ENST00000086933 MIA2Q96PC5 1412 aa42.78■■■■■ 4.44
GSC2-201ENST00000086933 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.76■■■■■ 4.44
GSC2-201ENST00000086933 A2MP01023 1474 aa42.74■■■■■ 4.43
GSC2-201ENST00000086933 LMTK3Q96Q04 1460 aa42.73■■■■■ 4.43
GSC2-201ENST00000086933 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.72■■■■■ 4.43
GSC2-201ENST00000086933 CNTLNQ9NXG0 1405 aa42.63■■■■■ 4.42
GSC2-201ENST00000086933 APLP2Q06481 763 aa42.63■■■■■ 4.41
GSC2-201ENST00000086933 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP42.59■■■■■ 4.41
GSC2-201ENST00000086933 MAST1Q9Y2H9 1570 aa42.59■■■■■ 4.41
GSC2-201ENST00000086933 MROH2AA6NES4 1674 aa42.54■■■■■ 4.4
GSC2-201ENST00000086933 C3P01024 1663 aa42.54■■■■■ 4.4
GSC2-201ENST00000086933 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
GSC2-201ENST00000086933 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP42.5■■■■■ 4.39
GSC2-201ENST00000086933 PPP6R1Q9UPN7 881 aa42.49■■■■■ 4.39
GSC2-201ENST00000086933 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.48■■■■■ 4.39
GSC2-201ENST00000086933 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.47■■■■■ 4.39
GSC2-201ENST00000086933 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.46■■■■■ 4.39
GSC2-201ENST00000086933 TSPY4P0CV99 314 aa42.46■■■■■ 4.39
GSC2-201ENST00000086933 TSPY10P0CW01 314 aa42.46■■■■■ 4.39
GSC2-201ENST00000086933 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.45■■■■■ 4.39
GSC2-201ENST00000086933 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP42.42■■■■■ 4.38
GSC2-201ENST00000086933 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.41■■■■■ 4.38
GSC2-201ENST00000086933 PLPPR3Q6T4P5 718 aa42.4■■■■■ 4.38
GSC2-201ENST00000086933 SHANK2Q9UPX8 1470 aa42.4■■■■■ 4.38
GSC2-201ENST00000086933 NPATQ14207 1427 aa42.38■■■■■ 4.38
GSC2-201ENST00000086933 ZMYM3Q14202 1370 aa42.38■■■■■ 4.37
GSC2-201ENST00000086933 ABCC5O15440 1437 aa42.36■■■■■ 4.37
GSC2-201ENST00000086933 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP42.35■■■■■ 4.37
GSC2-201ENST00000086933 CROCC2H7BZ55 1655 aa42.34■■■■■ 4.37
GSC2-201ENST00000086933 GGT6Q6P531 493 aa42.33■■■■■ 4.37
GSC2-201ENST00000086933 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa42.32■■■■■ 4.37
GSC2-201ENST00000086933 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP42.31■■■■■ 4.36
GSC2-201ENST00000086933 HSPA2P54652 639 aa42.29■■■■■ 4.36
GSC2-201ENST00000086933 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
GSC2-201ENST00000086933 KIF3BO15066 747 aa42.27■■■■■ 4.36
GSC2-201ENST00000086933 DAPK1P53355 1430 aa42.27■■■■■ 4.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms