RNA–Protein interactions for RNA: YLR117C

CLF1, Transcript of Member of the NineTeen Complex (NTC), yeast

Gene CLF1, Length 2,064 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CLF1	YLR117C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YCL049C	P25577	312 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	UBC8	P28263	218 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ATP7	P30902	174 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	COQ2	P32378	372 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YBR241C	P38142	488 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	BIG1	P38813	335 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	COX16	P47081	118 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	AIM14	P53109	570 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	HHO1	P53551	258 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RET3	P53600	189 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	NOG2	P53742	486 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ENA2	Q01896	1091 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	TRE2	Q08693	809 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ENA5	Q12691	1091 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ADE8	P04161	214 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PET54	P10834	293 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PHO8	P11491	566 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	CTS1	P29029	562 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	KRE6	P32486	720 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SFA1	P32771	386 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	FRE1	P32791	686 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ORC2	P32833	620 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ECM8	P38246	354 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YMR262W	P38430	313 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ARN2	P38724	620 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	OSH7	P38755	437 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	NEM1	P38757	446 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YAP1801	P38856	637 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SHU2	P38957	223 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PTC2	P39966	464 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YEL076C	P39971	216 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	AVT2	P39981	480 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MAD2	P40958	196 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MRPS18	P42847	217 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	LSB6	P42951	607 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SEH1	P53011	349 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MRH4	P53166	561 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	DSE4	P53753	1117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	CBK1	P53894	756 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RAD33	Q04231	177 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ARO10	Q06408	635 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	GPN3	Q06543	272 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	CDA2	Q06703	312 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	GRS2	Q06817	618 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ZEO1	Q08245	113 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PUS9	Q12069	462 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	TRM10	Q12400	293 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MOD5	P07884	428 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	AMD2	P22580	549 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	DMC1	P25453	334 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	NDI1	P32340	513 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	APE2	P32454	952 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	NDC1	P32500	655 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MDL2	P33311	773 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MRPL37	P36532	105 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	CHK1	P38147	527 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PHO89	P38361	574 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	BZZ1	P38822	633 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	IPT1	P38954	527 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MNN1	P39106	762 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RMD6	P39975	231 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MXR1	P40029	184 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RFC2	P40348	353 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RRN7	P40992	514 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	RGD2	P43556	714 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YJL043W	P47053	257 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	ECM27	P47144	725 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YML6	P51998	286 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	NOP13	P53883	403 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
CLF1	YLR117C	YNL033W	P53964	284 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YNL019C	P53975	284 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	STP1	Q00947	519 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	SEN54	Q02825	467 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	HSP31	Q04432	237 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	MED1	Q12321	566 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	PAA1	Q12447	191 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
CLF1	YLR117C	CIT1	P00890	479 aa		4.68	□□□□□ -1.66

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